导读
基因检测指导下NSCLC靶向治疗已成为临床常规。然而，对于晚期肺癌患者，可以用于分子检测的活检标本或细胞学样本非常有限。超声内镜引导下的经支气管针吸活检术（EBUS-TBNA）常用于肺癌的诊断，且具有微创、高敏感性和特异性等优点，因此EBUS-TBNA也可作为NSCLC基因检测的一种样本来源，但现有关于EBUS-TBNA标本检测的报道多是基于PCR、IHC、FISH等传统方法，其样本消耗量大，小标本几乎无法满足多基因检测的需求。
因此，本研究由上海胸科医院孙加源教授和燃石医学合作，利用燃石医学朗康®panel探索了NGS方法检测EBUS-TBNA淋巴结标本的可行性，同时比较了NGS同传统检测方法的性能差异，结果发现NGS检测EBUS-TBNA标本可提供更加全面的基因变异信息并可有效指导靶向治疗。该研究发表于Annals of Thoracic Surgery。
研究人群
该研究共入组了115例NSCLC患者的EBUS-TBNA标本，最终有85例非鳞NSCLC纳入分析。其中80例采用了传统方法进行基因检测，77例同时进行了NGS检测（3例因质控不合格被排除）。
研究结果
1. NGS可检出更多EGFR变异
在77例同时经过传统方法及NGS方法检测的样本中，两种方法同时检出变异的有41例，包括32例EGFR突变、8例ALK融合和1例ROS1融合，NGS方法与传统方法一致率100%。其中33例患者采用了靶向治疗，都取得了不错的疗效。此外，NGS方法额外检出了4个EGFR突变（包括T751_I759delinsS，E746_A750delinsV，G746_P753delinsIS和E746_T751delinsL），因为这些突变位点未被传统ARMS-PCR方法所覆盖。其中两例患者采用了厄洛替尼治疗，疗效SD，PFS为别为5个月和3个月。因此，NGS在三个传统基因的检测上可为患者提供更多靶向治疗的机会。
图1 NGS与传统方法检测一致性对比
2. NGS可展现肿瘤基因变异全景
在77例样本中，NGS方法共检出了252个基因变异，包括155个SNP、55个插入缺失、36个拷贝数变异和11个基因重排，TP53突变检出率高达70%；
同时，NGS可精确定位ALK融合断点和EGFR 19del位点；
NGS还检出了许多其它经典驱动基因变异，包括6例KRAS突变（两个G12V、三个G12C及一个Q61H）、1例BRAF突变（V600E）、1例RET融合（KIF5B-RET）和1例HER2扩增，其中BRAF V600E及RET融合为指南推荐可从靶向药物治疗中获益的靶点，而KRAS G12C已有临床证据表明可从目前的新药AMG 510治疗中获益；
另外还有1例EGFR L858R伴MET扩增及1例EGFR 19del伴KRAS扩增，合并变异可能对TKI治疗的疗效产生影响。
这些变异均得到了传统方法验证。因此，NGS检测结果可为临床决策提供更多的参考。
图2. NGS检出的77例样本突变图谱
小结和启发
随着精准医学的发展，越来越多的靶点可用于肺癌靶向治疗。因此，如采用传统方法进行多基因检测，则对组织样本量提出了极大的挑战，尤其是EBUS-TBNA这类小标本，更是难以实现。幸运的是，更加准确高效的NGS方法可以摆脱这一困境，只需少量样本，即可实现多基因的平行检测，而且NGS可以检出更多可靶的基因变异以及一些疗效预测因子，为临床治疗提供更多的选择，为患者带来更大的生存获益。当然，NGS作为一种新兴的技术，仍需要更多的临床实践，同时其较高的成本也限制了其临床应用，但正所谓“芳林新叶催陈叶，流水前波让后波”，随着技术的发展，NGS一定能大有作为！
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