1347年，秃鲁黑帖木儿成为东察合台汗国大汗，扶持他的播鲁只虽然是个权臣，但他比较重视法统，全心全意地辅佐秃鲁黑帖木儿。
作为一个被扶植上位的大汗，秃鲁黑帖木儿可不想一直做一个有名无实的大汗。
但是，播鲁只势力太大，况且有没有弑君自立的意思，那么究竟怎样才能做到大权在握呢？
这时候的中亚，伊斯兰教已经在蒙古人中扎下了根，很多的蒙古贵族和下层蒙古人都皈依了伊斯兰教。
而东察合台汗国统治下的西域地区，佛教还有很大的势力，伊斯兰教对蒙古人的冲击和影响还不像中亚那样大。
在秃鲁黑帖木儿未登上汗位之前，他在阿克苏见到了从成吉思汗时期就被流放到的伊斯兰苏菲教派的传教师-谢赫贾拉里丁和额什丁和卓父子。
在他们的说教下，秃鲁黑帖木儿答应皈依伊斯兰教，但这件事的风险很大，他要求在他登上汗位并掌握最高权力之后，才能公开他入教和举行入教仪式。
秃鲁黑帖木儿登基时，谢赫贾拉里丁已经去世，他的儿子额什丁赶到都城-阿力麻力。
秃鲁黑帖木儿履行了诺言，在1357年由额什丁为他举行了入教仪式，剪长发，行割礼，并取教名-阿布伯里克.默罕默德。
秃鲁黑帖木儿是新疆地区第一个接受伊斯兰教的蒙古可汗。
秃鲁黑帖木儿接受伊斯兰教的一个主要目的就是为了巩固自己的地位，能有与播鲁只相抗衡的实力。
为了迅速壮大以他为核心的这一宗教势力，在额什丁的配合下，他开始在国内强制推行伊斯兰教。
他首先说服王公大臣皈依伊斯兰教，对于不服从者，则派人满族灭门。
在蒙古王公贵族的带领下，东察合台汗国16万帐蒙古人皈依伊斯兰教。
然后，他又派额什丁前往库车传教，以可汗的名义号召人民信仰伊斯兰教。
在秃鲁黑帖木儿的支持下，对于不改宗的佛教徒，基督徒，伊斯兰教团对他们残酷屠杀，对于不肯皈依者，伊斯兰教徒们把铁马掌钉入他们的脑袋。
这是察合台汗国蒙古人信仰伊斯兰教之始，其后代逐步融入到维吾尔人当中。
秃鲁黑帖木儿死后，其子-也里斯牙火者即位。
也里牙斯火者是被帖木儿从河中打回去的，所以他一即位，就发动了复仇之战。
1365年，在锡尔河北岸的塔什干和钦纳兹之间与帖木儿展开激战。
就在双方开战时，突然天降大雨，战场一片泥泞。
帖木儿没想到会有大雨，军队没有准备，战马的马腹都紧贴在泥泞中，以至于被湿气一熏，显得瘦骨嶙峋。
士兵箭杆上的羽毛也脱落了，箭管也滑脱了，衣服和装备淋雨以后变得非常沉重，步骑兵都变得非常沉重。
而也里牙斯火者则有充分的准备，士兵，战马，装备都有很好的防护。
战役以帖木儿大败而告终。
也里牙斯火者乘胜追击占领渴石城。
帖木儿逃往巴里黑重整旗鼓。
巴里牙斯火者攻至撒马尔罕城下，城中之人对也里牙斯火者主政时期的暴虐记忆犹新，深恐再遭其荼毒。
于是城市的军民众志成城，奋勇抵抗，撒马尔罕战役陷入僵局。
战事进行到关键时期，也里牙斯火者营中发生马瘟，战马大批死亡。
无奈之下，也里牙斯火者只得退兵。
他回国不久，就去世了。
他一死，秃鲁黑帖木儿家族便遭了大难。
当年拥立秃鲁黑帖木儿的朵豁剌惕家族族长播鲁只死后，家族便大权旁落，不过在秃鲁黑帖木儿和巴里牙斯火者的强力威慑下，他们不敢擅动。
待巴里牙斯火者一死，播鲁只的四弟札马鲁丁立刻发动政变。
札马鲁丁为人暴戾，生性残忍，在政变中他一举杀死了秃鲁黑帖木儿家族18位成员，几乎将能够
继承汗位的继承人杀光。
随后，札马鲁丁自行称汗。
札马鲁丁的僭位行为遭到了国内很多贵族的反对。
两位贵族忽木札，月即别.帖木儿前往西察合台汗国求援。
西察合台汗国此时是帖木儿当政，他派出副将前往征讨。
札马鲁丁率军迎战，双方未分胜负，札马鲁丁与帖木儿的副将签订了退兵协议。
帖木儿对这个退兵协议非常不满，他立刻率军攻打了赛蓝等地。
1370年，帖木儿帝国建立。
从1375年开始，帖木儿便连年攻打札马鲁丁。
1389年，战败的札马鲁丁在撤退过程中患了水肿症，身体极为虚弱，部下把他放在一片密林中，身边有两个妃子照顾他。
不过从此以后，就再也没有了札马鲁丁的消息，他就这样从大地上消失了。
东察合台汗国汗位空了，另立新汗成了当务之急。
就在众人面面相觑之时，时任朵剌豁惕家族族长的忽答歹站了出来，告诉大家，想让汗国稳定，必须是察合台家族的人即位。
察合台家族的人不是被杀光了吗？
正在大家满腹狐疑时，忽答歹不慌不忙地从身后拉过来一个年轻人，告诉大家这个年轻人叫黑的儿火者，是秃鲁黑帖木儿汗在世的唯一儿子。
原来，忽答歹是秃鲁黑帖木儿册封的朵剌豁惕家族的族长，但是被叔叔札马鲁丁夺了权力。
在札马鲁丁大肆残杀秃鲁黑帖木儿家族成员时，秃鲁黑帖木儿有一个尚在襁褓中的婴儿，于是他和婴儿的母亲便把孩子保护起来，隐姓埋名。
这个孩子便是黑的儿火者。
札马鲁丁生死不知，忽答歹便将黑的儿火者立为东察合台汗国可汗。
黑的儿火者即位后，封忽答歹为“兀鲁斯别吉”即“国家首领”也就是宰相和最高军事长官。
二人齐心合力欲振兴衰败的东察合台汗国。
也就是黑的儿火者即位的同一年，帖木儿再次进犯，直抵东察合台汗国腹地。
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