1. 平均市盈率的标准计算方法
股票时常的平均市盈率（Average P/E ratio）,是指股票市场某个有代表性的股价指数的平均市盈率,平均市盈率要与股价指数相对应，如标准普尔500指数的平均市盈率（简称标准普尔500指数市盈率，下同）、日经225股价指数市盈率、道琼斯股价平均市盈率、上证A股指数市盈率，等等，不能含混地说某某市场的平均市盈率。
某指数的市盈率就是某指数的成份股（剔除亏损股，因为亏损股的市盈率没有意义）的总市值（发行在外普通股股数×收盘价）除以净利润总额。
具体到上证A股指数市盈率，是指上证A股指数的样本股（包括ST股，不包括PT股，截止20002年1月9日为627只），剔除其中的亏损股，他们的总市值与净利润总额的商。上证30指数的市盈率，是指上证30指数的30个样本股，剔除其中的亏损股，它们的总市值与净利润总额的商。（上海证券交易所信息中心，2002）
2. 不同市场平均市盈率横向比较时应注意的几个问题
市盈率是一个非常粗略的指标，考虑到可比性，对同一指数不同阶段的市盈率进行比较较有意义，而对不同市场的市盈率进行横向比较时应特别小心。
（1）综合指数的市盈率与综合指数的市盈率比，成份指数的市盈率与成份指数的市盈率比。综合指数的样本股包括了市场上的所有股票（沪深市场上PT股除外），市盈率一般比较高，而成份指数的样本股是精挑细选的，通常平均股本较大、平均业绩较好，所以其市盈率比较低一些。而我们经常看到的国外股票时常的市盈率大多是成份指数的市盈率，如果将它们与我们综合指数的市盈率相比较，则犯了概念性错误。
（2）市盈率应与基准利率挂钩。基准利率是人们投资收益率的参照系数，也反映了整个社会资金成本的高低。一般来说，如果其他因素不变，基准利率的倒数与股市平均市盈率存在正向关系。如果基本利率低，合理的市盈率可以高一点，如果基准利率很高，合理的市盈率就应该低一些。目前我国央行再贴现率为2.97%，一年期储蓄存款收益率为1.80%，美国联邦基金利率为1.75%，美联储再贴出率为1.25%，中美基准利率差别不大，但纵向看，中国目前的基准利率是很低的。另据权威部门研究显示，根据我国目前物价水平及国家未来积极财政政策和适度货币政策取向，中国存在再次调低利率的可能。
（3）市盈率应与股本挂钩。平均市盈率与总股本和流通股本都有关，总股本和流通股本越小，平均市盈率就会越高（思腾思特管理咨询中国公司，2001），反之，就会越低，中西莫不如此。据统计，2001年10月16日中国沪深市场770只样本股（剔除了PT股、ST股、亏损股和2001年中期每股收益低于0.05元股票）算术平均市盈率为29.43倍，其中，总股本最小的100家上市公司算术平均市盈率为42.74倍，而总股本最大的100家上市公司算术平均市盈率只有19.82倍，前者是后者的2.16倍。在美国，小盘股的平均市盈率也高于大盘股平均市盈率的好几倍，NASDAQ市场市盈率高于纽约证券交易所市盈率，部分地与股本因素有关。
因此，看一个市场平均市盈率水平，还应考虑到这个市场的上市公司结构，如果是以小股本公司为主的市场，它的合理市盈率就应高一些。如果不考虑股票市场上市公司的股本构成，就不能解释为什么即使原有上市公司价格水平不变，只要上一个中石化，若再上中石油、中移动、中海油，就会把平均市盈率降下十几倍，就会把市盈率降到所谓的“合理区域”。事实上，2001年12月 31日上证A股指数市盈率降为37.59倍，如果中石化尚未上市，这一数字将戏剧性地升为43.31倍。
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