《伤寒杂病论》是我国第一部有作者署名的医学典籍，也是第一部将医经与经方相融达到理法方药齐备的中医典籍，是中医内科的鼻祖。能与之相提并论的中医典籍只有皇浦谧的《针灸甲乙经》，《针灸甲乙经》是一本将医经与腧穴主治相融达到理法方穴齐备的中医典籍，因后世中药比针灸起到的作用更大，用中药治病的医者比针灸治病的医者多，故《伤寒杂病论》的影响远远超过了《针灸甲乙经》（白水将会在《素问》《灵枢》读书笔记中谈谈《针灸甲乙经》的成就）。
《素问》《灵枢》将疾病按经络分类、按脏腑分类、按病因病机分类，经络论病、脏腑论病，虽有联系，但不紧密与系统。《伤寒杂病论》将外感疾病按六经分类，然后根据脉证再细分论治；将杂病主要根据脏腑与病因病机病位分类论治。外感病六经论治里包含脏腑与病因病机病位论治，杂病脏腑与病因病机病位论治里也含有六经论治。
《素问·热论》按巨阳、阳明、少阳、太阴、少阴、厥阴传变论治热病，《素问·刺热》按脏腑论治热病。
《素问·热论》说：今夫热病者，皆伤寒之类也，或愈或死，其死皆以六七日之间，其愈皆以十日以上者。 张仲景在《伤寒杂病论》序中说：余宗族素多，向余二百。建安纪年以来，犹未十稔，其死亡者，三分有二，伤寒十居其七。古代，热病又名伤寒，就是外感疾病，表明外感疾病在古代不仅发病率高，而且死亡率也很高，医者不研究不行。古人讲“其死皆以六七日之间，其愈皆以十日以上者”，还说“两感于寒而病者，必不免于死”，都表明邪盛则死，体质强熬过七天，邪轻正胜则活。古人讲六日后经行尽矣而愈，当然是胡乱推理。
《伤寒论》中说辨太阳病脉证并治，讲的是以辨病为纲，以辨脉证为目。太阳病、少阳病、阳明病、少阴病、太阴病、厥阴病，按三阴三阳分类给疾病命名，就象西医按系统命名疾病一样，有消化系统疾病、呼吸系统疾病等，消化系统疾病可细分胃炎、胃溃疡等疾病，中医的太阳病也可分为太阳中风、太阳伤寒等疾病。《伤寒论》中桂枝是治疗太阳病的主打药，柴胡是治疗少阳病的主打药，大黄是治疗阳明病的主打药，然后，有桂枝汤证、麻黄汤证、小柴胡汤证、大承气汤证等。
《伤寒论》在传承《素问》《灵枢》《难经》的基础上进行了理论创新，向前行进了一大步。
《伤寒论》的方药与《汤液经》有很密切的联系，陶弘景撰《辅行诀脏腑用药法要》里保存了《汤液经》的内容，学习《伤寒论》要参照《辅行诀脏腑用药法要》来理解。
《伤寒论》的用药剂量普遍比现代中医大一些，但《伤寒论》一方面视体质强弱用不同的药量，另一方面强调中病即止，有的用1剂，有的用二分之一剂，有的用三分之一剂，宁可浪费余下三分之二的药，也要保证驱邪不伤正；用药准确（辨病与辩证皆准确），1剂效果不显著，1日内可用2剂，一切皆以临床指针为准。
我们读《伤寒论》，既要学习张仲景六经辨病证理法方药的精髓，也要传承张仲景惟是惟新的精神，要结合当代科技的发展与疾病谱的变化，在传承以往中医理论与临证心得的基础上，对中医理论与临床规范进行创新，构建21世纪的中医基础理论与临床指南规范。
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