西红柿的腋芽分生能力非常强，基本上每个腋芽都能成枝，尤其在夏季高温多雨、水肥充足的条件下，如果种植的是无限生长型品种或者是大棚种植的西红柿，不能及时进行整枝管理，那么西红柿就十分容易发生枝叶丛生密长、花果发育不良的徒长现象。
发生徒长的西红柿，无效生长的茎叶不仅会大量消耗植株根系吸收和叶片光合作用制造的养分，导致开花坐果所需营养不足而出现落花落果、果实个头小、果实畸形、产量低的问题，而且密生的枝叶会导致田间透风透光条件变差、土壤湿度变大，造成西红柿口感品质品质或诱发各种各样的病虫害。
所以，为了平衡西红柿的营养生长和生殖生长，为了培育健壮的植株、增强西红柿自身的抗病害和抗逆性能力，同时也为了提高西红柿的产量和品质，我们不仅需要适当适度稀植高架和合理进行水肥管理，更要在西红柿生长期内进行精细化的整枝管理，以此来合理分配养分、平衡植株生长，在为西红柿创造良好的生长环境的同时，可以控制病虫害发生、促进花果发育、提高坐果率、促进早熟上色、增加单果重、提高优质果采收量的目的。
西红柿整枝的方法比较多，单干整枝、一干半整枝、双干整枝、三干整枝、连续摘心换头整枝等几种是应用比较多的整枝方法，其中又以单干整枝法在西红柿整枝管理上使用的最多、最普遍。
但需要的是，西红柿整枝要掌握好时间，既不可过早，也不可过晚，最适合在植株第1花序已经开花或幼果开始发育时进行，此时整枝的好处在于可以更早、更多的节省养分集中供给花果发育；如果整枝过早，会抑制地下根系生长、影响地上枝叶生长剂坐果，如果整枝过晚，植株已经完成由营养生长向生殖生长的转化、整枝促果效果不明显。
1、单干整枝法
所谓单干整枝法，就是指每个植株只保留主茎1个主干，并把其他所有侧枝分次陆续疏除掉，等到主干留足果穗后进行打顶摘心，摘心一般需要在果穗上部留2-3片制造养分的功能叶。
2、一干半整枝法
所谓一干半整枝法，就是在单干整枝的基础上，再在第1花序下选留2个健壮侧枝，等到选留的侧枝坐住1穗果后，然后在在果穗上部留2片叶进行打顶摘心。这种整枝法能够提高早期产量、集中果实采收期、预防植株徒长，但操作起来比较麻烦。
3、双干整枝法
所谓双干整枝法，就是在单干整枝的基础上，除了保留主茎外，一般从第1花序下选留1个健壮侧枝作第2结果枝培养（一般多选留第1花序下的第1侧枝）。这种整枝法，虽然可以节省西红柿栽种的用种量和用苗数，也可以延长采果期和提高整体产量，但早期产量不高，也不利于果实早熟早上市。
4、三干整枝法
所谓三干整枝法，就是在双干整枝的基础上，除了保留第主茎和第1花序下的第1侧枝外，还要选留主茎第2花序下的第1个侧枝或者选留第2主干上第1花序下的第1侧枝，并把它当做第3结果侧枝培养。这种整枝法，在普通种植上比较少。
5、连续摘心换头整枝法
所谓连续摘心换头整枝法，就是在主茎第2花序开花后，在植株基部先留2-3片叶进行摘心，随后在主茎第1花序下选留1条健壮侧枝作第2结果枝培养，等到第2结果枝上的第2花序开花后，再对第2结果枝留2-3片叶进行摘心，并从第2结果枝的第1花序下选留1条健壮侧枝（一般选留第1花序下的第1侧枝）做第3结果枝培养；此后按以上方法进行整枝，一直整枝到植株上留足4-5个结果枝。这种整枝法，比较适合土壤水肥充足、果实个头比较小的品种类型使用。
需要注意的是，为了避免减少伤流和病菌侵害伤口，整枝应当在晴天时进行，而且在整枝后最好用百菌清、嘧菌酯等喷施保护伤口。
除了结果枝外，无花无果的侧枝生长不仅会消耗掉大量的养分，而且任由生长还会导致田间透风透光条件变差，所以应当及时把无用的侧枝疏除掉，以此来节省养分集中供给结果枝的生长发育，但打侧枝并不是所有的侧枝一长出来就应当立即疏除掉，否则会影响西红柿正常坐果和膨果。
对于西红柿来说，打杈的时机比较重要。一般来说，第一次打杈的时间应当掌握在侧枝长到5-6公分左右时进行最好，此后每次打杈的时间可以早一些，以每个花穗下的侧枝长到2-3公分左右时疏除掉最合适；此外，西红柿打侧枝建议不留桩，以防后期再在次叶腋出长出新的侧枝。
需要注意的是，西红柿打杈不适合在阴雨天和浇水后进行，最佳打杈时间是晴天上午9-11点叶面水珠自然风干后或者下午3-4天左右时进行。
对西红柿进行连续摘心，一方面能够合理调配养分、控制株高，另一方面能够增加坐果量、促使多结优质大果、促进尽快上色早熟、提高单个果重，是提高西红柿产量和品质的重要管理方法。
在对西红柿摘心时，第一次摘心可以在西红柿主茎第一花序开放后且第二、三花序即将看房后进行（此时可以在第二花序上选留2片叶片进行第一次摘心做第1结果侧枝，并从第一花序下选留1个健壮分枝；第二次摘心可以在第一花序下选留下的分枝上的第一花序盛开且第二花序即将盛开时进行，在分枝第二花序上选留2片叶进行摘心做第2结果侧枝，并从第2结果侧枝枝的第一花序下选留1个健壮分枝做第3结果侧枝。此时摘心按此方法依次进行，一直到植株上留足4-5个结果侧枝且有10穗左右果时为止。对于其他无用的侧枝应当全部疏除掉。
除以上连续摘心法以外，西红柿第一次也可以在主茎第一、二两个花序开放后进行，第二次摘心可以在侧枝长到6-8公分左右长时进行，每次摘心要在花序下选留一个结果侧枝，一直到留足4-5个结果侧枝为止
需要注意的是，每次摘心只要把西红柿枝秆顶部的生长点掐掉一小部分且顶部留2-3片叶即可，而且摘心的时间应当选择晴天时进行；此外，为了节省养分供给果实发育，西红柿摘心易早不易迟。
在结果期整枝打杈时，为了避免疏除侧枝时导致裂枝，同时为了使侧枝随着西红柿果实膨膨大下垂、最大化利用空间环境，可以在第1个结果侧枝上的第1花序坐住果（果实长到山楂大小时）且第2花序完成蘸花果实开始膨大时，选择晴天午后时，用手捏住侧枝的枝基部向左或向右轻轻扭半圈或者扭85-90度，然后向下轻轻按一下，以此来使该枝与向上生长基本枝保持垂直，此后的第2侧枝扭枝应当与第1侧枝扭枝方向相反，此后的其他侧枝扭枝应当方向交错进行。需要注意的是，对于扭枝后的结果侧枝，第1花序下可以在保留1片叶的基础上疏除掉其他叶。
西红柿摘叶疏叶管理，是抑制旺长、改善通风透光条件、促进优质果发育的重要方法，一般在西红柿生长中后期时使用，但它也需要一定的技术性，不可随意盲目的使用。
摘叶一般针对长势过旺的西红柿植株进行。对于长势过旺的植株（当第5穗花盛开后且从看不到果实，即为旺长），便可以在此时把哪些又长又大且覆盖果实的叶片摘除掉复叶或摘除掉半片叶，这样做的好处在于既能抑制旺长，又能避免发生空洞果的问题。
疏叶一般针对种植密度大、田间通风透光条件差的西红柿植株进行，主要目的为西红柿植株创造良好的通风透光环境、减少养分的无效消耗、控制田间病虫害的发生。在西红柿开始收获后，可以把已经采收果穗下面的叶片摘除掉，也可以在西红柿果实开始转色后分批陆续进行，重点摘除病叶、黄叶、老叶、遮光叶以及互相重叠的密生叶等。需要注意的是，西红柿疏叶要按照“去内不去外、去黄不去绿”的原则进行，每棵单株至少要保留10片左右的功能叶片，不可一次过量、过度的摘叶，否则会导致制造养分的叶片过少而影响果实膨大发育。
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