六根忏悔，是一种包含人类精神整体的忏悔。指的是在向诸佛礼拜忏悔自己的罪过时，特别就眼、耳、鼻、舌、身、意六根一一忏悔罪障。这样的忏悔，能快速减轻身心的苦痛，快速消业、灭罪。
说到六根忏悔，许多忏法中都包含这一内容，以法华忏法最为详尽：
行者先右膝着地，烧香散华，心念改悔，流泪悲泣，然后逐一宣说眼根、耳根、鼻根、舌根、身根、意根等六根忏悔，最后五体投地。
对六根忏悔，《佛说观普贤菩萨行法经》有如下偈言，振聋发聩，非常值得我辈日常念诵，作为修各种法的加行：
若有眼根恶 业障眼不净
但当诵大乘 思念第一义
是名忏悔眼 尽诸不善业
耳根闻乱声 坏乱和合义
由是起狂乱 犹如痴猿猴
但当诵大乘 观法空无相
永尽一切恶 天耳闻十方
鼻根著诸香 随染起诸触
如此狂惑鼻 随染生诸尘
若诵大乘经 观法如实际
永离诸恶业 后世不复生
舌根起五种 恶口不善业
若欲自调顺 应勤修慈心
思法真寂义 无诸分别相
心根如猿猴 无有暂停时
若欲折伏者 当勤诵大乘
念佛大觉身 力无畏所成
身为机关主 如尘随风转
六贼游戏中 自在无罣碍
若欲灭此恶 永离诸尘劳
常处涅槃城 安乐心恬泊
当诵大乘经 念诸菩萨母
无量胜方便 从思实相得
如此等六法 名为六情根
一切业障海 皆从妄想生
若欲忏悔者 端坐念实相
众罪如霜露 慧日能消除
是故应至心 忏悔六情根
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