一、《神农本草经》
春秋战国时期，临床中医学的迅速发展使临床药物学知识不断积累，至秦汉，国家得到了统一，医药学本身的发展也要求对药物学进行一次全面而系统的总结，《神农本草经》遂应需而生。该书为秦汉以来多位医药学家不断搜集整理，由政府征集，大约至东汉初年成书。全书载药365种，依据药物功效不同分为上、中、下三品，系统、全面、可靠地总结了秦汉以前医学界和民间的用药经验，是我国现存最早的一部药学经典专著，成为魏晋以下历代研究本草学的必备参考书和经典钻研对象。本书辑选尚志钧、尚元胜校注《中医八大经典全注·神农本草经》（北京：华夏出版社，1994年7月）中有关内容，但对一些神仙、道教思想内容，如“紫苏……久服轻身不老，延年神仙”之类进行了删减。
二、《名医别录》
梁·陶弘景撰写了《本草经集注》，该书在《神农本草经》基础上新增补药物三百余种，结合《神农本草经》原有药物，共计七百三十作种，广泛收集了汉魏晋以来诸名医在多种《神农本草经》传本中新增药物及（或）新的临床功效。多部早已失传的汉晋时期本草学名著，如的华佗弟子吴普、李当之的《吴普本草》、《李当之药录》中（部分）内容即可见诸本书。陶氏将其全面收集整理，名之曰《名医别录》。该书以其疗效确切、内容丰富的价值挤身于经典著作之列，仅次于《神农本草经》，对后世影响广泛而深远。本书辑录了由尚志钧辑校《名医别录（辑校本）》（北京：人民卫生出版社，1996年6月）中人关药物及论述。限于篇幅，对临床功效以外的内容适当进行了节删。
三、《药性论》
唐·甄权著。甄氏为隋末唐初人，曾仕隋，至唐太宗时年已一百二十岁，以医药名世。该书注重结合临床实际议论药物性味主治，所论甚详，尤以君、臣、佐、使、使用禁忌等资料收罗较多，并多举方剂印证，对临床指导很大，对后世药学家及临床家都有较深刻影响。
四、《唐新修本草》
唐·苏敬、李勣等编篡。唐代国力强盛，经济、文化发达，此时期出现了不少新药、外来药。加之陶弘景《本草经集注》时值南北分裂，对北方药物载录不全，政府遂命苏敬等修订本草，历经2年修成。本书对唐以前本草进行总结修订，并以图文并茂方式开创了本草著作先河。因该书为首次由政府组织颁行的药学专著，故成为我国乃至全世界上第一部药典，对当时国内外医药学界影响较广。流传近三百六十余年，至宋开宝年间，北宋政府以此为基础修篡《开宝本草》，从此《新修本草》便销声匿迹。本书以尚志钧辑复《唐新修本草》和其辑复的《开宝本草》作了详细对照，发现《新修本草》内容及原文基本被《开宝本草》所涵盖，考虑到重复，所以只选《开宝本草》辑录之。
五、《本草拾遗》
唐·陈藏器撰。陈氏鉴于《唐新修本草》多有遗漏和纷乱，遂将遗漏药物收集起来名为《拾遗》，又将纷乱的药物以详审和辨解，称为《解纷》，总名为《本草拾遗》。本书共收载大多来自民间的《新修本草》所漏载药物692种，并根据临床实践将药物分为十类，即后世所谓“十剂”：宣，通，补，泄，轻，重，滑，涩，燥，湿，大大丰富了方剂学治方法则，为后世按性效分类药物提供了启蒙，以至唐宋诸家本草名著，如《海药本草》、《开宝本草》、《证类本草》等都有援引本书资料。本书堪称唐代私人本草著作中翘楚，李时珍评本书：“藏器著述，博极群书，精考物类，订绳谬误，搜罗幽隐，自本草以来一人而已。”本书选录为由尚志钧辑校《本草拾遗》（安徽：皖南医学院科研科，1983年10月）有关内容。
六、《海药本草》
唐末五代·李珣所著。唐代是我国封建王朝较为繁盛的历史时期，陆海贸易、文交流频繁，从而出现了不少从海外传入或从海外移植南方的药物，以香料药物居多。李珣是定居中国的阿拉伯药商后裔，家世以售卖香药为业，故李珣很早就对香味药比较熟悉，广泛搜集此类药物，又因其人擅长文学，所以最终写成《海药本草》，重点论述了香味药物的功能和应用，是唐末五代著名的地方性本草，在本草学史中独具特色。
七、《日华子本草》
目前比较确凿的证据可以证明，本书约成书于唐末五代吴越天宝年间。有学者认为作者姓大名明，号日华子，但后世因证据不足，多倾向于姓氏不详。全书共20卷，载药600余种，对药物性味进行了较新颍、详细的论述，并将药性分为温、暖、热、凉、冷、平六类，并对某些药提出一些新的药性。该书总结了唐末及五代时期的药物学成就，记载功用切于实效，作为一部民间本草名著，与陈藏器的《本草拾遗》齐名，对后世本草学，尤其宋代本草学的继续发展奠定了一定的基础。本书辑录尚志钧辑校《日华子本草》（安徽：皖南医学院科研科，1983年月10月）有关内容。
八、《开宝本草》
宋开宝六年，宋太祖诏命刘翰、马志（道士）等九人在《唐新修本草》和《蜀本草》基础上，参考《本草拾遗》，重修本草，最后经卢多逊等定稿，修成《开宝新详定本草》，次年又经李勣等重校，定名为《开宝重定本草》，简称为《开宝本草》。体例基本沿袭《新修本草》，新增133种，共载药983种，新增大多为当时名医常用的有效药。由于印刷术的发明和推广，本书一改以前手抄本草以流传的方法，改为雕版印刷，使中国药典性本草有了第一个印刷刊本。
九、《本草图经》
北宋·苏颂编。北宋中叶，宋廷沿令全国各州郡征集本地区所产药材标本及实物图，并收集功用，经苏颂等人于1061年编成《本草图经》，载药780种，并绘药图933幅，把辨药和用药结合起来。该书重点讨论药物来源和鉴别，药性讨论虽非每药必有，但所论药性逻辑说理性很强，对后世本草图谱绘制、识药、用药都有一定的参考意义。
十、《本草衍义》
北宋·寇宗奭撰。寇氏认为，医家临证，全凭熟解药理，而《唐新修本草》、宋《开宝本草》、《嘉祐补注本草》及《图经本草》诸书又显不足。于是，寇氏对以上诸家本草进行了详尽的辩证考释，并结合自己丰富的医药学理论与实践，对其中470余种药物的性味效验进行补充辨释，指出并纠正了前人在论药时的许多疏漏及错误。对后世，尤其金元本草学的发展产生了极大的影响，李东垣、朱丹溪均对此书极力推荐，“本草之学，自此一变”（《日本访书志》清·杨守敬）。本书所选均来自颜正华、常章富、黄幼群所点校《本草衍义》（北京：人民卫生出版社，1990年3月）中有关内容。
十一、《珍珠囊》
金·张元素（洁古）撰。张氏与刘河间同时代，为金元时期易水学派的创始人。该书主要结合《素问》理论，阐述了100种临床常用药物的“气味、阴阳、厚薄、升降、浮沉、补泻、六气、十二经及随证用药之法”，在药物归经、引经报使、脏腑辩证用药等方面作出了突出贡献，对易水学派乃至后世临床的发展产生过指导性作用。但原书已失传，《珍珠囊》书名最早见于元·王好古《汤液本草》中所引用98条“《珍》云”，王氏在序中言“其源出于洁古老人珍珠囊也”。其后元·杜思敬在其《济生拔粹》卷五以《洁古老人珍珠囊》引录全书，共113味，较《汤液本草》所引更具体详实，但条文内容基本一致。故本书所引《珍珠囊》内容基本以《汤液本草》为主。
十二、《药类法象》、《用药心法》
元·李杲（东垣）著。金元时期是中医药学继承和发扬较为辉煌的一个里程碑。作为奠基人之一的李东垣，其脾胃内伤学说以一部《脾胃论》永载医史。李氏善于遣药，创立新方，对后世临床诊疗有极深远的影响，明代医学家王纶在春《明医杂著》中曾有“内伤法东垣”的结论性评价。所以东垣所写《药类法象》、《用药心法》是中医后学必读书目。在易水学派“升降浮沉”，“引经报使”，“气味分经”基础上，前者归纳总结诸药，功效要点之外，比较突出地介绍了药物作用于人体的部位和趋势（如脏腑，经络，三焦及四肢头目等），非常适于临床需要。后者则着重介绍与临床用药制方密切相关的一些机理，且仅被《汤液本草》引录，从书中行文风格看，更象是王好古师事李东垣时整理的东垣用药心传。鉴于此，本书对《汤液本草》中“东垣云”之类言论一并收于此条下，以便读者对东垣药论有一较完整的理解。本书辑录《药类法象》选自天津科学技术出版社·1992年《金元四大家医学全书·药类法象》，《用药心法》及“东垣云”均选自张瑞贤等编著《本草名著集成·汤液本草》（华夏出版社，1998年10月）中有关内容。
十三、《汤液本草》
元·王好古著。本书是一部理论性和实践性都比较强的著作，因作者师承张元素、李东垣两位金元时期的医学巨匠，故尽得两派真传。文中载药242种，主要继承张，李二人学说，并选择结合前代诸名家灼论，最后附以己见，对药性，尤其是药物归经理论给予了特别关注，对金元时期药性理论的继承和发扬做出了不可磨灭的贡献。
十四、《本草发挥》
明·徐彦纯编著。徐氏乃朱丹溪弟子，因而受金元时期各大学派影响较深，除张从正以外，“取张洁古、李东垣、王海藏、朱丹溪、成无已数家之说，合成一书，别无增益”（时珍语）。虽为汇集诸家之说，与《汤液本草》有相似之处，但所引中有不少条文为《汤液本草》所缺漏，故仍为一部研究金元学说的有参考价值的著作，尤其在明初时期医药学界产生过颇深的影响。
十五、《本草衍义补遗》
元·朱丹溪著，明·方广增订。朱丹溪，名震亨，字彦修，元代医学家。探讨内伤杂病证治，首创滋阴降火之法，世称“养阴派”，与刘河间、李东垣、张子和并称为“金元四大家”。本书主要是对寇宗所著《本草衍义》的补充和阐发，主要论药性，且以五行药性为特色。原书药物153种，经方广增订后新增43种，可以认为是丹溪药学的一部代表性著作。李时珍《本草纲目》所引丹溪论述基本出自本书，对研究丹溪理论和临床思想有一定的启发。
十六、《本草蒙筌》
明·陈嘉谟著。本书名“蒙筌”，意在便于初学，但在药性理论上多有阐发，李时珍曾评之为：“间附己意于后，颇有发明，便于初学，名曰‘蒙筌’，诚称其实。”《本草纲目》及后世本草专著多有引述。本书的最显著特色是以形、色、性、味、体五类高度概括药性，重点讨论辩证用药及药性药理，在药性理论上独树一帜。
十七、《本草纲目》
明·李时珍著。明代医药学家李时珍在钻研医药过程中深感前代诸家本草“桀谬差讹，遗漏不可枚数”，立志重编本草。遂“渔猎群书，搜罗百氏”，历经27年，参考800余种文献，以唐慎微《经史证类备急本草》为蓝本，全面总结前人及诸经典著作经验，同时依据作者自己及其父的临床实践进行了转述和发挥，对1892种药物按“从贱至贵”的原则，分为16部，部下分60类，每药标正名为纲，纲下列目，纲目清晰，是当时世界上最先进的药物分类法，详尽记载药性理论的各个方面，兼涉植物学、动物学、矿物学、物理学、天文气象学等诸多自然科学领域，对后世医药学乃至自然科学的发展都有着极其重要的意义。
十八、《药鉴》
明·杜文燮著。本书详细论述了137种常用药物的毒性、性味、阴阳升降、归经、炮制、功能及临床应用等，对气味阴阳论述比较精详，并结合个人经验探讨用药配伍规律，是一部短小实用的药学著作。
十九、《本草经疏》
明·缪希壅著。本书主要为缪氏对《神农本草经》中临床常用的必不可少药物进行注释，分别以“疏”、“主治参互”、“简误”三项论述，专以药性为纲，结合临床用药体会和规律，提出了许多独到见解，对中药药性理论的发展有重要意义。
二十、《雷公炮制药性解》
明·李中梓著。本书载药332种，主要以归经理论阐释药性及功能主治，以归经作为药物功能的主要机制。归经理论又分为据功能主治推论，据性味推论，据脏腑关系及五行归属推论及联系易理推论等多种方法。另外，本书对药物宜忌与药性药效间关系也进行了较深入的讨论，不失为一部独具特色和临床意义的药物学专著。
二十一、《本草乘雅半偈》
明·卢之颐著。半偈，即全文之半。作者曾在其父卢复所著《本草纲目博议》基础上增补撰写成《本草乘雅》，分考、参、衍、断四项，后来书稿因战乱散佚，卢氏凭记忆重写考、参两部分，故名《本草乘雅半偈》。共载药377种，特点是常以儒理、佛理推演药性，从药名、生态方面阐发药理，难免带有一定玄学陋弊，但也不乏真知灼见，于临床有一定参考价值。
二十二、《本草崇原》
清·张志聪著。张氏力主临床应以识药性为第一要义，而非某病对某药，“不探其原，只言其治”，所谓“知其性而用之，则用之有本，神变无方。袭其用而用之，则用之无本，窒碍难通”。论药则从性味到功能主治，均从生成禀受解释，开清代五运六气论药性之先河，在药理著作中独树一帜。
二十三、《本草新编》
清·陈士铎著。本书以药性理论著称，解释药性又多从医理，而陈氏于医理则自成一家，于《黄帝内经》之外，撰成《外经微言》，对《内经》所言医理从不同角度进行阐释和深化，故其人论著多有新见。据陈氏在其多部著作中屡屡提到“晚年逢异人于燕市，传书甚多”之类，经考证此中异人最可能所指为傅青主、傅眉父子。如考据确凿的话，则研习本书不仅可以吸取陈氏辨药论医精微，对于傅青主医学研习者亦不无裨益。
二十四、《本草备要》
清·汪昂著。汪氏以儒通医，精研药理，认为《本草纲目》“备则备矣，未得要也”，于是以《本草纲目》及《本草经疏》为蓝本，结合诸家本草名著，由博返约，辑成本书。选取常用药470余种，按照自然属性分为8类，先介绍主要性味功能，然后注释阐发药理，时有创见，最后介绍产地，炮制及禁忌。论述详细实用，切于临床，故得到广泛流传。
二十五、《本经逢原》
清·张璐著。本书主要内容是论述药性理论，虽然全书在结构上稍显凌散无序，但不囿于旧说故闻，以作者的理论和临床体会阐释药理，主要反映其临床见闻及理论思维。诚如作者自言：“因不自揣，聊陈鄙见，略疏《本经》大义，并系诸家治法，庶使学人左右逢原，不逾炎黄绳墨，足以为上工也。”本书作为清初重要理论著作，对后世产生较大的影响。
二十六、《本草经解》
该书署名为清·叶桂著，实为姚球所撰。每药论述分4部分：大字为药名、性味、毒性及功能主治，小字为炮制，另段小字以生成禀受结合性味解释归经以及《本经》主治功能，最后论以该药为主体的配伍组方，对临床用药具有一定意义。本书与《本草崇原》，《神农本草经读》二书曾被郭汝聪合刊为《本草三家合注》，集中反映三家运用五运六气、生成禀受来阐释药性的思维方法。
二十七、《神农本草经百种录》
清·徐大椿著。全书共收《本经》常用药100种，在对每味药物经文的注释中阐述作者的药性观点。徐氏认为药性是用药处方的依据，药性的基础是形（包括气、味、臭、声、轻、重、长、短等）和气（包括时令、盛衰、嗜好等），“凡药之用，或取其气，或取其味，取得其色，或取其形，或取其质，或取其性情，或取其所生之时，或取其所生之地，各以其所偏胜，而即资之疗疾”。故书中所论大多遵照以上所言，论述药性采用多种推理方法，如取类比象（此为作者最常用），一般推理及试验推理等。因本书具有较强的说理性，更由于徐氏本人令人信服的临床水平，本书颇受后学重视。
二十八、《得配本草》
清·严西亭、施澹宁、洪缉菴著。编者在临床过程中，遇疑难之证，“必反复辩论，以故试其药”，因而合篡成书。本书以《本草纲目》为准绳，收载640余种药，分为25部，着重讨论了药与药间的相畏、相恶、相反、相使等作用关系，并结合临床实际较深刻总结了历代配伍经验，可以说是一部配伍遣药组方的专书，对后世临床家产生了不小的影响。另外，本书还将40余种药物列入奇经八脉，对归经理论作出了有益的补充。
二十九、《本草纲目拾遗》
清·赵学敏著。顾名思义，本书原旨在于对《本草纲目》之补充、考订。其所收载多为沿海、江浙、边远及少数民族地区的地方用药，共920余种。每种药物记载内容极为广泛，包括生态、性味、归经、炮制、功能主治等，继承、保存了一大批民间用药种类和经验，不仅补充了《本草纲目》，更对本草学的丰富和充实作出了很大的贡献。
三十、《本草求真》
清·黄宫绣著。本书堪称药学史上理论与实际相结合的典范。作者论药，“既不泥古以薄今，复不厚今以废古，唯求理与病符，药与病对”，从临床实际入手论药性，不枉“求真”之名。内容上又以主要药性作为认识功能、主治的纲领，对药物功能，主张须分阴、阳、气、血，不可混称补泻；对药物归经，强调应分别主入某经和兼入某经；对主要药性，主张气味与形质整体观。总之，本书因其临床实用性受到后学的推崇。
三十一、《神农本草经读》
清·陈修园著。本书为作者所撰《神农本草经注》中选取常用药采编而成。陈氏本人为伤寒大家，提倡遵经仿古，故本书亦为清人遵经本草学派典范。本书论药性常从生成禀受入手，兼及象数之学及归经。更有意义的是并非就药论药，而是结合仲景经方中所用之义论之，可以算作理论与实践相结合，对研习经方者裨益更大。本书与《本草崇原》、《本草经解》二书曾被郭汝聪合刊为《本草三家合注》，集中反映三家运用五运六气、生成禀受来阐释药性的思维方法。
三十二、《本经疏证》
清·邹澍著。本书原针对《本草述》“多引东垣、丹溪、海藏、洁古，而于张长沙、孙真人略焉”，故邹氏“专由《本经》扶发精蕴”，所论药性多随兴而发，推理则论据不一，故在药性理论上多有不足处。但本书贵在理论不脱离实践，广泛结合仲景、孙真人用药组方规律论述药性药理，将药、方、症结合起来，突出实践性和实用性，非一般尊经之作可比。
三十三、《本草分经》
清·姚澜著。本书内容简捷，共载药804味。不分卷，首载内景经络图，次载总药便览，按自然分类列药名及归经，正文以十二经、奇经及命门为纲，脏腑与经络不分，各纲下分出补、和、攻、散、寒、热各类，药名下注明性味功能主治。
三十四、《本草思辨录》
清·周岩著。本书讨论药物性能，着重性味和归经理论的思辨，广泛结合《伤寒论》、《金匮要略》中用药精义及历代名家注解，详加论述，凡有疑义处，均结合临床经验加以分析，提出自己见解，不失为一部研究经方用药的有益参考书。
三十五、《医学衷中参西录》
民国·张锡纯著。张氏为近代中西汇通学派主要代表人物之一。本书所论除少数为引据前人药论外，多为自己的临床心得体会。其中西汇通学术观点，主要认为中医之理多包括西医之理，试图印证中西医理统一。论药时常中、西药并论，临床上常中、西药并用，对药性理解颇有创见。无论其药性理论还是临床应用都很有参考价值，受到后学广泛推崇。
