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最新版生物标志物丨肿瘤常见分子标志物之 RET

近些年,随着分子生物学的研究发展,肿瘤分子靶向治疗已成为临床肿瘤治疗的热点,临床实践已证实肿瘤分子靶向治疗理论的正确性和可行性。与传统的放、化疗等肿瘤治疗方法相比,肿瘤的分子靶向治疗特异性强,疗效明显、人体对药物的耐受性好,且毒副反应也较小。肿瘤分子靶向治疗中,选择一个有效的分子靶点(分子标志物)非常重要,前面我们已经介绍过一部分肿瘤常见分子标志物:

1,肿瘤常见分子标志物之BRCA1/2

2,肿瘤常见分子标志物之EGFR

3,肿瘤常见分子标志物之BRAF

4,肿瘤常见分子标志物之ALK/ROS1

5,肿瘤常见分子标志物之MSI/MMR

6,肿瘤常见分子标志物之PD-L1

7,肿瘤常见分子标志物之IDH1/IDH2

8,肿瘤常见分子标志物之TP53/del 17p

9,肿瘤常见分子标志物之 TRK

10,肿瘤常见分子标志物之FLT3

11,肿瘤常见分子标志物之RET/FGFR1-4

12,肿瘤常见分子标志物之RAS

13,肿瘤常见分子标志物之EGFR(新)

14,肿瘤常见分子标志物之PIK3CA

15,肿瘤常见分子标志物之MET

16,肿瘤常见分子标志物之HER2

17,肿瘤常见分子标志物之FGFR

18,肿瘤常见分子标志物之TMB(1)

19,肿瘤常见分子标志物之TMB(2)

20,肿瘤常见分子标志物之TMB(3)

21,肿瘤常见分子标志物之Neoantigen

22,肿瘤常见分子标志物之HLA

23,肿瘤常见分子标志物之DDR

24,肿瘤常见分子标志物之NTRK(1)

25,肿瘤常见分子标志物之NTRK(2)

26,肿瘤常见分子标志物之NTRK(3)

今天,继续跟大家分享最新版生物标志物:肿瘤常见分子标志物之 RET。

RET基因是个原癌基因,全称是:Rearranged during transfection proto-oncogene。RET负责编码的是一种受体酪氨酸激酶,它是一种跨膜蛋白,由胞外区、跨膜区和胞内酪氨酸激酶活性区三部分组成。受体酪氨酸激酶在正常器官和成年组织类型中起到维护的作用,当RET基因出现点突变或基因重排时,便会驱动肿瘤的发生。

人类RET基因图谱在10q11.2上,由21个外显子组成,估计大小约为55 kb。RET的生理配体属于神经胶质细胞源性神经营养因子(GDNFs)家族,该家族共包括 neurturin、persephin、artemin及 GDNF 四个成员。RET的激活是由 GFRα 1/2/3/4 四个受体和GDNFs 四个配体之间的相互作用来完成,GFRα能特异性地结合GDNFs家族成员,促使RET蛋白受体的磷酸化并使RET进入激活状态,激活与细胞增殖,迁移和分化有关的下游信号通路:一条是Ras/Raf/MEK/ERK-MAPK 通路,另一条是 PI3K/Akt/mTOR 通路。其他通路还有:PLC-γ通路,JAK-STAT通路等。

▲ RET:受体酪氨酸激酶与多个配体

▲ RET下游通路激活途径

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RET变异类型

无配体刺激的野生型RET,是正常的RET结构。RET突变广泛存在于各大癌种中,其突变模式繁多,常见的变异情况有六种:

⑴ RET的突变:EC区域(胞外结构域)的 RET突变;IC区域(胞内结构域)的 RET突变;TK区域(激酶结构域)的 RET突变;

⑵ RET的重排

⑶ RET的融合

⑷ RET的扩增

⑸ RET的CNV Gain

⑹ RET的CNV Loss

▲ 人类癌症中RET常见变异情况:突变与重排

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RET变异发生率

2017年《Clin Cancer Res》发表的在4871例已测序的癌症中,发现 RET变异总体频率为 1.8% 。

RET基因改变最常见的是突变(38.6%)> RET融合(30.7%)> RET扩增(25%)> RET重排(3.4%)> RET CNV Gain(1.1%)= RET CNV Loss(1.1%)

▲ RET在癌症中的变异频率

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适用肿瘤类型

RET变异广泛存在于各大癌种中,主要存在RET变异的肿瘤有:

⑴ 乳头状甲状腺癌(PTC:7%~27%);

⑵ 甲状腺髓样癌(MTC:40%~80%);

⑶ 未分化甲状腺癌(ATC:4%~16.7%);

⑷ 多发性内分泌瘤 IIA/IIB型(MEN2A/B:>98%);

⑸ 非小细胞肺癌(NSCLC:0.7%~2%);

⑹ 嗜铬细胞瘤/副神经节瘤(3%~6%)。

很少发生在其他实体肿瘤中。

▲ 不同肿瘤的RET变异类型

▲ NSCLC与RET变异关系

▲ 甲状腺癌与RET变异关系

RET基因变异通常在MTC、MEN2A/B、PTC、NSCLC、CML等肿瘤中广泛存在,并且不同癌种的RET突变类型及频率差异较大(见下图):

▲ 常见RET变异癌种的分布情况

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RET临床意义

⑴ 预测RET抑制剂的临床疗效;

⑵ RET突变与甲状腺髓样癌(MTC)预后负相关。

⑶ 遗传性RET突变与多发性内分泌瘤 IIA/IIB型(MEN2A/B)及家族性甲状腺髓样癌(FMTC)相关;

⑷ 在其他肿瘤中出现RET突变,不要紧张,只有一小部分是RET激活突变,大部分都不是激活突变。

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当前RET抑制剂

目前并没有官方所批准的RET靶向抑制剂,但同时有可抑制RET的其他激酶抑制剂正处于临床试验当中。RET抑制剂大致分为两类:选择性RET抑制剂非选择性RET抑制剂

⑴ 选择性RET抑制剂:

LOXO-292:美国FDA授予了 Loxo Oncology 在研药物 LOXO-292 突破性疗法认定,用于治疗:

1、在接受含铂类化疗以及PD-1或PD-L1肿瘤免疫疗法治疗后病情进展、需要全身治疗转移性RET融合阳性非小细胞肺癌(NSCLC)患者

2、既往接受治疗后病情进展且没有可接受的替代治疗选择、需要系统治疗的RET突变甲状腺髓样癌(MTC)患者

BLU-667:美国FDA授予了 Blueprint Medicines 在研药物 BLU-667 突破性疗法认定,用于系统治疗:

没有其它可替代治疗方案的RET突变甲状腺髓样癌(MTC的治疗。

⑵ 非选择性RET抑制剂(多靶点抑制剂):

Cabozantinib:卡博替尼;

Vandetanib:凡德他尼。

▲ NSCLC的RET抑制剂临床试验

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RET检测方法与平台

⑴ 对于甲状腺癌患者,细针穿刺(FNA)细胞学检测结果不确定的可以受益于特异的分子检测(如RET/PTC),有助于治疗方案的决策选择;

⑵ 临床表现与MTC一致的患者应筛选生殖系RET突变;

⑶ 复发时,分化型甲状腺癌(如PTC)患者应考虑行RET融合检测;

⑷  对于肺癌患者,不建议在临床试验之外进行常规的RET独立检测;

⑸ RET应该包含在更大的检测panel中(例如:NGS panel),并且在EGFR、ALK和ROS1的常规检测为阴性的情况下,应该尝试做RET的检测。同时,回顾性NGS检测研究发现,RET融合和其他的基因改变并非相互排斥,是可以共存的。

⑹ RET的变异类型有很多,其中融合占有重要的意义,其Partners有多种。

▲ RET融合伙伴的多样性

RET融合的检测方法主要有 IHC,FISH,RT-PCR ,表达不平衡,DNA-NGS及RNA-NGS 六种:

❶ IHC检测:

优势:可以本地进行检测;

缺点:使用组织进行检测,将有显著的假阳性(FP)或假阴性(FN)。

❷ FISH检测:

优势:可以本地进行检测;

缺点:对于检测结果的解释具有挑战性,RET阳性的标准cutoff值(比如 ALK FISH);使用组织进行检测,将有显著的假阳性(FP)或假阴性(FN)。

▲ NSCLC中使用IHC或FISH检测RET融合的FP或FN率

❸ RT-PCR:

优势:快速、相对便宜;

缺点:不能检测未知的融合partners。

❹ 表达不平衡:

优势:快速、相对便宜;

缺点:要高度专业化的仪器和解释。

▲ RET表达不平衡检测

❺ DNA-NGS:

优势:检测各种融合的同时,可以获取基因突变的信息;

缺点:一些内含子区域覆盖很低。

❻ RNA-NGS:

优势:不存在内含子覆盖不到的问题;

缺点:高度依赖RNA的质量。

最后小编进行一个 RET融合 检测的技术总结:

IHC 不推荐使用

FISH 极少数情况下推荐使用

RT-PCR 推荐使用

表达不平衡 推荐使用,尤其是评估多激酶融合情况

DNA-NGS 推荐使用

RNA-NGS 推荐使用

▲ RET常见6种检测方法的优劣势对比

同时,常见RET重排的检测取决于标本的类型,新鲜或快速冷冻组织或FNA标本首选RT-PCR技术 FFPE组织首选FISH技术FNA样品也可以使用多种多样的多重检测检测方法进行分析,包括NGS技术


▲美国商业上可用的RET NGS检测产品

参考资料:

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