内分泌性阳痿的发生率为5% -35%，国内胡礼泉等报道一组492例，不同年龄组血清性激素测定表明，性腺激素异常的内分泌性阳痿发生率为16%。它可占全部阳痿的8%~9%，主要包括性腺功能低下和高泌乳素2种原因，它们的发生率大致相仿，另外亦可见甲状腺疾患，其他内分泌疾患，雄激素合成减少或作用不全等。内分泌性阳痿的诊断方法简便可靠，其发病机制明确，治疗合理，治愈率高。
睾丸对维持男性性欲，第二性征和勃起功能都是必要的。因此，睾酮水平低下时，患者会出现身体形态改变，第二性征改变或出现女性化表现，睾丸体积变小，性欲低下，勃起能力减弱或消失。下丘脑一垂体一性腺轴系的任何一个环节的异常，均可导致睾酮水平降低，即性腺功能低下，部分患者可发生阳痿，包括原发性睾丸疾患——睾酮水平将明显低下，而促性腺激素水平将明显增高，如LH可达20~60 IU/L(正常值4~12 IU/L)，FSH可达15~60 IU/L(正常值4~12 IU/L)：继发性性腺功能低下，系下丘脑或垂体功能异常所致，促性腺激素水平低下引起的，如LH为0.2~3.5 IU/L，FSH为1-~5 IU/L。在酗酒、极度肥胖症或存在甲状腺功能障碍情况，应测量游离睾酮水平，因为总睾酮水平减低可能与睾酮结合蛋白水平低下有关，而并非真的内分泌紊乱。
睾酮测定除总睾酮水平外，还应包括游离睾酮和生物可利用睾酮水平。生物可利用睾酮中，包括游离睾酮及与白蛋白结合的睾酮（过去认为游离睾酮具有生物活性）。生物可利用睾酮比游离睾酮容易测，只要用硫酸铵把睾酮结合球蛋白沉淀掉即可。原发性性腺功能低下，包括Klinefelter综合征（先天性曲细精管发育不全，染色体为47XXY）、双侧隐睾、睾丸炎、睾丸损伤等；继发性性腺功能低下，包括卡尔曼综合征（下丘脑疾患）、垂体肿瘤等。此外尚有老年人单纯血睾酮低下者。
以阳痿就诊的性腺功能低下患者，多伴有性欲低下。患者在半年至一年内，胡须及体毛消失，应怀疑合并肾上腺皮质病变，如阿狄森病。
对于性腺功能低下的阳痿患者，雄激素替代疗法的目的，是维持正常的血清睾酮水平，增强性欲，恢复性功能及促进第二性征发育。目前常用的有供口服的安雄，经肠道淋巴系统吸收，通过胸导管直接进入血液，由于避免了肝脏代谢，结果使血清睾酮得以提高到治疗水平；供注射的十一酸睾酮长效制剂，每月注射一次，每次250 mg，疗程4个月。
继发性性腺功能低下患者，可用促性腺激素药物治疗，如人绒毛膜促性腺激素或人绝经期促性腺激素。在睾酮替代疗法期间，应注意药物副作用，如睾酮在体内芳香化为雌二醇，改变血清睾酮与雌二醇比值，可发生乳房触痛或男性乳腺女性化；外源性睾酮可抑制促性腺激素释放和睾丸精子生成，对未发育的继发功能低下患者应慎用。治疗期间应定期化验肝功能和血细胞计数，即时调整药物剂量。
常见的导致高泌乳素血症的病理原因，包括：垂体腺瘤、药物、原发性甲状腺功能低下、慢性肾功能衰竭、吸烟及特发性高泌乳素血症。高泌乳素血症伴有血睾酮水平低下及促性腺激素水平低下者，患垂体腺瘤的可能性极大。泌乳素细胞瘤占垂体腺瘤的30%，可直接造成泌乳素分泌过多。雌激素、氮丙嗪、奋乃静、丙咪嗪、安定、利血平、甲基多巴、甲氰咪呱等药物，使泌乳素水平有中等程度增高，它们可能直接刺激垂体前叶，也可能破坏多巴胺抑制泌乳素分泌细胞的作用，使泌乳素水平异常增高，但这时并不伴有其他激素水平的异常，原发性甲状腺激功能低下时，下丘脑释放的促甲状腺激素释放激素增多，后者兼有促进垂体泌乳素分泌的作用，故可导致高泌乳素血症。
慢性肾功能衰竭，可能影响中枢神经系统对泌乳素的调节，降低泌乳素细胞对抑制因素的敏感性，减少肾脏对泌乳素的排泄，从而导致泌乳素水平异常增高。高泌乳素血症引起阳痿的原因，可能与抑制了促性腺激素的释放，降低垂体反应性及减少睾酮生成并导致血睾酮水平降低有关。一般在未使泌乳素水平恢复到正常之前，单纯补充睾酮制荆是不能奏效的，这样的高泌乳素血症，对中枢神经系统也有直接作用。高泌乳素血症，引起的阳痿的机制尚未阐明，治疗只能针对高泌乳素血症的不同病因，如停药、戒烟、手术切除垂体微小腺瘤。多巴胺药物、溴隐亭是治疗高泌乳血症有效药物，但停药后泌乳素水平还会再度升高，所以需要长期药物观察治疗。
虽然睾酮的产生并没有因为甲亢而增高，但甲亢患者的睾酮水平确实增高，由于甲亢患者的睾酮结合蛋白增高，所以测出睾酮相应增高。临床上70%甲亢患者有性欲降低，勃起功能明显障碍，这些年龄较大的男性表现为“性冷漠型”甲亢，多不伴有典型的B肾上腺素能的表现，如脉率快、震颤、体重减轻等症状。
男性到了50岁左右，血睾酮水平开始下降，但70岁以上男性中，有25%- 30%的人血睾酮水平低于正常范围。睾酮结合蛋白水平随年龄而增高，于是具有生物活性的未与蛋白相结合的游离睾酮，反而明显降低。活性更强的双氢睾酮的游离部分水平也随年龄增长衰老而明显降低，但总的双氢睾酮水平降低则不明显。老年男性对人绒毛膜促性腺激素的睾酮反应明显低于年轻男性。老年男性血清总雌二醇水平正常或略增高，而游离水平保持正常。这样游离睾酮与游离雌二醇之比率将降低，这一比例对男性勃起功能来说是最重要的影响因素。这些变化也反映，在男性的垂体促性腺激素LH和FSH水平，在40 - 70岁之间将有轻度增高，到70岁以后，二者将显著增高，意味着睾酮水平的显著下降。
有趣的是由激素水平反映出来的勃起功能变化，要比性欲的变化明显，也即是老年男性在激素水平降低后，阴茎夜间勃起功能受累明显，而性欲仍保持较高的水平。在女性也是如此，在性功能下降同时性欲可以保持不变。
老年男性勃起功能减退，有20%可归咎于激素水平的下降。但营养状态，微量元素锌缺乏，对老年男性阳痿中也起到一定作用，如与睾酮合成有关的锌元素的血浓度可以下降。给血液透析的后人补充锌制剂，可以使勃起功能有所增强。有近40%阳痿患者的血中锌水平低下，与锌水平正常的阳痿患者相比，其睾酮的水平也降低。
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