心脏外科成立于1993年，是国内最早开展心脏外科手术的单位之一，现已经成为一个集科教研医疗为一体的比较全面而又富有特点的科室，是首都医科大学教学基地，博士、硕士研究生培养点、首都医科大学心血管研究所心外科研究室。
累计完成各种心脏手术8000余例，擅长微创冠状动脉搭桥、肺动脉血栓内膜剥脱及各种心脏瓣膜、大血管、先心病外科治疗手术，心脏移植术后存活最长一例达12年。近年每年完成心脏手术700余例。
率先在国内开展胸腔镜微创心脏外科手术，微创团队累计完成胸腔镜心脏手术800余例，国内领先；拥有先进的百级手术间、3D胸腔镜、3D心脏彩超、高精心脏微创手术器械。该团队技术一流、设备一流、服务一流，为需要心脏微创手术的患者带来福音。
专业特色：
冠状动脉外科：心脏不停跳冠脉搭桥、腔镜辅助微创冠脉搭桥、腔镜微创获取大隐静脉桥血管手术，冠脉搭桥6000余例，心脏不停跳、微创冠脉搭桥比例90%以上，手术数量及质量均居于国内领先水平，临床效果显著。
腔镜微创心脏手术：切口小，胸壁打孔2-3个；避免锯开胸骨，保持胸廓完整；出血少，90%患者不需要输血，减少各种经血液传播传染病的风险；创伤小，恢复快，住院时间短，3周左右即可重返工作岗位；术后疼痛轻，生活质量显著提高；满足患者美容需求，减少术后心理创伤。适应范围：1.部分冠脉搭桥术2．心脏瓣膜手术（二尖瓣成形或置换、三尖瓣成形等）3.先天性心脏病矫治手术（房间隔缺损、室间隔缺损、心内膜垫缺损、部分性肺静脉异位引流等）4．恢复窦性心律的房颤手术（持续性永久性房颤、顽固性房颤）5.心脏肿瘤切除。
肺栓塞外科：国内率先系统化规范化开展此项工作的单位之一，已完成慢性肺动脉血栓内膜剥脱术100余例，手术死亡率降至10%以下，位于国内领先水平，是。与美国SanDiego医疗中心建立长期合作，建立学术交流和人才培训平台。
瓣膜病外科：累计完成瓣膜手术600余例，长期开展心房纤颤的外科治疗，取得较好成绩。
先天性心脏病外科：完成各种简单及复杂先心病手术200余例，开展小切口、腔镜辅助下微创先心病手术。
心脏移植：完成二例同种异体原位心脏移植手术，其中一例存活15年，并结婚生子。
科研教学：累计发表论文80余篇，承担及作为主要合作单位参与国家级及省部级以上科研课题17项。广泛开展国内外交流及合作，同国内约30家医院开展技术交流。作为首都医科大学博士及硕士生点，培养硕士研究生共计16人，博士研究生5人。
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