穴盘基质育苗具使用方便、质轻多孔、透水透气等诸多优点，成为蔬菜育苗的首选载体。穴盘基质育苗统一播种和管理，减少土传病虫害发生，成苗率高，节省种子成本，种苗移栽简捷、方便，不损伤根系，定植成活率高，缓苗快，植株生长整齐，利于早熟丰产。根据万里神农杭州种植基地的实践，以下针对蔬菜穴盘育苗几个技术问题进行归纳，以供读者参考。
一、穴盘选择
一般可选塑料穴盘尺寸54cm×28cm型，具32、50、72、128、200、288个育苗孔多种规格。瓜类如南瓜、西瓜、冬瓜、甜瓜多采用50穴或72穴，茄科蔬菜如番茄、辣椒苗采用72穴，甘蓝类蔬菜花椰菜、西兰花、甘蓝采用72穴或105穴，叶菜类蔬菜如生菜、芹菜可采用200穴或288穴。有集约化育苗条件的在选择穴盘时可与播种机、移栽机等相匹配的型号。
二、基质选择
穴盘育苗用土以基质代替土壤，幼苗在生长发育过程中根系与基质紧密缠绕，根系所需的养分与水分也由育苗基质提供，基质质量的好坏不仅影响幼苗的生长速度和质量，而且影响定植后的缓苗时间甚至产量和产值。基质的种类很多，常用基质的主要成分是草炭，蛭石，珍珠岩等，配比为3：1：1。
三、基质消毒
育苗时每袋基质加入50％福美双或50%多菌灵，调节含水量至60%左右（手握成团，落地开花）。用这种方法可预防蔬菜苗期的猝倒病和立枯病。
四、装盘和压穴
将配好的基质装在穴盘中，装盘时应该注意不要用力压紧，因其压紧后，基质物理性状受到破坏，正确的方法是用刮板从穴盘的一方刮向另一方，使每个孔穴中都装满基质，特别是四角和盘边的孔穴，要与中间的孔穴一样。
注意种植穴种子播种深度控制，过深发芽慢，种苗不齐，太浅种子易被水冲走。一般情况下，甘蓝0.5cm，番茄、辣椒、茄子0.8-1cm，西瓜、甜瓜和黄瓜1.5cm，南瓜、西葫芦1.5cm。
五、种子处理
把种子放入30℃左右的温水中浸润10分钟，使病原菌活化，然后捞出放入准备好的55℃左右的温水中，水量约为种子量的3倍即可，边放入种子边不停地朝同一个方向搅拌，以保证种子受热均匀、恒定，搅拌烫种15-20分钟。之后用清水反复搓洗种子2-3次，洗去种子表皮黏液，清洗好后捞出沥干表面水分后催芽。
六、浸种、催芽
浸种的目的是使种子吸水膨胀，但要防止浸种时间过长使种子窒息死亡。一般用室温水浸种，西瓜12小时；甜瓜和西葫芦等6小时；番茄5-6小时；辣椒8小时；茄子10-12小时，最多24小时；黄瓜4-6小时。浸种后沥干水分，将种子摊开晾10分钟左右，或用干布擦干种子表面明水，使种皮透气，以利尽快发芽。把浸好的种子均匀平铺于稍拧不滴水的干净湿毛巾上并将其卷起，或置于带有湿润发芽纸的发芽盒中，将其放在恒温箱、电热毯或其它加温设施中催芽。
七、播种
关注天气预报，选晴天上午10点左右或者下午4点左右播种，保证播种后有一周左右的晴好天气，以利种子顺利出土。把催好芽的种子放在穴中心的孔中，每穴一粒。播种后覆盖一层湿润的基质，刮盘使基质面与盘面相平，然后摆于苗床中，在苗床上可铺地布或地膜，防止根系扎入土中。穴盘摆放至苗床后浇一次透水（拌有1500倍亮盾或恶霉灵杀菌剂，预防苗期立枯病、猝倒病发生），浇水时忌浇水过大把种子冲出穴盘，待基质表面水分下渗并稍晾。早春需要在苗床上扣上小拱棚膜，并使用温床保温；而秋季则利用打湿的报纸、毛巾等覆盖穴盘表面，以保持苗床水分和温度，促进出苗。
八、苗床管理
严格控制苗床温度、湿度、光照等条件，防止秧苗徒长。若遇连续阴雨天气尽可能多见光，必要时通过人工补光，结合调节苗床湿度、水分控制徒长。加强苗期病虫害防治，定期用肥用药，培育适龄壮苗。
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