怎样查找质粒图谱

这里讲一下如何查找质粒图谱。

最好的图谱就是NCBI和公司里提供的了，

第一步去NCBI查找，一般常用质粒都有了。然后以.db格式下载，再用Invitrogen的VectorNTI打开，就能得到一张很好的质粒图。

如果找不到，就去google，(baidu上比较不准)，最好加个pdf，找到公司的质粒介绍，那种图也不错。

如果还是找不到，就在google，baidu上查质粒的序列，把序列输入Invitrogen的VectorNTI，能够得到类似酶切的图谱，凑合着用吧，如果有序列信息，再自己添加也一样。

我就是这么查的，相信大家用的多数都是常用序列，查起来应该不难。

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一个查找质粒图谱的网站

网站名：www.addgene.org

 

简介：搜集整理各生物公司和实验室所构建质粒之图谱，以序列和图像的方式供研究者参考。质粒的长度，骨架来源，多克隆位点，启动子，插入片断等资料皆明晰可见；protocols、参考文献和诸多在线小工具配合质粒图谱构成基因克隆一揽子解决方案；还可以在线提供自己构建的质粒图谱，资源共享……关键中的关键，是速度快，和螺旋网不相伯仲

啰嗦几句：Plasmid Tools 中的Vectorpedia可以查询构建的空载体，也可以通过主页中的搜索寻找构建好的克隆。留意主页上的那些News，说不定就有你想要的（啰嗦的时候偶就看到了携带最近很火的干细胞诱导因子质粒的消息，哇咔咔）。其它功能大家各取所需，希望能对诸位的工作有所帮助~~

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方法一：如何查找质粒图谱。

最好的图谱就是NCBI和公司里提供的了，

第一步去NCBI查找，一般常用质粒都有了。然后以.db格式下载，再用Invitrogen的VectorNTI打开，就能得到一张很好的质粒图。

如果找不到，就去google，(baidu上比较不准)，最好加个pdf，找到公司的质粒介绍，那种图也不错。

如果还是找不到，就在google，baidu上查质粒的序列，把序列输入Invitrogen的VectorNTI，能够得到类似酶切的图谱，凑合着用吧，如果有序列信息，再自己添加也一样。

我就是这么查的，相信大家用的多数都是常用序列，查起来应该不难

方法二：
1.Vectorpedia： 输入质粒骨架，直接查询，非常方便;
http://www.addgene.org/pgvec1?f=v&cmd=listvecinfo

2. google
检索式子：质粒名 ＋ map
质粒名 ＋sequence ＋filetype:txt or filetype:pdf
或者：进入google，点击"图片搜索"，直接查找图谱.

3.google scholar: http://scholar.google.com/
有些质粒是经过改造的，所以通过上述方法不能查询到相应信息。这时，可以在google scholar中输入质粒名称，可以直观地看哪些学者在何文章中使用了该质粒，从而可了解到质粒的来源;或者籍此向作者咨询或索取。

4.尝试从各大生物公司，例如invitrogen网站查询.

5. 这个网站收录了大量图谱：
http://www.embl-hamburg.de/~geer ... _vectors/table.html

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1.Vectorpedia： 输入质粒骨架，直接查询，非常方便;

http://www.addgene.org/pgvec1?f=v&cmd=listvecinfo

2. google

检索式子：质粒名 ＋ map

质粒名 ＋sequence ＋filetype:txt or filetype:pdf

或者：进入google，点击"图片搜索"，直接查找图谱。

3.google scholar: http://scholar.google.com/

有些质粒是经过改造的，所以通过上述方法不能查询到相应信息。这时，可以在google scholar中输入质粒名称，可以直观地看哪些学者在何文章中使用了该质粒，从而可了解到质粒的来源;或者籍此向作者咨询或索取。

4.尝试从各大生物公司，例如invitrogen网站查询。

5. 这个网站收录了大量图谱：

http://www.embl-hamburg.de/~geerlof/webPP/vectordb/bact_vectors/table.html