近些年,随着分子生物学的研究发展,肿瘤分子靶向治疗已成为临床肿瘤治疗的热点,临床实践已证实肿瘤分子靶向治疗理论的正确性和可行性。与传统的放、化疗等肿瘤治疗方法相比,肿瘤的分子靶向治疗特异性强,疗效明显、人体对药物的耐受性好,且毒副反应也较小。肿瘤分子靶向治疗中,选择一个有效的分子靶点(分子标志物)非常重要,前面我们已经介绍过一部分肿瘤常见分子标志物:
今天,继续跟大家分享最新版生物标志物:肿瘤常见分子标志物之 RET。
RET基因是个原癌基因,全称是:Rearranged during transfection proto-oncogene。RET负责编码的是一种受体酪氨酸激酶,它是一种跨膜蛋白,由胞外区、跨膜区和胞内酪氨酸激酶活性区三部分组成。受体酪氨酸激酶在正常器官和成年组织类型中起到维护的作用,当RET基因出现点突变或基因重排时,便会驱动肿瘤的发生。
人类RET基因图谱在10q11.2上,由21个外显子组成,估计大小约为55 kb。RET的生理配体属于神经胶质细胞源性神经营养因子(GDNFs)家族,该家族共包括 neurturin、persephin、artemin及 GDNF 四个成员。RET的激活是由 GFRα 1/2/3/4 四个受体和GDNFs 四个配体之间的相互作用来完成,GFRα能特异性地结合GDNFs家族成员,促使RET蛋白受体的磷酸化并使RET进入激活状态,激活与细胞增殖,迁移和分化有关的下游信号通路:一条是Ras/Raf/MEK/ERK-MAPK 通路,另一条是 PI3K/Akt/mTOR 通路。其他通路还有:PLC-γ通路,JAK-STAT通路等。
▲ RET:受体酪氨酸激酶与多个配体
▲ RET下游通路激活途径
无配体刺激的野生型RET,是正常的RET结构。RET突变广泛存在于各大癌种中,其突变模式繁多,常见的变异情况有六种:
⑴ RET的突变:EC区域(胞外结构域)的 RET突变;IC区域(胞内结构域)的 RET突变;TK区域(激酶结构域)的 RET突变;
⑵ RET的重排;
⑶ RET的融合;
⑷ RET的扩增;
⑸ RET的CNV Gain;
⑹ RET的CNV Loss。
▲ 人类癌症中RET常见变异情况:突变与重排
2017年《Clin Cancer Res》发表的在4871例已测序的癌症中,发现 RET变异总体频率为 1.8% 。
RET基因改变最常见的是突变(38.6%)> RET融合(30.7%)> RET扩增(25%)> RET重排(3.4%)> RET CNV Gain(1.1%)= RET CNV Loss(1.1%)。
▲ RET在癌症中的变异频率
RET变异广泛存在于各大癌种中,主要存在RET变异的肿瘤有:
⑴ 乳头状甲状腺癌(PTC:7%~27%);
⑵ 甲状腺髓样癌(MTC:40%~80%);
⑶ 未分化甲状腺癌(ATC:4%~16.7%);
⑷ 多发性内分泌瘤 IIA/IIB型(MEN2A/B:>98%);
⑸ 非小细胞肺癌(NSCLC:0.7%~2%);
⑹ 嗜铬细胞瘤/副神经节瘤(3%~6%)。
很少发生在其他实体肿瘤中。
▲ 不同肿瘤的RET变异类型
▲ NSCLC与RET变异关系
▲ 甲状腺癌与RET变异关系
RET基因变异通常在MTC、MEN2A/B、PTC、NSCLC、CML等肿瘤中广泛存在,并且不同癌种的RET突变类型及频率差异较大(见下图):
▲ 常见RET变异癌种的分布情况
⑴ 预测RET抑制剂的临床疗效;
⑵ RET突变与甲状腺髓样癌(MTC)预后负相关。
⑶ 遗传性RET突变与多发性内分泌瘤 IIA/IIB型(MEN2A/B)及家族性甲状腺髓样癌(FMTC)相关;
⑷ 在其他肿瘤中出现RET突变,不要紧张,只有一小部分是RET激活突变,大部分都不是激活突变。
目前并没有官方所批准的RET靶向抑制剂,但同时有可抑制RET的其他激酶抑制剂正处于临床试验当中。RET抑制剂大致分为两类:选择性RET抑制剂和非选择性RET抑制剂。
⑴ 选择性RET抑制剂:
LOXO-292:美国FDA授予了 Loxo Oncology 在研药物 LOXO-292 突破性疗法认定,用于治疗:
1、在接受含铂类化疗以及PD-1或PD-L1肿瘤免疫疗法治疗后病情进展、需要全身治疗转移性RET融合阳性非小细胞肺癌(NSCLC)患者。
2、既往接受治疗后病情进展且没有可接受的替代治疗选择、需要系统治疗的RET突变型甲状腺髓样癌(MTC)患者。
BLU-667:美国FDA授予了 Blueprint Medicines 在研药物 BLU-667 突破性疗法认定,用于系统治疗:
没有其它可替代治疗方案的RET突变甲状腺髓样癌(MTC)的治疗。
⑵ 非选择性RET抑制剂(多靶点抑制剂):
Cabozantinib:卡博替尼;
Vandetanib:凡德他尼。
▲ NSCLC的RET抑制剂临床试验
⑴ 对于甲状腺癌患者,细针穿刺(FNA)细胞学检测结果不确定的可以受益于特异的分子检测(如RET/PTC),有助于治疗方案的决策选择;
⑵ 临床表现与MTC一致的患者应筛选生殖系RET突变;
⑶ 复发时,分化型甲状腺癌(如PTC)患者应考虑行RET融合检测;
⑷ 对于肺癌患者,不建议在临床试验之外进行常规的RET独立检测;
⑸ RET应该包含在更大的检测panel中(例如:NGS panel),并且在EGFR、ALK和ROS1的常规检测为阴性的情况下,应该尝试做RET的检测。同时,回顾性NGS检测研究发现,RET融合和其他的基因改变并非相互排斥,是可以共存的。
⑹ RET的变异类型有很多,其中融合占有重要的意义,其Partners有多种。
▲ RET融合伙伴的多样性
RET融合的检测方法主要有 IHC,FISH,RT-PCR ,表达不平衡,DNA-NGS及RNA-NGS 六种:
❶ IHC检测:
优势:可以本地进行检测;
缺点:使用组织进行检测,将有显著的假阳性(FP)或假阴性(FN)。
❷ FISH检测:
优势:可以本地进行检测;
缺点:对于检测结果的解释具有挑战性,RET阳性的标准cutoff值(比如 ALK FISH);使用组织进行检测,将有显著的假阳性(FP)或假阴性(FN)。
▲ NSCLC中使用IHC或FISH检测RET融合的FP或FN率
❸ RT-PCR:
优势:快速、相对便宜;
缺点:不能检测未知的融合partners。
❹ 表达不平衡:
优势:快速、相对便宜;
缺点:要高度专业化的仪器和解释。
▲ RET表达不平衡检测
❺ DNA-NGS:
优势:检测各种融合的同时,可以获取基因突变的信息;
缺点:一些内含子区域覆盖很低。
❻ RNA-NGS:
优势:不存在内含子覆盖不到的问题;
缺点:高度依赖RNA的质量。
最后小编进行一个 RET融合 检测的技术总结:
IHC 不推荐使用;
FISH 极少数情况下推荐使用;
RT-PCR 推荐使用;
表达不平衡 推荐使用,尤其是评估多激酶融合情况;
DNA-NGS 推荐使用;
RNA-NGS 推荐使用。
▲ RET常见6种检测方法的优劣势对比
同时,常见RET重排的检测取决于标本的类型,新鲜或快速冷冻组织或FNA标本首选RT-PCR技术, FFPE组织首选FISH技术。FNA样品也可以使用多种多样的多重检测检测方法进行分析,包括NGS技术。
▲美国商业上可用的RET NGS检测产品
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