墨尔根其由来，一说为墨尔根（又作木里吉）是蒙语（还有说是满语），汉语的意思是“善射”即“善于打猎的人”或称“精能”“有智慧的人”。表示这里居住的人是以“打牲”为生。二说为墨尔根是来源于嫩江城东的墨尔根河。三说为康熙年间在此地挖井，偶得一块石头，其表面为唐时刻莫来耕，后相传音讹墨尔根。另外墨尔根还是高贵的称号,清朝开国元勋多尔衮就被封为“墨尔根代青”(汉语为睿亲王,意为英明的统帅),众人必须如此称呼,否则男人就要被罚摘掉他佩带的刀箭，女人就要被罚当众脱掉裙子。

　　嫩江一名是因水得名。据史料记载，嫩江是南北朝时的难水，亦称难河，元代为孛苦江，清代称诺尼水。“诺尼”、“嫩”皆为满语“碧绿”的意思。后因音成字，为嫩江。嫩江发源于小兴安岭的伊勒呼里山，上游流行于深山峡谷之间，河水清彻碧透。

　　墨尔根最早是土著民族的逐水而居的摇篮。康熙二十五年后，置八旗、水师营、官庄、驿站等，人丁始旺。早期驿站的站民多为戍卒子弟、三藩旧部和流人组成。民风遗俗淳厚、人性朴实。一夫力作，数口仰食而有余。而炊饪、浣汲、舂之事，妇女并习勤苦。旗营、屯站各安生业，皆结茅为舍，栅木为墙。“土著人架木覆茅，妇子合作，戚友之能匠事者，助而不佣。”夜不闭户，无盗贼之患；路不拾遗，无掠抢之虞。安享乐业达二百年，风俗尚嘉。