新的一年，有没有立下新的 flag ？要不先实现个小目标，发个 NC、NG 的？没头绪？转录调控项目文章集锦，用实际行动告诉你如何稳住你的 flag 。
Targeting Epigenetic Crosstalk as a Therapeutic Strategy for EZH2-Aberrant Solid Tumors
靶向表观遗传串扰作为 EZH2- 异常实体瘤的治疗策略
发表杂志：Cell
影响因子：31.398
发表时间：2018年9月
图1 技术路线
肿瘤进展过程中，遗传学变化与表观学变化密切相关。与遗传学变化不同的是，表观遗传学的变化通常是可逆的。由此，通过靶向染色质修饰蛋白，可改变相应的异常表观现象。多梳抑制复合体2（PRC2）具有催化组蛋白 H3 的27位赖氨酸甲基化的酶活性。基于 PRC2 催化亚基 EZH2 开发的抑制剂，对一部分血液系统恶性肿瘤已经表现出不错的治疗效果，而在实体瘤中，只对少数具有 SWI-SNF 成员基因突变或者 BAP1 突变的肿瘤有治疗效果，对多数实体瘤治疗无效。如若明确肿瘤细胞对 EZH2 抑制剂（EZH2i）不敏感的分子机制，势必有利于进一步提高 EZH2i 在广谱实体瘤中的治疗效果，扩大其临床应用。
作者通过联合多种生物学方法揭示了 EZH2i 对大部分实体瘤治疗无效的分子机理。文中所展现工作的突破性不仅体现在多种实体瘤对 EZH2i 耐药机制的揭示，而且在此机制之上提出了可能的协同抑制表观遗传交互调控解决方案，并在多种肿瘤细胞中进行验证实验，突破性的扩大了 EZH2i 的临床肿瘤治疗范围，对当前 EZH2i 临床研究的困境破局具有重要的指导意义。
Armadillo repeat containing 12 promotes neuroblastoma progression through interaction with retinoblastoma binding protein 4
犰狳重复蛋白12与成视网膜细胞瘤结合蛋白4互作促进成神经细胞瘤的演进
发表期刊：Nature Communications
IF：12.353
时间：2018.07
图2 技术路线
成神经细胞瘤（neuroblastoma, NB）是儿科群体中最常见的恶性实体肿瘤之一，起源于神经嵴派生细胞，占据癌症造成的儿童死亡数的15%。NB 的临床表现具有显著的多样性，包括自行缓解、快速发展和死亡。对于高危 NB 患者，即使采用综合治疗法，其疗效依然不佳。目前为止，已经发现了多个可作为患者预后不良的标志性基因畸形现象，如染色体 1q 和 17q 区域的增加、MYCN 扩增和染色体 1p、3p 和 11q 区域的杂合性丢失。尽管如此，我们仍然有必要去探索 NB 的演进和侵袭性，以期改善患者的治疗效果。
LncRNAs in polyploid cotton interspecific hybrids are derived from transposon neofunctionalization
异源四倍体棉花的 lncRNA 起源于转座子的新功能化
发表期刊：Genome Biology
影响因子：13.214
时间：2018.11
图3 技术路线
种间杂交和多倍化过程是造成物种多样性的重要原因，但两者对非编码 RNA 的产生和表达的影响也少有研究。本文通过 lncRNA-seq、small-RNA-seq 等测序方式对四倍体棉花（Gossypium hirsutum）及其祖先种（G. arboreum、G. raimondii）、祖先组杂交 F1 代进行了高通量测序，研究了种间杂交和多倍化过程对 lncRNA 表达谱的影响。结果显示，种间杂交和多倍化过程引起了 lncRNA 转录的重排，这些 lncRNA 主要来源于活化的转座子区域，转座子区域的甲基化水平与 lncRNA 表达量的变化显著相关。另外，作者还发现四倍体棉花特有的 lncRNA XLOC_409583 参与调节了棉花幼苗的株高。结果表明，种间杂交和多倍化过程引起了 lncRNA 的新功能化，极大地丰富了物种多样性。
Exogenous adrenocorticotropic hormone affects genome-wide DNA methylation and transcriptome of corpus luteum in sows
外源性促肾上腺皮质激素对母猪黄体全基因组 DNA 甲基化和转录的影响
发表杂志：FASEB JOURNAL
影响因子：5.595
时间：2018.11
图4 技术路线
应激可引起黄体（CL）功能紊乱，应激激素在这一过程中起着重要作用。然而，其机制尚不清楚。本研究采用人工合成促肾上腺皮质激素（adrenocorticotropic hormone，ACTH）注射断奶7天的母猪。采用全基因组甲基化测序（WGBS）和 RNA 测序（RNA-sequencing）系统地研究 CL 中 ACTH 给药与 DNA 甲基化的联系及其与基因表达的关系。
篇幅有限，我们在2018年发表的文章远不止以上介绍的那几篇哟~小编对去年全年转录调控文章发表情况进行了总结：
表2 2018年转录调控业务线项目文章汇总
据不完全统计（要低调嘛）转录调控业务线2018累积发表文章数 32 篇，累积影响影子高达 258 。
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