秦汉时期医家们在研究人体生理、病理的过程中，除了做过许多解剖，如五脏、六腑的解剖，大脑、颅底经脉的解剖，眼的解剖，四肢经脉、肌肉的解剖、骨(含脊柱)的解剖等以及在经脉理论形成过程中或以后，医家们大量采用了将人体某些生理、病理现象与天地之自然现象类比方法，进行类比，得出了一些比较接近实际的结论，如风寒淤滞理论等。
在寻找新的人体调节理论中，学者们根据传统文化中的五脏情识论，如心之官则思等，谋求与社会组成类比，寻找一种有君有臣的社会化模式的人体调节理论。
《素问·阴阳应象大论》提出：“论理人形．别列脏腑”，并将五行与五脏相配，从此完成了依五行相生相克胜属性建立了有君(心)有臣(肝、脾、肺、肾)的五行——五脏调节的人体调节理论框架。
《素问·灵兰秘典》以十二经脉为基础，提出十二脏，用膻中代心包讲解以心为君主之官的“十二脏相使”问题，结论说“主不明则十二官危，使道闭塞而不通，形乃大伤”。毫无疑问，五行—五脏调节论引入医学以后，促进了藏象学说的诞生与发展。
心者，君主之官也，神明出焉。
肺者，相傅之官，治节出焉。
肝者，将军之官，谋虑出焉。
胆者，中正之官，决断出焉。
膻中者，臣使之官，喜乐出焉。
脾胃者，仓廪之官，五味出焉。
大肠者，传道之官，变化出焉。
小肠者，受盛之官，化物出焉。
肾者，作强之官，伎巧出焉。
三焦者，决渎之官，水道出焉。
膀胱者，州都之官，津液藏焉，气化则能出矣。
凡此十二官者，不得相失也。
故主明则下安，以此养生则寿，殁世不殆，以为天下则大昌。主不明则十二官危，使道闭塞而不通，形乃大伤，以此养生则殃，以为天下者，其宗大危，戒之戒之。
“胆者，中正之官，决断出焉。”所谓“中正”是处理事物不偏不倚，含有准确之意。 “决断”即决定判断。胆在精神意识方面具有判断事物，作出决定的能力。《素问·奇病论》说：“肝者中之将也，取决于胆。”说明肝主谋虑还须胆作出决断。诚如张景岳所说：“胆附于肝，相互表里，肝气虽强，非胆不断。肝肛互济，勇敢乃成。”肝与胆的功能相互结合，相互为用，人的精神意识才有正常的表现。如果肝胆功能不协调或者胆气虚，则会发生病变。如《素问·奇痈论》说：“此人者，数谍虑不决，故胆虚，气上逆丽口为之苦。”这不仅说明了肝胆的相互关系，同时也指出了因胆病而导致“谋虑不决”的征象，便是胆失去“决断”本能的具体表现。
“小肠者，受盛之官，化物出焉。”所谓“受盛”是承受之意，也就是说小肠居于胃下，丽接受胃中之水谷。“化物”即消化饮食物，分别清浊之意。小肠的主要功能是承接胃所腐熟的水谷，再进一步加以消化，把其中的精微营养物质（“清”的部分）吸收后，通过脾运转到全身各脏腑组织器官，同时将饮食物消化吸收后的糟粕(“浊”的部分)中的水液归于膀胱，滓秽归于大肠而排出体外，以完成其“化物”的使命。
“大肠者，传道之官，变化出焉。”所谓“传道”即传化输送之意。也就是说大肠接受小肠下注的饮食物残渣，吸收部分水液后，使之变化为粪便，最后由肛门排出体外，故称“变化出焉。
“膀胱者，州都之官，律液藏焉，气化则能出矣：”所谓“州都”即水液会聚之处。“津波”，此处指小便。“气化”指阳气对水液的蒸化作用。膀胱是水液贮存的地方。水液经肾气化以后，剩余水分及废料流入膀胱，待贮留到一定量时，再由膀胱排出休外。膀胱的这种功能必依赖于肾阳的作用，贮留水液是肾阳的固摄作用，排泄小便是肾阳的气化功能，即肾的“开”、“阖”作用。肾阳的一开一剧，控制着尿液下注膀胱使之贮存而不外溢，贮存到一定程度又能及时排泄；如开阖失司，可引起“膀胱不利为癃，不约为遗溺”的病理变化。
“三焦者，决演之官，水道出焉。”所谓“决”是通之意。“溃”是沟渠水道之意，形容水浊不断地向下疏通，向外排泄的状态。三焦为六腑之一，因在人体十二脏腑中，唯它最大，故又有“孤府”之称。三焦能沟通上下，导水下流，好象治理河道的河督，所以叫“决演之官”。三焦通利水液，不使它泛滥外溢和潴留为患，所以说：“水道出焉。”由此看出，三焦有主持诸气，疏通水道，总司人体气化的作用，为通行元气和水谷运行的道路。
“膻中者，臣使之官，喜乐出焉。”膻中（指心包络）是心主的富城，好似君主的臣使，能代心行令。心志为喜，心所喜乐，必然由膻中传出，所以说；“喜乐出焉”。但必须明白喜乐并非膻中发出，而是膻中传出心的“喜乐”；膻中是心的外围，有保护心脏的作用，故邪气犯心，常先侵犯心包。正如《灵枢·邪客》篇所说：“故诸邪之在于心者，皆在于心之包络。”所以后世温病学说中的“温邪上受，首先犯肺，逆传心包……”等理论也是在这个基础上发展起来的。
用粗浅的话来说明一个例子，让一个人心情烦躁不安的时候，心经阻塞，心脉不通的时候，ta的小便会不通畅，大小便都会受到直接的影响，心肾同属少阴经，心与小肠互为表里，小肠主化物，就是消化吸收功能，升清降浊，其实不只是大小便，心下不明，其他十一脏腑都一同受损，所以，证明了心主神明的生理机制是多么的合理恰当。
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