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展现CRISPR潜力:药明康德与大学伙伴合作找到潜在新靶点

▎药明康德/报道

多发性骨髓瘤是一种病发于骨髓的血液癌症,在所有癌症病例中约占1%。目前,这种癌症有多类治疗方案,包括了自体干细胞移植、免疫调控类药物、蛋白酶体抑制剂、单克隆抗体、以及组蛋白去乙酰化酶抑制剂等。尽管这些具有不同机理的治疗方案极大改善了患者的预后,多发性骨髓瘤的耐药和复发依旧是亟待解决的问题。

近年来,以沙利度胺(thalidomide)、来那度胺(lenalidomide)、以及泊马度胺(pomalidomide)为代表的免疫调控类药物(IMiD)引起了业界的广泛兴趣。它们不仅在临床前试验中彰显了多发性骨髓瘤的治疗潜力,还在临床上取得了积极的疗效。从机理上看,这些药物能够激活CRL4CRBN泛素连接酶,靶向并降解癌细胞所必需的IKZF1与IKZF3,从而起到治疗作用。


顺着这一发现,参与本研究的科学家们利用CRISPR-Cas9技术,在多发性骨髓瘤细胞中进行了全基因组筛选,寻找能够进一步提高免疫调控类药物疗效的潜在靶点。首先,他们扩增了筛选所需的CRISPR慢病毒库,用于转染多发性骨髓瘤细胞。具体来看,这套CRISPR库能针对细胞内的19050条基因(每条基因被6条sgRNA所靶向)和1864条微RNA(每条微RNA被4条sgRNA所靶向),这能确保筛选的覆盖率。

转染之后,这些细胞被分为两组,一组接受泊马度胺,另一组接受DMSO作为对照。在接下来的3周里,研究人员们每周进行采样和深度测序分析,探索哪些基因和微RNA在敲除之后,会影响到泊马度胺对癌细胞的杀伤。

▲本研究的流程和初步筛选结果(图片来源:参考资料[1])

筛选结果表明,与泊马度胺的疗效关系最紧密的是CRBN基因,其编码的蛋白正是泊马度胺直接激活的对象,证明了这一筛选的可靠性。在CRBN之外,研究人员们也敏锐地发现,9个COP9信号体(COP9 signalosome)亚基中,有7个与免疫调控类药物的疗效有关,它们也顺理成章地成为了科学家们的研究重点。

为了确认这一筛选结果是否具有可重复性,研究人员们又在多发性骨髓瘤细胞中单独敲除了编码这7个亚基的相应基因。后续的研究表明,这些基因的缺失,的确会让癌细胞对泊马度胺和来那度胺这两种药物产生抗性,而背后的机理可能是降低CRBN的表达水平。304位人类患者的数据也佐证了这一点:临床数据表明,CSN亚基的表达水平,与CRBN基因的表达水平呈正相关。

这又是为什么呢?进一步的研究发现,原来CSN能防止CRBN被降解,起到稳定后者的作用,从而让免疫调控类药物更为有效。而如果利用类似的机理,使用bortezomib等蛋白酶体抑制剂来避免CRBN的降解,也可以让多发性骨髓瘤细胞对药物更为敏感。这不仅为CSN的作用机理提供了有力支持,还表明免疫调控类药物与蛋白酶体抑制剂有潜力作为组合疗法,产生协同效果。

▲本研究的示意图(图片来源:参考资料[1])

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