随着2019年武汉新冠状病毒的爆发，人们逐渐开始关注病毒问题，病毒研究所的石正丽此时开始进入人们的视线，并引发人们的关注。她的2019年度科研成果汇总中，涉及多个与冠状病毒密切相关的研究成果。
石正丽所在的研究团队，主要工作是进行新发病毒病原学及其感染机理的研究，其中包括在蝙蝠、其他类啮齿类等野生动物身上发现与鉴定新病毒。在2019年该团队展开了蝙蝠抗病毒免疫研究的工作。石正丽研究团队完成了三个阶段的病毒研究过程，第一步病毒筛查研究；第二步病毒血清学研究；第三步获得了非常有价值的结论。
在第一阶段的病毒筛查阶段工作中，石正丽的研究团队完成了对四种病毒的鉴定：第一种，对新型蝙蝠丝状病毒的发现和特征鉴定（Nature Microbiology）过程。研究结果表明，蝙蝠可能携带更多新型丝状病毒。且蝙蝠丝状病毒被命名为：勐腊病毒（MLAV），存在跨种感染的风险。
第二种，肯尼亚啮齿动物和鼩鼱新型RNA病毒的分子检测和遗传特性研究（Frontiers inMicrobiology），在检测中发现病毒多为新型毒株，部分属于含有重要人类病毒病原体的家族。值得注意的是,一种新的沙粒病毒在Grammomys macmillani中被发现，这是首次在该动物上发现沙粒病毒。
第三，中国云南小型哺乳动物中温州哺乳动物沙粒病毒(WENV)病毒的感染情况调查（PLOS Neglected Tropical Diseases），研究结果表明与WENV相关的病毒在云南省的小型哺乳动物中有传播。第四，菊头蝠中发现一个新的具有独特基因组特征的Alpha冠状病毒成员（Viruses），研究结果扩大了对蝙蝠冠状病毒遗传多样性的认识，对蝙蝠病毒的持续筛查将对后续了解蝙蝠在冠状病毒的进化于传播具有重要作用。
在第二阶段的研究中，对病毒血清学展开研究，石正丽的研究团队主要探究肯尼亚骆驼中发现MERS冠状病毒和HKU8相关冠状蛋白共感染的血清学证据（Emerging Microbes & Infections）。研究表明，在骆驼中同时感染MERS-CoV和HKU8r-CoV。这也可能提高了重组冠状病毒在肯尼亚传播的可能性，该病毒具有MERS-CoV的S基因和HKU8r-CoV的N基因。虽然未能找到HKU8r-CoV或重组病毒的分子证据，但是为后续研究奠定了基础——寻找到HKU8r-CoV或重组的分子证据。
研究最后得出结论：致病性冠状病毒的起源与演化（Nature ReviewsMicrobiology）。结合当前的研究获取了两种致病性冠状病毒的起源和演变知识，明确了蝙蝠作为冠状病毒传播体的多样性和外溢潜力。最近猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV)对猪的外溢就是证据。
中科院病毒研究所石正丽2019年的科研成果汇总具有极高的科研价值。她目前就任务于病毒所新发传染病研究中心主任、武汉国家生物安全实验室（四级）副主任、生物安全三级实验室主任等。该机构成立于1956年，是专业从事病毒学基础研究及相关技术创新的综合性研究机构，拥有我国首个投入正式运行的生物安全（四级）实验室。
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