公积金贷款是缴存住房公积金的职工享受的贷款，国家规定，凡是缴存公积金的职工均可按公积金贷款的相关规定申请个人住房公积金贷款。
商业贷款是具有完全民事行为能力的自然人，购买本市城镇自住住房时，以其所购买的产权住房(或银行认可的其他担保方式)为抵押，作为偿还贷款的保证而向银行申请的住房商业性贷款。
两者的区别：
贷款机构不同。个人住房商业贷款的贷款机构是各商业银行，而公积金贷款的主体是住房公积金管理中心。
贷款对象不同。个人住房商业贷款的对象是所有具有完全民事行为能力的人，而公积金贷款对贷款人要求严格，必须是住房公积金缴存人和在职期间缴存住房公积金的离退休职工。
贷款资金来源不同。个人住房商业贷款的资金来源各商业银行的自营资金，而住房公积金贷款来源是职工个人及所在单位缴存的住房公积金。
贷款利率不同。公积金的贷款利率比个人住房商业贷款利率低，5年以内首套公积金贷款为2.75%，5年以上是3.25%。而商业贷款利率五年以上贷款利率为4.9%，3-5年为4.75%，1-3年为4.75%。不同银行所执行的贷款利率在这个基准利率之上有所浮动。（请以各地方银行贷款利率为准）
贷款额度不同。商业贷款没有最高贷款额度的限制，而公积金贷款有限制。
放款时间和贷款手续不同。商业贷款放款较快，公积金贷款较慢。
贷款的用途不同。商业贷款可以用来买普通住宅和商业用房，但公积金贷款不能用来购买商业用房，只能用来买普通住宅，装修住宅或租房等。
