在临床中我们经常遇到这样的情况，究竟是选择先证者单人基因还是一家三口（trio）基因检测呢？哪一种检测策略对患者更有利？游侠仅从自己理解的角度浅谈一点感想与体会。
首先从优势与劣势上来看，trio测序相比单人来说，数据分析更简单一点，通过寻找新发突变和复合杂合突变/纯合突变基因，即使临床表型不是非常完整与准确，通过这些有限的符合遗传模式的基因也能反推临床表型，从而作出临床诊断。而trio检测最大的劣势就是价格昂贵，虽然第三方检测机构也推荐trio检测并相应降价，但价格仍是单人检测价格的2倍左右。
作为临床来说，如何选择单人or trio还是要看性价比，即花最少的钱获得最多的阳性检出率。根据这一原则游侠认为以下情况更适用于单人检测：
一、临床诊断相对比较明确而且致病基因不多的情况下，比如结节性硬化、苯丙酮尿症，在这里临床医生自身的经验非常关键，可能有些医生认为就是智力低下，而专科医生可以细分到更细的分类；
二、临床与遗传分析紧密配合的情况下，比如医院自己开展的基因检测，这种情况下通过表型分析候选基因的范围可以大大缩小；
三、患者家庭经济条件有限，这时候可以选1~2个候选基因进行验证，比如上海儿童医学中心采用单人医学全外就取得了不错的临床诊断效果和社会价值，相关文章发表于genetics in medicine，但这个对人员分析能力要求非常高；
四、检测结果时效性要求不高的情况下，比如儿童或成人遗传病，而新生儿结果时效性要求高明显不太适合；
五、家系中除了孩子患病父/母同时患相同遗传病，这种情况下trio检测的能力相比单人提高不是非常大，性价比不高，不建议trio检测。
而trio检测则是以上相反的情况，而且trio还可以发现新候选致病基因，有些时候对于罕见突变类型，如同义突变和非编码区，通过新发突变或复合杂合分析可以提示与疾病相关性。另外特别提醒单人二代测序，父母一代验证新发突变，如果不做亲缘鉴定，只能使用中等致病性证据PM6而trio WES可以分析亲缘关系，可以使用强致病性证据PS2。当然在前天遗传咨询分会上“临床全外第一人”杨亚平教授认为如果一代测序同时验证了2个分别来自父母你的罕见变异也可以近似地认为其具有一级亲缘关系。
最后提醒，trio测序也要一代验证，二代测序发现致病位点而一代测序检测为假阳性的情况并不少见。
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