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脑血栓形成比较常见的部位是颈内动脉、大脑中动脉、椎动脉和基底动脉。根据解剖上血管供血的分布，就定位症状而言，颈动脉－大脑中动脉系统主要引起大脑半球损害的症状，椎－基底动脉系统主要产生脑干、小脑及枕叶等部位损害的症状。
比较特殊的是，颈内动脉和大脑中动脉血栓形成虽然都以对侧肢体偏瘫为最常见的症状，但颈内动脉血栓形成还可出现同侧眼睛的暂时性失明，这是由于眼动脉来自颈内动脉，失明即是眼动脉缺血的缘故。这种单眼失明的症状一般不持续，主要是因为眼动脉还有其他动脉的侧支循环，随着侧支的建立和代偿，视力便可以恢复。
另外，如果颈内动脉或大脑中动脉完全阻塞，由于脑组织缺血、缺氧而产生脑水肿，造成几乎整个大脑半球的肿胀，严重的可引起昏迷，甚至危及生命。就椎－基底动脉系统来说，如果基底动脉主干血栓形成，其后果同样是严重的。因为脑干不仅是大脑与躯体上下联系的要冲，而且还是呼吸、循环等生命中枢的所在部位，一旦发生广泛的缺血性坏死，不仅会导致昏迷和四肢瘫痪，而且可以很快危及生命。
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