代谢组学研究报告中应该提供的基本信息丨色谱 & 质谱

 

色谱方法相关的信息

大部分的以质谱为基础的代谢组学研究在样品引入时都需要与色谱仪器相连。因此在研究中提供详细的色谱参数非常必要，在这里就对色谱分离中应该提供的信息给出以下参考。

1. 色谱仪器的描述

• 生产厂家、产品型号、软件名称和版本

2. 自动进样器

• 进样注射器的型号/大小，软件版本，进样体积，清洗流程和溶剂

3. 分离色谱柱和预柱或保护柱

• 生产厂家，产品名称或编号，固定相组成（如：硅胶、C18等），物理参数（如：气相色谱柱的涂层厚度、液相色谱柱的粒径），色谱柱的内径和长度

4. 与技术相关的样本前处理过程

• 样品复溶的溶剂（如：用流动相复溶），进样量

• 衍生化反应的条件（如：衍生化试剂、生产厂家、反应温度和时间等）

• 内标的加入

5. 分离参数

• 方法的名称（可用于发表和引用的详细方法），进样器温度，分流和分流比，流动相组成，流速，压力，洗脱梯度

 

 

质谱方法的相关信息

• 质谱是在代谢组学应用中很普遍使用但是很复杂的一项技术。因此，为了保证实验的可重复性，需要研究者们在研究报告中提供详细的质谱参数，以下信息供参考。

1. 仪器描述

• 生产厂商，仪器型号，软件（名称、序列号、版本）

2. 样品引入

• 从气相色谱、液相色谱还是直接进样进行检测，如果是直接进样还需列出进样器的型号和流速

3. 离子源

• 电离模式（EI、APCI、ESI等），检测模式（正、负离子模式分析），真空度，电压（如：毛细管电压），气体流速（雾化气、锥孔气体等），离子源温度。虽然这些参数在不同的仪器上数值会有一些差异，但是研究者还是应该提供可以使实验得以重复的充足的参数信息。

4. 质量分析器和数据采集模式

• 质量分析器类型（四级杆、离子阱、飞行时间等，以及它们的联用形式如Q-TOF等），数据采集模式（fullscan、MSn、SIM、MRM等）

6. 与技术相关的样品前处理过程

• 样品复溶的溶剂（如：含有0.2%甲酸的甲醇:水 1:1溶液），衍生化方法，进样体积，内标物质的加入

7. 数据采集的参数

• 数据采集的日期，操作者，数据采集速度，质荷比范围，所使用的质量轴校正物质，质谱的分辨率和质量精度，质谱图采集频率，真空度，实时校正溶液（浓度，质核比，流速和采集频率）