据《国家税务总局广东省税务局 广东省财政厅关于在酱油制造和豆豉制造行业试行农产品增值税进项税额核定扣除办法的公告》（国家税务总局广东省税务局 广东省财政厅公告2020年第5号）第四条规定，
“试点纳税人购进农产品不再凭增值税扣税凭证抵扣增值税进项税额。在购进农产品时仍应按照《中华人民共和国发票管理办法》有关规定取得发票或开具农产品收购发票，并按《实施办法》第六条规定计入成本。纳税人不按规定取得发票或开具农产品收购发票,导致会计核算不健全或者不能够提供准确税务资料的，经主管税务机关核实确认后，退出农产品核定扣除试点。五、纳税人购进农产品全部取得增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书等增值税扣税凭证抵扣进项税额的，可选择是否纳入农产品核定扣除试点。试点纳税人购进农产品不再凭增值税扣税凭证抵扣增值税进项税额，在购进农产品时如果不能按照《中华人民共和国发票管理办法》有关规定取得发票或开具农产品收购发票，会存在企业所得税扣除上的风险。当然，从事农产品初加工免税项目的，可能不会有实质性影响。关于农产品，很多小伙伴知道可以享受增值税免税政策、深加工可以享受加计1%扣除进项税额，但是了解的又比较含糊。
（1）四种合法扣税凭证：增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品销售发票、农产品收购发票注意：根据财税【2017】37号文，这里的销售发票，是指农业生产者销售自产农产品适用免征增值税政策而开具的普通发票。不包括从批发/零售农产品的纳税人取得的普通发票。试点纳税人以购进农产品为原料生产货物的，农产品增值税进项税额可按照以下方法核定：采购环节将税额计入存货成本，待实际耗用或者对外销售时，再根据核定的允许抵扣的进项税额（含加计扣除增值税进项税额）某利园糕点制造企业（增值税一般纳税人）购进小麦加工成面包对外销售。1、2019年6月购进小麦，取得一般纳税人开具的增值税专用发票，注明金额100元，税率9%，税额9元，款项用银行存款支付；2、取得小规模纳税人申请税务机关代开的增值税专用发票，注明金额200元，税率3%，税额6元，款项用银行存款支付；3、向农民伯伯收购小麦，支付现金300元，给农民伯伯开具了一张收购发票。购进的小麦当月全部生产领用。糕点厂购进小麦税务处理如下：（1）纳税人购进用于生产销售或委托受托加工13%税率货物的农产品扣除率为10%。糕点的适用税率为13%，所以购进小麦扣除率为10%，从一般纳税人购进小麦，计算可抵扣进项税额为：100×10%=10（元）。增值税专用发票上注明的增值税额为9元，实际上纳税人可以抵扣10元进项税额，根据《国家税务总局关于调整增值税纳税申报有关事项的公告》（国税局2017年第19号）规定，9元（专票上注明的税额）在购入当期抵扣，剩下1元在领用小麦时加计扣除。 应交税费——应交增值税（进项税额） 9（100*9%）（2）从小规模纳税人购进小麦，计算可抵扣的进项税额为：200×10%=20（元）。增值税专用发票上注明的增值税额为6元，实际上纳税人可以抵扣20元进项税额，其中18元（200×9%）在购入当期抵扣，剩下2元在领用小麦时加计扣除。 应交税费——应交增值税（进项税额）18（200×9%）（3）从农民伯伯购进小麦，属于向农业生产者购进农产品，根据开具的收购发票的买价，计算可抵扣的进项税额为：300×10%=30（元），其中27元（300*9%）购入当期抵扣，剩下的3元在领用小麦时加计扣除。 应交税费——应交增值税（进项税额）27（300*9%）（4）农产品购入时，取得的增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品收购发票或销售发票均已按9%的税率（扣除率）抵扣进项税额；月末，根据当月生产领用的农产品计算当月可加计扣除的进项税额。加计扣除农产品进项税额=（9+18+27）/9%*（10%-9%）=6（元），或者直接根据我们前面计算出的剩余未抵扣的金额，直接相加，可加计的进项税额=1+2+3=6（元）注意：第6栏“农产品收购发票或者销售发票”：反映纳税人本期购进农业生产者自产农产品取得（开具）的农产品收购发票或者销售发票情况。从小规模纳税人处购进农产品时取得增值税专用发票情况填写在本栏，但购进农产品未分别核算用于生产销售13%税率货物和其他货物服务的农产品进项税额情况除外。
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