（工具篇）S5E47：圣器之——基因功能分析

在前面的几期中，我们介绍了各种强大的神器，今天我们介绍的这个软件用神器已经不够形容其逆天的功能了，因为有了它，所谓的生信分析是如此的简单！   

高能预警：由于软件功能强大，所以本文图片较多。

这个圣器就是FunRich: Functional Enrichment analysis tool

网站：http://www.funrich.org/

软件主要完成基因功能注释：

看不懂没关系，我们看图：

下面我们举个例子，先下载软件：http://funrich.org/FunRich2.1.2.zip

下载后解压，找到这个FUNRICH的应用程序文件：

然后双击就出现了：

我们简单介绍下功能，首先导入数据：

这里导入的数据一般是编码基因列表，将结果复制进来即可：

同样的方法，我们再导入基因列表2和3：

数据导入成功后，我们下面看各种图的做法：

1. Venn图

调整Venn图的颜色、字体等参数：

2. GO、信号通路、组织表达等

选择Enrichment Analysis（富集分析）和基因列表1

OK后出现分析结果，在页面底部的不同页中包括了：GO分析的CC（Cellular Component），MF（Molecular Function）和BP（Biological Process），Biological Pathway信号通路，蛋白结构域分析、组织表达、转录因子结合和临床表型的结果：

每部分结果都可以打开查看并调整：

修改显示形式：

软件默认的是根据P值富集显示：

根据富集的Fold Change来显示：

基因在组织中的表达：

转录因子结合的富集：

临床表型富集：

3. 网络图

网络图的做法也很简单：

修改网路图的显示方式：

4. 热图

好了，这个圣器就介绍到这里了。

That’s all. Thank you!

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