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蛋白质的脂酰化修饰(二)

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。作为唯一完全可逆的蛋白质脂修饰,它可以影响蛋白质的结构、组装、成熟、运输和功能,从而调节膜受体、离子通道、酶促反应、信号转导和细胞粘附等多种生理过程。

S-酰化最典型的是棕榈酸,此外还有硬脂酸(18:0)、油酸(18:1)、花生四烯酸(20:4)和二十碳五烯酸(20:5)。定量分析表明,参与S-酰化的脂肪酸中,棕榈酸平均占74%,硬脂酸占22%,油酸占4%。而且棕榈酸发现最早,所以一些文献将所有的S-脂酰化统称为S-棕榈酰化。

S-酰化是翻译后修饰,发生在高尔基体。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。

蛋白质的S-酰化与人体zDHHC。Physiol Rev. 2015 Apr; 95(2): 341–376.

现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具有较强的底物结合能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体。这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

S-酰化反应机制。NPJ Breast Cancer. 2016; 2: 16028.

S-酰化是一种可逆脂修饰,脱酰基反应由酰基蛋白质硫酯酶(acyl-protein thioesterase,APT)催化。[3H]棕榈酸脉冲追踪实验表明,掺入N -Ras的棕榈酸半衰期约为20分钟。但是不同的蛋白,甚至同一蛋白上的不同酰化位点,周转率都可能有很大差异。

S-酰化的底物多数是膜蛋白,主要包括跨膜蛋白和外周膜蛋白两大类。前者包括离子通道、受体、转运蛋白等,后者往往具有双重脂修饰,用于增强膜亲和力及状态调控,如Ras蛋白等。

O-脂酰化是脂肪酸与丝氨酸侧链羟基生成酯键。这种修饰较为罕见,一个例子是小鼠Wnt-3a的Ser209则被棕榈油酸(16:1)酰化,这一修饰与其运输定位有关。突变体S209A(209位Ser突变为Ala)无法正常分泌,而是保留在内质网中,进而导致发育异常。

Wnt3a的脂酰化缺陷导致功能异常。Dev Cell. 2006 Dec;11(6):791-801.

催化Wnt蛋白棕榈油酰化(Palmitoleoylation)的是蛋白质丝氨酸O-棕榈油酰转移酶,又称为porcupine(Porcn)。这个有趣的名字一听就是研究果蝇的人起的,它是Wnt的果蝇同源物Wingless(Wg)的正态分布所必需的,其缺陷导致果蝇幼虫皮肤细胞产生刺状突起。

Porcn属于MBOAT(膜结合的O-酰基转移酶)家族,最初被认为介导Wnt蛋白的棕榈酰化。后来发现Wnt-3a有两个脂酰化位点,它催化的是Ser209的棕榈油酰化。另一个位点是Cys77的S-棕榈酰化,也很重要,突变后激活Wnt信号的能力显著减弱。

棕榈油酰化反应在ER内腔中分两步进行。首先由硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)在棕榈酰辅酶A的9位插入顺式双键,生成棕榈油酰辅酶A。然后由Porcn将其转移至Wnt蛋白。

Wnt蛋白的棕榈油酰化与分泌。Prog Lipid Res. 2016 Jul; 63: 120–131.

Wnt的棕榈油酰化是可逆的。Notum属于α/β水解酶超家族,能够催化Wnt蛋白脱去棕榈酰基。Notum的底物结合部位只能与顺式单不饱和脂肪酸结合,因而具有高选择性。

另一个可以发生O-脂酰化的蛋白是ghrelin(生长激素释放肽)。它是一种仅有28个残基的肽类激素,可以与生长激素促分泌素受体(GHSR)结合,从而促进生长激素分泌,还有增加食欲、促进胃酸分泌等功能。

ghrelin的3位丝氨酸可以被辛酰化,由Ghrelin O-酰基转移酶(Ghrelin O-acyltransferase,GOAT)催化。这个修饰是其活性所必须的。GOAT也属于MBOAT家族,人类的MBOAT家族共有16个成员,其中有三个催化蛋白质的脂酰化。第三个是HHAT,不过它催化的是hedgehog蛋白的N-棕榈酰化反应,这里就不再介绍了。

参考文献:

1. Luke H. Chamberlain, et al. The Physiology of Protein S-acylation. Physiol Rev. 2015 Apr; 95(2): 341–376.

2. Alison M Anderson, et al. Palmitoylation: a protein S-acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016; 2: 16028.

3. Kimon Lemonidis, et al. The Golgi S-acylation machinery comprises zDHHC enzymes with major differences in substrate affinity and S-acylation activity. Mol Biol Cell. 2014 Dec 1;25(24):3870-83.

4. María-Eugenia Zaballa, et al. The molecular era of protein S-acylation: spotlight on structure, mechanisms, and dynamics. Crit Rev Biochem Mol Biol. 2018 Aug;53(4):420-451.

5. Ritsuko Takada, et al. Monounsaturated Fatty Acid Modification of Wnt Protein: Its Role in Wnt Secretion. Dev Cell. 2006 Dec;11(6):791-801.

6. Marilyn D. Resh. Fatty Acylation of Proteins: The Long and the Short of it. Prog Lipid Res. 2016 Jul; 63: 120–131.

7. Tracy M. Covey, et al. PORCN Moonlights in a Wnt-Independent Pathway That Regulates Cancer Cell Proliferation. PLoS One. 2012; 7(4): e34532.

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