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科普小课堂 | Ensembl ID

Gene Official Name,也就是Symbol可能是大家更愿意接受和理解的一种基因名,但是有时候我们会遇到类似下面这种:

ENSG00000186092.4

ENSG00000279928.1

ENSG00000279457.2


此处ENS*就是Ensembl ID,其所代表的是在Ensembl数据库中对基因的命名,当拿到这样一组数据时,当然是要先看懂其所代表的具体意义!

以ENSG00000186092.4为例:

1、ENS是固定字符,表示这是一个Ensembl ID。默认物种是人,如果是小鼠的话则以ENSMUS开头,更多物种编码详见:

http://www.ensembl.org/info/genome/stable_ids/index.html


2、G表示该id指的是一个基因,E for exon, FM for protein family, G for gene, GT for gene tree, P for protein, R for regulatory feature and T for transcript.


3、00000186092为11个数字组成的唯一编号,可以理解为基因的真实编号


4、.4为版本号,表示其在Ensembl数据中进行了4次变更


对于Ensembl ID代表的意思详见:

https://asia.ensembl.org/Help/Faq?id=488

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