LC-MS/MS已成为代谢物鉴定的主要技术手段，运用高分辨率精确质量数据、高扫描速度的MS/MS以及全扫描模式，可对代谢物结构进行推断，实现代谢物质的鉴定。
代谢物鉴定流程
【迪信泰检测平台】基于LC-MS/MS、LC-Q-TOF等多种主流的液质联用仪，可以实现：
1. 制药：合成过程中中间体、成品的结构鉴定、杂质分析；
2. 天然药物与中药分析：结构鉴定、质谱分析、中药药效物质鉴定；
3. 药物代谢药物动力学：药动学、药物代谢物分析/鉴定；
4. 代谢组学和蛋白组学（生物大分子分析）；
5. 食品、烟草、日化品分析；
6. 环境检测、土壤检测等。
三重四极杆质谱（QqQ-MS）技术
三重四极杆质谱是代谢物鉴定比较常用的一种技术手段，可采用不同的选择模式，如中性丢失、母离子、子离子和多重反应监测（MRM），操作简单，成本较低，因此常用于代谢物鉴定和生物定量分析。
离子阱质谱（IT-MS）技术
离子阱质谱可以快速获得高灵敏度的全扫描质谱图和多级质谱碎片信息，并通过这些信息推测质谱碎裂途径和代谢位点，从而实现未知代谢物鉴定。
由于其不能实现前体离子和中性丢失过滤，因此主要是通过比较待测样品和对照样品之间离子流色谱图中色谱峰的差异，推断代谢物的种类和代谢物谱。该技术的代谢物鉴定周期较长，需多次进样检测，而且易受生物基质的干扰。
飞行时间质谱（TOF-MS）技术
飞行时间质谱的原理是利用动能相同而质荷比不同的离子在恒定电场中运动，经过恒定距离所需时间不同，实现代谢物的结构和成分分析。
四极杆-飞行时间质谱（Q-TOF）和离子阱-飞行时间质谱（IT-TOF）可以提供母离子、多级碎片离子、精准分子量和元素组成等大量信息，帮助研究者实现复杂代谢物的成分分析和结构鉴定，它们在食品、中药以及天然产物的鉴定方面具有广阔发展前景。
三种质谱的比较
质谱类型
质量范围
分辨率
优点
缺点
四级杆
3000 m/z
2000
适合电子喷雾，正负离子模式易于切换，体积小，价格低
测量范围限于3000m/z
与MALDI兼容性差
离子阱
2000 m/z
1500(轨道离子阱可以更高)
适合多级质谱，正负离子模式易于切换，体积小，设计简单，价格低
测量范围限于商品水平
TOF MS
∞
15000
质量范围宽，扫描速度快，设计简单
价格较高
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