孙思邈积一生之精力，对唐以前之医学，无论是基础理论还是临床各科都进行了一次完整而系统的总结，撰写出《千金要方》和《千金翼方》两部巨著，对祖国医学的发展做出了极其卓越的贡献。孙氏认为生命的价值贵于千金，而一个处方能救人于危殆，价值更当胜于此，因而用《千金要方》作为书名，简称《千金方》，其内容可从四个方面加以论述：
《千金要方》 首列妇人方三卷，次列少小婴孺方二卷，说明孙氏非常重视与群众利益攸关的妇儿两科。在妇科方面，对胎前产后，月经不调，崩漏带下等病均有较系统的论述。这对宋代医家陈自明撰写《妇人大全良方》一书奠定了理论基础。在儿科方面，论述也非常精细。如对新生儿护理，产后拭口，窒崽处理，断脐手法，乳母的选择等内容都有现实意义。这对宋代医家钱乙撰写《小儿药证直诀》一书有很大的启发。.
对附骨疽（骨关节结核）的好发部位， 消渴（糖尿病）与痈疽的关系，有关麻风、脚气、甲状腺肿的描述和治疗等都有创见。还倡行了葱管导尿术、食道异物剔除术以及自家血、脓接种以防治疖病的免疫法等。还对针灸孔穴主治的论述，为针灸治疗提供了准绳，阿是穴的选用、“同身寸”的提倡，对针灸取穴的准确性颇有帮助。在疾病愈合之后提倡按摩、导引、散步、轻微劳动及食疗等结合，为治未病和防病复发留下了宝贵经验。
在《千金要方》中专有“食治”门，详细记载了谷、肉、果、菜在治疗疾病上的作用。提出“安身之本必滋于食，救疾之速必凭于药”，并说：“夫为医者，当须先晓医源，知其所犯，以食治之，食疗不愈然后用药。”认为食物确有“悦神爽志，以资血气”之功，“排邪而安脏腑”之能。如瘿病，孙氏认为这和长期饮用一种不好的水有关，劝人不要久居此地以防疾病发生，并以羊靥、鹿靥，或海藻、昆布等药食之，这些方法都是比较科学的。
孙氏强调综合疗法，对疾病采取针、灸、药综合运用的原则，以提高疗效。认为“良医之道必先诊脉处方，次即针灸，内外相扶，溺药攻其内，针灸攻其外，不能如此，虽有愈疾，兹为偶差，非医差也。”并批评当今医生有“各承一业，未能综练众方”的缺点。孙氏对一些复杂的疾病，如脚气等均采用针、灸、汤、散交替使用的方法，以提高和巩固疗效，防止疾病的复发。
孙氏《千金要方》收载方剂5300首，《千金翼方》载方2900余首，其收集方之多，可以说在唐以前是空前的。其收集范围也较广泛，除唐以前张仲景、华佗、 陈延之等20余家外， 对于散在民间的，如文人学士、达官贵族、宗教界、外国传入等都是他收集的范围。此外，孙氏又善于在古方的基础上创造和化裁新方。如在仲景当归生姜羊肉汤的基础上化裁出羊肉杜仲汤、羊肉当归汤、羊肉生地黄汤等四个方剂，以治疗妇人产后虚损诸证，丰富和发展了方剂学的内容。
在《千金翼方》一书中首论药物，按功用对药物进行分类是孙氏的一个创举。他非常强调药物的采集、炮制、和产地。认为“药物若不及时采集与朽木不殊”，记载“出药土地凡133州，合519种。”指出地道药材质量高，效果好，“地道”之说首见于孙氏此书。全书收集药物800余种。孙氏生前走遍陕西各大名山，亲自采药、制药，故被后世尊称为药王，并在陕西五台山树碑立庙以示纪念。
总之，孙氏对医学研究极为广泛，从巫法乱术到医德规范，从基础理论到临床各科，从先秦到唐代各家，从文献记载到民间经验，都是他研究的范围。所以，孙氏的学术不仅内容丰富，而且理法方药完整系统，故《千金要方》被称为我国最早的医学百科全书。无论对国内、国外的影响都是极其深远的。
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