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生物信息学数据挖掘SCI文章怎么写?——文献精读




长非编码RNA(lncRNA)

近年来lncRNA在各种癌症中起关键作用,包括非小细胞肺癌(NSCLC)。因此在肿瘤研究中,lncRNA也开启了研究处于火热模式。今天为大家介绍一篇lncRNA 在肺癌中的研究。

                             

               

    首先简单介绍下全文的思路:在作者的研究中,主要专注于lncRNA LINC00968在NSCLC中的生物学功能和临床意义。研究发现LINC00968在LUAD、LUSC组织中以及非小细胞肺癌中表达显著增加。抑制LINC00968能够在体外抑制NSCLC增长,迁移和侵袭。通过敲低LINC00968检测凋亡相关蛋白BCL-2表达降低,BAX表达增加。同时作者观察到Wnt信号通路参与LINC00968诱导的NSCLC进展。作者推测LINC00968可以作为非小细胞肺癌的新型的预后生物标志物和治疗靶点

    下面就来了解一下作者的研究内容吧。

利用数据库筛选lncRNA

LINC00968在肺癌组织以及非小细胞肺癌细胞系中表达显著增高。

    首先作者通过oncomine数据库分析发现,LINC00968LUADLUSC组织中表达显著上调。作者进而在非小细胞肺癌细胞系A549, H460, H1299, H1975 H358中验证发现LINC00968表达显著高于正常细胞系BES-2B。推测LINC00968可能参与非小细胞肺癌恶性化进程。

LINC00968的表型研究

1、敲减LINC00968抑制非小细胞肺癌增殖、迁移、侵袭能力。

    为了研究敲减LINC00968是否能够影响非小细胞肺癌肿瘤发展进程,作者向A549H1299细胞中转染敲减质粒LV-shLINC00968以及对照质粒LV-NC进行有效的敲减LINC00968的表达。

  1. 通过cck8增殖实验检测发现,LV-shLINC00968可以显著抑制细胞的存活。

  2. 细胞迁移侵袭实验证明,抑制LINC00968可以显著抑制细胞的迁移侵袭能力。

2、过表达LINC00968,可以促进非小细胞肺癌增殖、迁移、侵袭能力。

作者向A549H1299细胞中转染过表达质粒LV-LINC00968以及对照质粒LV-NC进行有效的提高LINC00968的表达。cck8增殖实验以及细胞迁移侵袭实验证明过表达LINC00968,可以促进肿瘤进程。

3、敲减LINC00968可以引起A549细胞发生凋亡。

为了验证LINC00968是否参与调控肿瘤细胞的调亡,作者通过流式细胞术验证敲减LINC00968可以引起A549细胞凋亡的发生。同时,敲减LINC00968可以下调凋亡抑制基因BCL2的表达,以及上调促凋亡基因BAX的表达。

LINC00968的机制研究

为了探究LINC00968调控非小细胞肺癌进程的机制,作者关注到Wnt/β-catenin信号通路。通过蛋白免疫印迹实验发现,下调LINC00968的表达可以引起β-catenin以及 CyclinD1表达显著下调,而GSK-3β的表达显著上调。提示LINC00968可能参与调控Wnt/β-catenin 的活性。

在体外实验后,作者又进行了体内实验。通过构建裸鼠肿瘤模型,作者向裸鼠体内注射了A549的敲减LINC00968细胞株,肿瘤进程受到抑制,并且呈时间依赖关系。肿瘤组织中BCL-2的蛋白表达水平降低,BAX蛋白表达水平升高,与体外结果一致。








    


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