預防接種是防控肺炎球菌感染（包括耐藥菌感染）最有效的手段，大規模肺炎球菌疫苗接種引進的地區，肺炎球菌耐藥菌株已明顯減少。家長應在發病高風險期前積極預防，按照常規免疫接種程序，為嬰幼兒盡早接種疫苗，以保證每一個小寶寶及時獲得全面的保護，遠離肺炎球菌疾病的侵襲。
鑒于肺炎鏈球菌疾病造成的沉重的直接和間接疾病負擔，世界衛生組織（WHO）已將肺炎鏈球菌疾病列為 “需極高度優先” 使用疫苗預防的疾病之一。
其它預防方法：
母乳喂養打基礎，相關研究顯示，非純母乳喂養、營養缺乏以及室內空氣污染等可能是兒童人群患該病的危險因素。因此出生頭幾個月鼓勵純母乳喂養、鋅元素的補充等。
指導家長加強患兒的營養，培養良好的飲食習慣，充足的營養是改善兒童天然 防御功能的關鍵，要合理喂養，遵從輔食添加原則，由少到多，由稀到稠，由細到粗，由一種到多種，逐步過渡到固體食物，天氣炎熱或者嬰兒患病期間應暫停輔食的添加，注意 嬰兒首先添加的食物應是含鐵的米粉。
注意氣候的變化，在寒冷季節或氣候驟變時，注意給孩子添加衣物，防止感冒。
從小養成鍛煉身體的好習慣，經常戶外活動增強體質，但盡量不要帶小孩去人 多的地方，避免與傳染源接觸，家人患感冒時，要注意戴口罩，盡量不要和小孩接觸。 由于細菌常經由飛沫傳播，在家人或周圍兒童患流感等呼吸道感染性疾病時，要盡量減少接觸，避免交叉感染。在疾病流行期避免在人群較多的公共場所活動。
注意家長和孩子的手衛生，勤洗手，從小培養孩子良好的衛生習慣，不隨地吐 痰，避免使痰飛沫朝周圍噴射，防止病菌污染空氣而傳染給其他人。
家長學會處理呼吸道感染的方法，是患兒在疾病早期能得到及時的控制，定期健康檢查，按時預防接種。
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