根据什么原则来把这些内容联系起来，形成一个严密的体系呢？在《哲学笔记》中，列宁在很多地方都说过这些原则。集中谈到这些原则的则有《黑格尔辩证法（逻辑学）纲要》、《谈谈辩证法问题》，特别是《辩证法的要素》诸篇章。
构成体系必须解决以下三个问题：（1）从何开始？（2）按照什么原则来安排全部范畴的顺序？（3）贯穿整个体系的核心是什么？黑格尔的体系对这三个问题都有回答：（1）哲学的开端是存在，因为存在是最一般最抽象的概念，但就其潜在的内容来说，又是最丰富最具体的概念。因此，从它开始便可把事物的辩证关系全部展现出来。
（2）安排范畴顺序的原则是：从抽象到具体、从简单到复杂、从表面到内部、从客观到主观，这是一个综合过程，是同哲学史一致的。在黑格尔看来，这也是一个分析过程，即从具体到抽象的过程。
但分析过程是一个潜伏着的过程，所以一般都说黑格尔的概念运动过程是一个综合过程。黑格尔是个唯心主义者，他认为这个顺序的根据是概念的思辨的本性，或辩证的本性，亦即纯逻辑推演过程，从概念到概念的过程。
（3）贯穿整个体系的核心是否定之否定，即正反合三段式。黑格尔把否定之否定也看作矛盾运动过程，但他认为对立面只有结合起来才是矛盾的解决，合就是正与反的结合或统一。此外，根据列宁的理解，黑格尔还有本体论、认识论和逻辑学三者是同一个东西的思想，这一思想与黑格尔哲学体系的构成有直接关系。
所谓三者是同一个东西，说的是黑格尔的逻辑学既是思维的科学，又是本体论，又是与人类认识的历史一致的。这一思想不是否定，而是肯定哲学是本体论，这就说明了黑格尔逻辑学的根本性质——它首先是关于客观世界的学问，当然在他那里这个客观世界从本质上说是个精神世界。
同时，它又是与认识的历史一致的，这一点即上面提到的第二点。它还是逻辑学，这就说明了它在思维中的普遍意义，它的规律不仅是支配客观世界的一般规律，而且是指导思维的一般规律。
黑格尔关于体系的这些思想都是在唯心主义基础上提出来的，但他毕竟根据这些思想构造出了一个自以为完整的严密的哲学体系。事实证明，在他的体系中包含着非常丰富的合理的东西。
同样，在他的体系思想中也有着合理的因素，可以供我们批判地吸取。列宁正是这样做的。列宁关于哲学体系的思想是唯物主义地改造黑格尔的体系思想的结果。列宁有以下一些关于体系的思想。
（1）唯物主义辩证法、认识论和逻辑学是同一个东西。这个思想是列宁第一次明确地提出来的，虽然他是根据了黑格尔的观点和做法。
从这个思想里可以引申出以下一些思想：第一，哲学首先是宇宙观，即关于宇宙及其一般规律的科学，那些认为列宁的三者同一的思想取消世界观的人们是曲解了列宁的思想。
列宁在说明逻辑学是什么的时候，首先就指出，“逻辑学不是关于思维的外在形式的学说，而是关于一切物质的、自然的和精神的事物的发展规律的学说”，这就十分明确地肯定了逻辑学的世界观性质。
第二，这个世界观就是唯物主义辩证法，它是一个整体，并不是由唯物主义和辩证法两部分构成的。
第三，这个体系的范畴的安排大体符合认识史，即符合哲学概念发展的历史，它反映了人类认识的规律。因此，这个体系的范畴的安排应是从抽象到具体、从简单到复杂、从浅到深。第四，这个体系中的原理是一般客观规律的反映，反过来又是一般思维的规律，从这个意义讲，哲学就是逻辑学。
（2）最高的概念是存在，存在是这个体系的开端。列宁并没有直接作出过这个结论，但从他的一些言论中可以看出，他是同意黑格尔的这个意见的。他摘录了黑格尔的许多关于开端的论述，作了肯定的评价，例如在《黑格尔辩证法（逻辑学）纲要》中，就肯定了存在这个开端。他还提出商品概念就是《资本论》的开端。
（3）体系的安排顺序不是概念的自我发展的过程，即不是思辨的推演过程，而是对人类实践和认识进行总结和概括的结果。正如列宁对《资本论》的体系所作的评价那样，在概念发展的每一步分析中，都用事实即用实践来进行检验。
哲学体系既不能像黑格尔那样靠概念推演来展开，那是思辨哲学；也不能像数学那样靠形式逻辑从公理、定义引出定理，这是欧洲理性派早已宣告失败的做法。
（4）体系的核心不是否定之否定，而是对立统一规律。对于黑格尔来讲，否定之否定当然是一个矛盾运动过程，但它要求有一个合的结局，只有合才是矛盾的解决，即矛盾的扬弃、消解，亦即对立面的统一。
所以，在黑格尔那里，与其说矛盾运动是辩证法的核心，毋宁说否定之否定过程是辩证法的核心，因为不仅是矛盾运动，而且是以统一为结局的矛盾运动，是构成黑格尔体系的最根本的原则。
列宁区别了否定之否定和对立面的统一，把否定之否定了解为在更高基础上重复过去的阶段，即重复和前进的对立统一，而把对立面的统一了解为对立统一规律，并明确指出对立面的统一是辩证法的核心。
列宁不像黑格尔那样把矛盾的解决局限于对立面的结合，而且包含了新的战胜、克服旧的。因此，列宁把对立统一规律看作辩证法的核心，比黑格尔更能反映出辩证过程的实质。
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