Science——[41.845]
① 在慢性肾病（CKD）模型小鼠中，高Saa（含硫氨基酸）饮食能增加盲肠硫水平，并减轻CKD症状和肾损伤；② 饮食中的Saa含量高低对小鼠肠道菌群组成影响不大，但其被菌群代谢产生的硫化物能通过调节蛋白质硫巯基化修饰来影响细菌功能；③ 在CKD患者肠道中富集的大肠杆菌，其分泌的酶TnaA可分解色氨酸产生吲哚；④ 高Saa饮食导致TnaA硫巯基化修饰水平升高，抑制其活性，这减少了肠内吲哚生成，降低尿毒素硫酸吲哚酚水平，从而减少CKD小鼠肾损伤。
【主编评语】
肠道菌群与慢性肾病存在关联。膳食蛋白质可被菌群代谢为硫化氢、吲哚、硫酸吲哚酚等物质，其中吲哚和硫酸吲哚酚是尿毒素，而硫化氢则具有多种生理调节作用，包括通过翻译后修饰来影响蛋白质功能。Science发表的一项最新研究发现，饮食中的含硫氨基酸被肠道菌群代谢后产生的硫化物，可通过对大肠杆菌的色氨酸酶进行硫巯基化修饰，来抑制其产生吲哚的能力，从而减少尿毒素生成和小鼠肾损伤。这些发现说明，饮食能通过翻译后修饰的机制，在不影响肠道菌群组成的情况下改变肠道菌群功能，为研究饮食-菌群互作和靶向菌群的饮食干预带来新的启示。（@mildbreeze）
【原文信息】
Diet posttranslationally modifies the mouse gut microbial proteome to modulate renal function
2020-09-18, doi: 10.1126/science.abb3763
Arthritis and Rheumatology——[9.586]
① 纳入62629名法国女性，基于饮食问卷评估蔬菜、豆类、谷物、鱼类、肉类、乳制品、橄榄油、酒精的摄入情况，以评估受试者对地中海饮食（MD）的依从性；② 随访期间共发生480例RA，对MD的依从性与RA风险无显著关联；③ 亚组分析显示，在吸烟者（包括曾经吸烟者）中，对MD的高依从性与较低的RA风险相关（MD评分每增加1分的风险比为0.91）；④ 高MD评分吸烟者、低MD评分吸烟者、高MD评分非吸烟者的RA绝对风险分别为38.3、51.5、35.8/10万人-年。
【主编评语】
Arthritis and Rheumatology上发表的一项前瞻性队列研究结果，对超过6万名法国女性进行超过10年的随访后发现，在吸烟者中，对地中海饮食的依从性越高，类风湿关节炎的风险越低。（@szx）
【原文信息】
Mediterranean diet and risk of rheumatoid arthritis: findings from the French E3N‐EPIC cohort study
2020-09-09, doi: 10.1002/art.41487
Advances in Nutrition——[7.265]
① 纳入24篇文献中的20项随机对照试验（中位干预时间8周）进行荟萃分析；② 不同的总红肉摄入量（≥0.5份/天 vs. <0.5份/天）对血糖、胰岛素、胰岛素抵抗、CRP、糖化血红蛋白、IL-6及TNF-α无显著影响；③ 在高蛋白饮食模式（红肉替代碳水化合物）中，相比于总红肉摄入量<0.5份/天，总红肉摄入量≥0.5份/天对胰岛素的降低更多；④ 对比宏量营养素相似的情况，相比于总红肉摄入量<0.5份/天，总红肉摄入量≥0.5份/天对胰岛素抵抗的降低作用较小。
【主编评语】
红肉摄入与糖尿病风险呈正相关。Advances in Nutrition上发表的一项荟萃分析结果，总结了20项随机对照试验的数据发现，红肉摄入量对血糖指标（包括血糖、胰岛素、胰岛素抵抗、糖化血红蛋白）及炎症标志物（CRP、IL-6、TNF-α）均无显著关联。（@szx）
【原文信息】
Effects of Total Red Meat Intake on Glycemic Control and Inflammatory Biomarkers: A Meta-Analysis of Randomized Controlled Trials
2020-09-10, doi: 10.1093/advances/nmaa096
Lancet Gastroenterology & Hepatology——[14.789]
① 纳入57项研究（共92个人群，包含423363名受试者）进行荟萃分析；② 在53项使用Rome III标准的研究中，38个国家（共395385名受试者）的IBS患病率为9.2%，混合型IBS（IBS-M）最常见（比例为33.8%）；③ 在6项使用Rome IV标准的的研究中，34个国家（共82476名受试者）的IBS患病率为3.8%，腹泻型IBS（IBS-D）最常见（比例为31.5%）；④ 女性的IBS患病率显著高于男性；⑤ 即使使用相同诊断方法和标准，不同国家之间的IBS患病率仍有较大差异。
【主编评语】
不同国家之间的IBS患病率有很大差异，可能是由于诊断方法及标准的不同所造成的。Lancet Gastroenterology & Hepatology上发表的一项荟萃分析结果，对比分析了在Rome III及Rome IV诊断标准下的IBS患病率，发现Rome III标准的IBS患病率高于Rome IV标准（9.2% vs. 3.8%），而不同国家的IBS患病率差异即使在相同的诊断方法及标准下仍存在。（@szx）
【原文信息】
Global prevalence of irritable bowel syndrome according to Rome III or IV criteria: a systematic review and meta-analysis
2020-07-20, doi: 10.1016/S2468-1253(20)30217-X
Molecular Metabolism——[6.448]
① 24名代谢综合征患者平均分为2组，分别口服补充丁酸盐 移植自体粪菌，或口服安慰剂 移植经胃旁路术后的供体的粪菌；② 干预4周后，相比于丁酸盐组患者，粪菌移植组患者的脑多巴胺转运蛋白（DAT）表达增加，但两组患者的体重及胰岛素敏感性无显著差异；③ 粪便中的单形拟杆菌丰度增加与DAT增加呈正相关，而普氏菌属物种的丰度增加与DAT增加呈负相关；④ 另外，纹状体DAT表达与血浆代谢产物（甘氨酸、甜菜碱、甲硫氨酸、赖氨酸）相关。
【主编评语】
Molecular Metabolism上发表的一项RCT研究结果，对24名代谢综合征患者进行口服丁酸盐或粪菌移植（供体接受了胃旁路术）干预，发现2种干预对体重及胰岛素敏感性均无显著改善，但相比于口服丁酸盐，粪菌移植可增加患者脑中的多巴胺转运蛋白表达。（@szx）
【原文信息】
Infusion of donor feces affects the gut-brain axis in humans with metabolic syndrome
2020-09-08, doi: 10.1016/j.molmet.2020.101076
Microbiome——[11.607]
① 基于培育实验（使用亲生父母或寄养父母哺育新生斑马雀科幼雏），研究母体共生微生物对鸟类早期微生物建立的影响；② 幼雏的肠道微生物群落与养育它们的父母的肠道菌群相似，主要通过间接的母体传播获得（从涂有父母肠道和泄殖腔微生物的巢中被动吸收）；③ 口服喂养仅影响孵化幼雏肠道微生物发育的早期阶段（主要取决于母体口腔和嗉囊微生物群），而这些微生物群在后期被母体肠道微生物所代替。
【主编评语】
Microbiome近期发表研究，分析了雏鸟的肠道菌群变化以及塑造其肠道菌群的因素，表明母鸟的肠道菌群是雏鸟菌群的主要贡献者，鸟巢是传播的关键途径。（@mildbreeze）
【原文信息】
Maternal gut microbes shape the early-life assembly of gut microbiota in passerine chicks via nests
2020-09-11, doi: 10.1186/s40168-020-00896-9
Microbiome——[11.607]
① 分析正常（N）、高福利和ω-3高福利3种养殖系统的鸡，在第7和30天的生长性能、盲肠菌群和弯曲杆菌的情况；② 鸡菌群多样性随时间增加，N系统鸡的菌属组成与其它系统区别明显，不同系统下的鸡的代表性菌属与能量代谢、氨基酸、核苷酸和短链脂肪酸的利用直接相关；③ 饲养密度可显著影响鸡菌群结构，但环境压力对菌群结构的影响随饲养密度增加而减弱；④ 弯曲杆菌与菌群多样性和环境压力的增加有关；⑤ 添加ω-3影响特定细菌的丰度，促进增重。
【主编评语】
Microbiome发表的一项研究，分析了不同养殖条件和参数对鸡的肠道菌群、生长性能和致病菌（弯曲杆菌）的影响，对于研究家禽养殖有参考意义。（@mildbreeze）
【原文信息】
Impact of industrial production system parameters on chicken microbiomes: mechanisms to improve performance and reduce Campylobacter
2020-09-09, doi: 10.1186/s40168-020-00908-8
Genome Biology——[10.806]
① 从6只以次优和最优维持能量需求水平饲喂的Boran牛中收集24个瘤胃液样品，通过鸟枪法宏基因组学对其进行研究；② 从中获得1200个高质量宏基因组组装基因组（MAG），主要归类为拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门；③ 这些MAG去重复后得到850个MAG，将其与其它公开的瘤胃微生物基因组比较证实其独特性；④ CAZy和KEGG功能注释分析发现不同瘤胃微生物基因组功能潜能有差异；⑤ 饮食限制影响非洲牛瘤胃微生物组组成和功能潜能。
【主编评语】
Boran牛是撒哈拉以南非洲的本土瘤牛品种，对恶劣的热带环境有很好的适应性，受经济和饲料品质限制，这些牛通常处于饲喂不足的状态，这种饲养条件对于牛瘤胃微生物组的影响尚不清楚。Genome Biology发表的一项研究通过宏基因组学方法，获得了1200个来自Boran牛瘤胃的高质量宏基因组组装基因组，并对其组成和功能，以及饲喂不足产生的影响，进行了分析。（@mildbreeze）
【原文信息】
1200 high-quality metagenome-assembled genomes from the rumen of African cattle and their relevance in the context of sub-optimal feeding
2020-09-03, doi: 10.1186/s13059-020-02144-7
EBioMedicine——[5.736]
① 在给小鼠接种流感病毒之前，长双歧杆菌35624®或其细胞壁滴鼻，可显著降低小鼠肺部的病毒载量，并显著延长生存期；② 病毒载量的减少与肺部损伤的降低相关，后者表现为细胞死亡、血管渗漏标志物、中性粒细胞招募、IL-6等炎症因子水平、1/2型IFN水平的减少，以及IFN-γ与表面活性剂蛋白D水平的增加；③ 在接种病毒后24小时内，长双歧杆菌的细胞壁也可起到保护性作用；④ 长双歧杆菌PB-VIR™菌株也可起到类似的保护作用。
【主编评语】
来自EBioMedicine上发表的一项最新研究，在流感病毒感染小鼠模型中发现，长双歧杆菌35624®（来自PrecisionBiotics公司）及其细胞壁可缓解肺部的炎症应答及损伤，并降低肺部的病毒载量，从而提高生存率，而长双歧杆菌PB-VIR™菌株也有类似的保护性作用。（@szx）
【原文信息】
Intranasal Bifidobacterium longum protects against viral-induced lung inflammation and injury in a murine model of lethal influenza infection
2020-10-01, doi: 10.1016/j.ebiom.2020.102981
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