大高玄殿坐北朝南，南北长264米，东西宽57米，占地面积近1.5公顷，现存古建筑约1600平方米，基本上保持了原建风格。大高玄殿乾元阁

殿沿中轴由南往北依次为大高玄门、大高玄殿、九天万法雷坛、乾元阁等主体建筑，其左右布置有配殿、钟鼓楼及值房等建筑。殿前有两重琉璃门，均为并列的三座洞券门，护以石栏。琉璃门内有大高玄门，门面阔三间，中间有御路，通面阔16.20米，通进深8.80米，黄琉璃筒瓦歇山顶调大脊，五踩单昂斗栱。门内东西有钟鼓楼，均为方形平面，两层，黄琉璃瓦歇山顶，其内钟、鼓亦于八国联军侵入北京时失落。大高玄殿面阔七间，通面阔34米，通进深16.5米，黄琉璃瓦重檐庑殿顶，上檐七踩单翘重昂斗栱，下檐五踩重昂斗栱，金龙和玺彩画，前檐明、次间各四扇四抹隔扇门，两梢间为槛窗，均为三交六碗菱花窗格，带铜面页。

大殿座落于汉白玉石栏杆围绕的须弥座台基之上，前有月台，正面踏跺三出，中间有石雕御路，御路上雕有云龙、云凤、鹤等图案。殿前有东西配殿各五间，均为 绿琉璃瓦歇山顶，前出廊，一斗二升交麻叶斗栱，旋子点金彩画。九天万法雷坛，位于大殿之后，面阔五间，通面阔15米，通进深10米，单檐庑殿顶，绿琉璃瓦黄剪边，五踩重昂斗栱，檐下绘旋子点金彩画，殿前有围以汉白玉石护栏的月台，中间有御路。殿东西有配房，各九开间，通面阔37.40米，通进深9.60米，绿琉璃瓦歇山顶调大脊。大高玄殿最北的是一座两层楼阁，上层名“乾元阁”，为八根柱子构成圆攒尖顶，覆紫色琉璃瓦，亭立于平座上，周以围廊，有木质栏杆；下层名“坤贞宇”，方形，腰檐铺黄琉璃瓦，单翘单昂斗栱，井口天花，绘金龙；阁建于有汉白玉护栏的台基之上，正面中间有踏跺，石雕御路。