PCR 引物不用愁，一个网站全搞定

还在为设计 PCR or qPCR 引物耗损脑细胞吗？

还在为 P 不出条带而不断摸索条件费时费力吗？

还在为 P 出了条带，but，有 N 条条带而纠结痛苦吗？

下面，笔者将介绍一个神奇的网站，只有输入你想研究的基因名，就能找到合适的引物。

PrimerBank

PrimerBank 是一个 PCR 引物的公共数据库。 其引物可以用于 PCR 或 qPCR，共包含超过 306 800 个引物，涵盖大多数已知的人和小鼠基因。

有几种方法可以搜索 PrimerBank 上的引物：GenBank 登录号，NCBI 蛋白质登录号，NCBI 基因 ID，Gene Symbol，PrimerBank ID 或 Keyword。

下面将以 GAPDH 举例说明怎么利用 PrimerBank 来查找引物：

 

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打开网站主界面

 

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在 search for PCR primer 的 Search by 下拉菜单中选择想通过所查基因的什么信息来查找引物，一般知道基因名称的话，选择 NCBI gene symbol（如果不知道所查基因的基因名是否为 gene symbol，则选 Keyword。例如大家熟知的 β-acting，其 gene symbol，也就是官方大名其实是叫 ACTB）；

在 Species 中选择物种 human or mouse；

For text 中填入想查基因的 gene symbol；

之后，Submit；

可以看到针对 GAPDH 的不同对引物，具体序列，长度，Tm 值以及在其 cDNA 上位置等一些列信息

点击「Click here for cDNA and amplicon sequence」，可以得到这对引物扩增的片段序列及位置：

红色标记为上下游引物，蓝色标记为引物之间的扩增序列：