许多重要的基因。特别是与发育相关的基因，用传统基因敲除技术从胚胎发育一开始就全部去掉这些基因，会引起胚胎致死，使研究难以进行下去。许多基因的表达是具有时空性和细胞类别特异性的。传统基因敲除技术不能控制基因敲除的细胞类型和时空性。条件基因敲除技术的诞生解决了这些问题。Rajewsky实验室首先利用Cre- LoxP点特异性重组系统建立了条件基因敲除技术，这一技术很快得到广泛的推广和应用。目前主要使用的Cre/LoxP和Flp/Frt两种系统。
利用LoxP位点制作的条件性敲除小鼠(图3-10)通过和全身性表达Cre重组酶的转基因或基因敲入Cre小鼠，如EIIa-Cre、Meu-Cre等小鼠交配后即可以获得全身性敲除小鼠。除此以外，还可以利用组织特异性启动子控制Cre重组酶的表达，达到在特定组织、器官控制基因表达的效果。假如利用他莫昔芬诱导的Cre小鼠与利用LoxP位点制作的条件性敲除小鼠交配，如Myh6-MerCreMer小鼠，则可以达到时间控制的特定组织、器官控制特定基因表达的效果。
图3-10 利用LoxP位点制作条件性敲除小鼠图
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