解析：多肽从头测序中的肽片段裂解细节（下）

肽片段裂解规则总结

大多数肽片段离子是b离子或y离子。a离子比较常见，因为b离子丢失CO后就可得到a离子。

随体离子（d_n，v_n，w_n离子）由高能CID形成。

含丝氨酸丝氨酸，苏氨酸，天冬氨酸 和谷氨酸的离子会形成中性分子丢失水（-18）。

含天冬酰胺，谷氨酰胺，赖氨酸，精氨酸的离子会形成中性分子丢失亚胺（-17）。

天冬酰胺的亚胺中性丢失会导致片段离子（y-17）或（b-17）离子的丰度高于其对应离子。

当C端具有基础残基时，该肽会生成（b_n-1+18）离子。

可以在多电荷离子光谱中观察到互补的b-y离子对。该b-y离子对的下标的总和等于未知肽中氨基酸残基的数量总和。

如果C端为精氨酸或赖氨酸时，可以在光谱中找到y1 离子，可以证明这一点。

肽裂解成片段的方法

在低能CID中，b离子和y离子是主要的离子产物。 另外，在含有RKNQ氨基酸的片段中可观察到丢失的亚胺（-17 Da），在含有STED氨基酸的片段中可观察到丢失水（-18 Da）。光谱中不会显示任何随体离子。

在高能CID中，可以观察到所有不同类型的碎片离子，但不会观察到丢失亚胺或丢失水。

在ETD（电子转移解离）和ECD（电子捕获解离）中，c，y，z+1，z+2离子为主要离子，有时候还包括w离子。

MALDI中的PSD（源后衰变）中，最常见的离子产是物a，b，y离子。

影响肽裂解成片段的因素包括电荷状态（电荷状态越高，裂解所需的能量越少），肽的质量（质量越大，所需的能量越多），所需能量（能量越高导致片段化越多），最初的氨基酸序列，裂解方式和碰撞气体。

本文由百泰派克生物整理编辑，参考文献：

De novo peptide sequencing,en.wikipedia.org/wiki/De_novo_peptide_sequencing#cite_note-14

北京百泰派克生物科技有限公司专注于蛋白质理化性质分析及结构解析，提供以质谱技术为基础的蛋白质组学代谢组学技术服务。公司致力于建立国际领先的蛋白质研究分析技术平台，为各科研院所和大学提供高效、准确、性价比高的蛋白质（组）研究技术包裹，协助客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破，为生命科学的发展做出贡献。