小美通过对2018年度1-7月份的微生态项目文章进行梳理，发现200余篇项目文章涵盖了土壤微生物、动物微生物、人体微生物、食品安全、空气污染治理和堆肥发酵六大领域，小美将在随后几周陆续推送各大领域项目文章解析：
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上期我们分享了土壤微生物多样性篇的客户文章案例，赢得很多老师的关注，本期我们开启动物微生物多样性篇，让我们一起来探索该领域最新研究进展和科研思路吧！
第一篇
中国农业大学陈芳团队研究发现喂食大麦叶会影响小鼠肠道微生物以及代谢产物的组成。该成果发表在《Journal of Nutritional Biochemistry》杂志上，此研究为探究微生物相关代谢物对宿主生理学的潜在影响提供了新见解。
Title: Gut microbiota promotes production of aromatic metabolites through degradation of barley leaf fiber
DOI: 10.1016/j.jnutbio.2018.05.001
文章摘要：
①喂食含有大麦叶食物的小鼠肠道微生物组成会发生改变，降解纤维素的细菌Lachnospiraceae和Prevotella在小鼠肠道中富集；②肠道微生物介导的大麦叶降解会促进丁酸盐和丙酸盐的产生；③代谢组学分析揭示喂食大麦叶的小鼠粪便中芳香代谢物的含量升高；④抗生素处理和厌氧发酵进一步证实了大麦降解期间肠道微生物在芳香代谢物生产中的专性作用。
图1 LEfSe分析揭示对照组小鼠和喂食大麦叶小鼠之间存在差异的肠道微生物
第二篇
华东师范大学李东亮团队研究发现微胶囊油可以改善高脂饮食喂养的罗非鱼免疫功能和肠道健康。该文章发表在《Aquaculture》杂志上，此研究首次阐明了食用微胶囊油对高脂膳食的罗非鱼的益处，为今后类似研究提供了依据。
Title: Dietary microencapsulated oil improves immune function and intestinal health in Nile tilapia fed with high-fat diet
DOI: 10.1016/j.aquaculture.2018.06.080
文章摘要：
①微胶囊油不会影响罗非鱼的生长、机体组成和肌肉脂肪酸组成，但是提高了溶菌酶在肠道中的活性和对嗜气单胞菌的抵抗力；②微胶囊油不仅改善了肠道微生物结构，而且增加了有益菌（芽胞杆菌、芍药杆菌）的丰度，减少了有害菌（假交替单胞菌、蔷薇单胞菌）的丰度；③在正常PL油（60%棕榈油+ 40%亚麻籽油）和微胶囊PL油之间，这些有益作用更为显著，但在FL油（60%鱼油+ 40%亚麻籽油）组中无显著差异；④微胶囊油的有益作用主要与油的组成有关。
图2 不同组罗非鱼肠道微生物属水平物种差异分析
第三篇
华东师范大学张美玲团队研究发现环境中抗生素的浓度会损害斑马鱼的肠道健康。该文章发表在《Environmental Pollution》杂志上，此研究有利于未来评估抗生素残留的潜在健康风险。
Title: Environmental concentrations of antibiotics impair zebrafish gut health
DOI: 10.1016/j.envpol.2017.12.073
文章摘要：
①暴露于抗生素并不影响鱼的体重增加，但增加了鱼的代谢率，并导致更高的死亡率；②暴露于抗生素后，肠道杯状细胞数量、碱性磷酸酶(AKP)、酸性磷酸酶(ACP)活性及抗氧化反应均显著降低，而炎症因子表达显著增加；③接触抗生素也会干扰土霉素组斑马鱼的肠道微生物群。
图3 抗生素暴露对肠道微生物组成的影响。左图为肠道微生物组成情况，右图为对照组、暴露于磺胺甲恶唑和土霉素中的罗非鱼肠道细菌群落组成比较。
第四篇
北京林业大学张盼月团队研究发现瘤胃液发酵能增强剪草的水解和酸化。该成果发表在《Journal of Environmental Management》杂志上，此研究将有利于优化利用瘤胃液发酵来增强剪草酸化这项绿色技术。
Title: Rumen fluid fermentation for enhancement of hydrolysis and acidification of grass clipping
DOI: 10.1016/j.jenvman.2018.05.027
文章摘要：
①反刍动物瘤胃液中含有一个复杂的微生物类群，包括细菌、原生动物、真菌和古菌，具有很高的降解木质纤维素生物质的能力；②严格的厌氧条件、高剪草量以及较小的剪草颗粒有助于有机物的水解和酸化；③厚壁菌门和纤维杆菌门是降解木质素和纤维素的主要细菌；④羧甲基纤维素酶、纤维二糖酶和木聚糖酶的活性升高。
图4 瘤胃液中微生物群落组成随着草料发酵时间的变化
第五篇
中科院亚热带农业研究所王敏团队研究发现奶牛瘤胃不同部位发酵终产物和产甲烷菌群落变化。该文章发表在《Journal of Dairy Science》杂志上，此研究提供瘤胃液研究的参考：在收集营养研究的瘤胃样品时，可能需要考虑在不同瘤胃部位的发酵终产物、产甲烷菌群和产甲烷作用的变化。
Title: Short communication: Variability in fermentation end-products and methanogen communities in different rumen sites of dairy cows
DOI: 10.3168/jds.2017-14096
文章摘要：
①采集3头没有哺乳的中国荷斯坦奶牛3个不同部位以及3个时间点的瘤胃内容物；②颅骨瘤胃样品中溶解甲烷浓度和pH值最高；③与腹侧瘤胃中样品相比，颅骨瘤胃液中甲烷杆菌的拷贝数和Simpson指数也更高；④颅内瘤胃中溶解CH4浓度高于中、后瘤胃，这可能是由于甲烷短杆菌数量增加所致。
图5 左图为三头奶牛不同瘤胃部位的微生物群落组成比较，右图为不同部位瘤胃产烷微生物群落组成
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