生信SCI需要多少实验量？

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生信技能学习，是现在科研最好的自我投资！

生信SCI需要多少实验量？

生信SCI目前“干湿结合”是个大趋势了。肿瘤的必备实验验证，最少也需要qPCR。

1）收集患者的组织和相应的对照组织，通过免疫组化和免疫荧光或WB方法检测基因的蛋白表达情况。

2）细胞功能验证，干扰或过表达目标基因，检测细胞功能（也叫表型）变化。

3）需要在动物模型中干扰或过表达目标基因，然后检测动物中的功能指标变化。

4）机制实验属于拔高阶段，更多出现于高分文章中，一般3-5分文章做机制的还比较少见。并且，生信验证这类干湿结合思路，并不是以验证实验为主体，所以一般也不会做的很深入，即使涉及到一些机制也更多是简单的通路验证。

看看最近刚发表的几篇生信SCI，不同的研究方向，不同IF，对应需要多少实验量？

step 1：肿瘤方向

简单来说就是GEO筛选差异miRNA，再经过NB，SVM，RF等筛选。

qPCR（血清样本量不少，64 LUAD patients and 59 normal individuals）在这里也用来筛选了而不是明确靶标后的验证。

最后再结合PCA和AUC指标评估选出2个miRNA（miR-5100 and miR-663a）是LUAD合适的潜在靶点。

肿瘤的普遍都有简单实验验证，如qPCR。

IF高一些的，已经开始有功能实验。

step 2：非肿瘤方向

而差不多IF的非肿瘤小众疾病（类固醇诱导的股骨头坏死（SONFH）），还停留“纯生信”水平

。

pyroptosis-related（热点） GEO，GO/KEGG，PPI，ROC等筛选。生信分析也比较简单。不过发表对应的期刊也比较小众（BMC Musculoskelet Disord肌肉骨骼疾病），是疾病针对性期刊

。

3 的纯生信，多了molecular docking

而同个期刊，差不多同时发表，但是疾病是cancer，实验有cck-8, Scratch, transwell, invasion assays，好多功能实验。只能说肿瘤相比非肿瘤，太卷了

。

step 3：建议

非肿瘤的向肿瘤看齐就行。肿瘤的则要比目前发表的再多一些，这样才有竞争优势

。

再就是无论肿瘤还是非肿瘤，多关注自己疾病方向对应的期刊，这样好命中一些；再就是生信分析还得多出创新点才好发。尤其是最新发出的纯生信文章，是学习模仿的最佳资料

。

小结：生信这门技能，科研的应用越来越广！而越年轻的时候，能否有一些SCI打基础，对未来的发展差别还是很明显的，越早做打算越好，加油！

独学而无友则孤陋而寡闻，转发给你关心的朋友们~

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附录：生信SCI流程

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