生活中最常见的疾病就是便秘和腹泻，但是很少有人知道，便秘和腹泻这两个对立的症状表现，其实都是一个病因引起的——肠道菌群失衡
具象一点，我们可以把肠道菌群理解成为“跷跷板”，当人体内肠道菌群出现失衡后，菌群性质向“左边”倾斜，就会出现便秘症状；反之菌群性质向“右边”倾斜则会出现腹泻症状。
也就是说除了器质性病变引起的便秘、腹泻外，两者的病因就是这么一回事，肠道内菌群失调了。
在没有益生菌普及之前，我们通常用抗生素来治疗腹泻，其作用机理是利用抗生素的杀菌效果，将药物投放到肠道中强力清理肠道中的“细菌”，其中细菌的含义包括有害细菌和有益细菌。研究发现对于这种好菌与坏菌同时清理的手段，造成的严重后果就是肠道菌群紊乱，甚至会有先腹泻后便秘的情况出现。
长期通过蒽醌类泻药如芦荟、番泻叶、大黄等来治疗便秘，在促进排出粪便同时也会促使体内电解质、水、营养物一同排出，造成肠道粘膜功能损伤，和肠道生态环境破坏，会逐渐形成结肠黑变病，进一步发展就会引发癌变。
我们以常规思维角度试想一下，造成便秘和腹泻的根本原因是肠道菌群失衡，那么解决它最有效且安全的办法就应该是从“菌群”着手。事实也正是这样，通过补充益生菌来改善肠道腹泻便秘的手段已经逐渐被广泛应用到各个医学领域，其中婴幼儿便秘腹泻通过益生菌治疗目前已经完全普及。
益生菌改善腹泻机理
益生菌可以通过产生抑菌素、修饰毒素、干涉致病菌附着、促进免疫系统等达到改善腹泻的目的。
欧洲一些医疗中心试用以乳杆菌、双歧杆菌与菊糖为主要成分的口服液治疗旅行者腹泻，也取得良好效果。
益生菌针对不耐乳糖症状的改善
不耐乳糖症在世界各地较为常见。患者只要一喝牛奶，就会引起腹泻。这是因为牛奶中含有大量乳糖，而乳糖是一种在肠道中具有高渗透作用的物质。有些人天生缺乏可分解乳糖的乳糖酶，故大量乳糖原封不动地进入肠道就会引起腹泻。补充益生菌或者益生菌型酸奶是可以治疗不耐乳糖症的。
益生菌改善便秘机理
益生菌通过与肠粘膜上皮紧密结合形成生物膜，取缔致病菌的吸附位置，在肠道内大量繁衍产生乳酸、醋酸及其它有机酸来降低结肠pH值。较低的pH值可控制由有害菌引起的异常发酵,促进新陈代谢和维生素B族的合成，并帮助肠道蠕动，减少水分的过度吸收,提高食物的分解吸收率，帮助消化吸收、使排便畅通。
真实实验数据
2010年内农大“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室对不同年龄段(3-70岁)153例便秘和急慢性腹泻人群的实验结果显示，连续补充3周（每天100亿活菌）对便秘、急性腹泻、慢性腹泻改善率分别为95.3%、89.9%和95.4%；对50岁以上的受试者（164例）的健康调查结果表明，连续补充3周（每天100亿活菌），精神状态和食欲改善率分别为65.0%和83.1%。
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