女性肥胖，除了带来肥胖的共同危害之外，还有其特殊性。共同危害主要指的是肥胖带来的并发症，如高血压、胰岛素抵抗及糖尿病、脂质异常症、冠心病、肺功能不全、胆石症、痛风等等，以及这些并发症所引起的残废、死亡。
特殊性则是女性的生理特点决定的。肥胖女孩可以出现青春发育提前、过早初潮，以及乳腺发育过早。
对成年女性而言，肥胖可以增加患癌症的机会，女性体内的雌激素是在脂肪组织内产生的。脂肪组织越多，雌激素合成的越多，所以肥胖妇女体内的雌激素水平比普通妇女要高，恰恰是雌激素的水平越高，就越增加患子宫内膜癌和绝经后乳腺癌的危险。所以肥胖妇女患这两种妇科肿瘤的危险性要大得多。雌激素增多还可能导致或加重下肢浮肿。
由于高胰岛素血症可以刺激卵巢产生过多的雄激素，所以体内的游离睾丸酮水平可能比普通女性高，导致女性出现多毛等男性化表现，还可引起月经紊乱甚至闭经、不育。严重的可以表现为多囊卵巢综合征。即使怀了孕，也容易出现过多的妊娠合并症，如妊娠高血压综合征以及妊娠糖尿病，还容易出现胎儿的发育异常以及体位异常，而且容易出现难产。肥胖妇女的腹壁脂肪过厚，给医生的产前检查造成困难。如果需要作剖腹产，手术操作也很不方便。
另外，肥胖女性比男性更容易患骨性关节炎，中年女性更加容易患胆石症，腹部型肥胖的女性更加容易患痛风等等
