看院士团队如何做circRNA研究

CircMTO1作为miR-9海绵抑制肝细胞癌的进程

Circular RNA MTO1 acts as the sponge of miR-9 to suppress hepatocellularcarcinoma progression

非编码RNA在癌症生物学中有非常重要的作用。本文介绍了来自中科院院士曹雪涛课题组发现的肝细胞癌中两个非编码RNA相互作用，调控抑癌基因p21的表达，对癌症的发展和预后产生关键影响。

作者在肝细胞癌病人的芯片数据中发现显著下调的CircRNA——CircMTO1，并发现随癌症分期的发展和预后的不良，CircMTO1的表达越低。作者将CircMTO1作为兴趣分子，分析其海绵作用的miRNA，发现CircMTO1在肝癌细胞中与miR-9结合，同时通过CircMTO1和miR-9的过表达（干涉）及抑制miR-9的表达双向证明CircMTO1可以抑制肝癌细胞的增殖和侵入，并增加细胞凋亡，其下游靶标是p21。最后在小鼠体内完成了进一步的验证。

具体结果如下：

1

临床组织筛选及验证

肝细胞癌病人中CircMTO1表达显著下调，并随其恶化下调更加明显。

2

潜在功能机制分析

RIP发现CircMTO1在肝癌细胞中与miR-9结合。

3

功能机制验证

CircMTO1和miR-9的互作影响p21的表达，即发现了以下的调节方式。

3.1 过表达miR-9，或干涉CircMTO1，癌细胞增殖能力提高，凋亡减少，p21下调；加外源CircMTO1后，出现相反的变化。

3.2干涉CircMTO1的表达，p21下调，同时抑制miR-9的表达，p21的下调趋势被逆转；相应的细胞增殖和凋亡也随p21的变化而变化。

4

体内验证实验的结果

提出CircMTO1可作为HCC治疗靶点的理论建议。

思路总结

1. 利用高通量筛选和QPCR验证手段，获得兴趣circRNA；

2. 以CircRNA—miRNA—mRNA为蓝图，从差异表达的分子入手，筛选相互作用的miRNA，探讨circRNA机制；

3. 筛查下游mRNA分子，阐明circRNA ceRNA机制并验证其在体内外功能。

永诺生物原创作品，转载请注明出处