The-Human-Protein-Atlas 数据库

前段时间一直忙着考试，最近才赶上恢复自己的更新，在此感谢菜鸟图的所有人的包容与支持


切入正题
先看看人家长啥样吧网址：https://www.proteinatlas.org/

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The-Human-Protein-Atlas 介绍

Human Protein Atlas 数据库，它致力于提供全部24,000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息，并免费提供公众查询。创立这个数据库的瑞典 Knut & Alice Wallenberg基金会使用特制的抗体，用免疫组化的技术，检查每一种蛋白质在48种人类正常组织，20种肿瘤组织，47个细胞系和12种血液细胞内的分布和表达，其结果用至少576张免疫组化染色图表示，并经专业人员阅读和标引。这些受检组织来自144个不同个体和216个肿瘤组织，保证染色结果具有充分的代表性。

√“总结起来就是说提供人类蛋白质在组织和细胞的分布，并用免疫组化技术，检查每一种蛋白质在48种人类正常组织，20种肿瘤组织，47个细胞系和12种血液细胞内的分布和表达，其结果用至少576张免疫组化染色图表示，并经专业人员阅读和标引”

话不多说，我们直接实战吧，看看数据库怎样用吧

举个栗子，查询明星基因pten的表达情况

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接着出现下面界面

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从左到右分别是：基因，基因的描述，蛋白类别，组织，细胞，病理，亚细胞定位，RNA类别8列

点击组织，就出现该基因在不同组织的表达情况：（分为RNA表达和蛋白质表达）

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Splice variant（剪切异构体）

你会发现，PTEN存在两个剪切异构体，分别为PTEN-001，PTEN-005

点击人体组织表达图谱右侧组织名称，比如肾脏，可以查看组织免疫组化图。在网页的左侧显示标本信息以及蛋白亚定位。可以参考作为免疫组化的阳性对照

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点击细胞栏，可以查看基因在细胞系RNA表达水平，以及人类细胞系、小鼠细胞系中定位。在查看细胞定位的荧光图时，可以通过点击选择需要显示的内容：抗体，细胞核，微管等等。即可单独显示又可以叠加显示。

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点击肿瘤栏，可以查看基因在不同肿瘤样品中的蛋白表达情况，该数据库整合了TCGA，因此你可以看到在TCGA的表达情况。

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