晋朝通过李代桃僵代魏顺利开启一代王朝，灭蜀汉、平东吴，一统天下。可也迅速衰败，不到十几年便进入中国历史上最混乱的时期，史称五胡十六国和南北朝时期。晋武帝司马炎崩，晋惠帝即位不久，贾后把持朝政，司马氏八王之乱，晋惠帝崩，晋愍帝即位。公元316年匈奴人刘曜虏晋愍帝，西晋灭亡，中国北方进入五胡乱华、十六国举兵割据称霸一方。五胡十六国为成汉(巴氐李氏)、夏(匈奴赫连氏)、前赵(匈奴刘氏)、后赵(羯族石氏)、前秦(氐族符氏)、后秦(羌族姚氏)、西秦(鲜卑乞伏氏)、前燕(鲜卑慕容氏)、后燕(鲜卑慕容氏)、南燕(鲜卑慕容氏)、北燕(汉族冯氏)、前凉(汉族张氏)、西凉(氐族吕氏)、南凉(鲜卑秃发氏)、北凉(匈奴沮渠氏)等十六国，同时还有汉人冉闵建立的魏。后皆被拓跋氏的北魏所灭。
公元439年到公元581年，北方相继经北魏、东魏、西魏、北齐、北周。
公元317年，晋司马睿建康称帝，东晋建立。公元420年，东晋灭亡，至公元589年，中国南方经宋、齐、梁、陈。
晋武帝时，夫馀频朝贡。此时，鲜卑慕容氏崛起。晋武帝太康六年(公元285年)，鲜卑慕容廆袭破夫馀，其王依虑自杀，子弟走保沃沮。帝免护东夷校尉鲜于婴因其不救，以何龛代之。夫馀后王依罗遣诣何龛，求率见还复国，请援。何龛上列，遣都邮贾沈以兵送之。慕容廆邀之于路，贾沈与战，大败之。罗得复国。而后每为慕容廆掠其种人，卖于中国。太康十年，慕容廆遣使归附，帝授其鲜卑都督。慕容廆死，子元真袭，讨斩叛弟仁于辽东平郭，乃号年为元年，自称燕王。
高句丽位宫玄孙乙弗利，利子钊，烈帝时与慕容氏相攻。建国四年，慕容元真遣使朝贡，伐高丽，入自南陕，战木底，大破钊军，乘胜长驱，遂入丸都，钊单马奔窜。慕容元真掘钊父墓，载其尸，并略其母妻、珍宝、男女五万余口，焚其宫室，毁丸都城而还。钊遣使来朝，阻隔于寇仇，不能自达，后称臣于元真，乃归其父尸，后为百济所杀。
晋孝武太元十年，高句丽攻辽东、玄菟郡。后燕慕容垂遣其弟慕容农伐句丽，复二郡。慕容垂子慕容宝以高句丽安为平州牧、封辽东、带方二国王，为置长史、司马、参军官，后略有辽东郡。
魏世祖时，钊曾孙琏遣使奉表贡方物，请国讳。世祖嘉其诚款，诏其国讳于其国，遣员外散骑侍郎李敖拜琏为都督辽海诸军事、征东将军、领护东夷中郎将、辽东郡开国公、高句丽王。李敖至其所居平壤城，访其方事。辽东南一千余里，东至栅城，南至小海，北至旧夫馀，民户三倍于前魏时。其地东西二千里，南北一千余里。
晋安帝，琏亦遣长史高翼奉表献白马。晋以琏为使持节、都督营州诸军事、征东将军、高句丽王、乐浪公。宋高祖刘裕践祚，诏以琏可征东大将军，持节、都督、王、公如故。三年，加琏散骑常侍，增都督平州诸军事。
时冯文通率众奔之，魏世祖遣使诏琏送文通，琏上书称当与文通俱奉王化，竟不送。世祖怒，欲讨之，乐平王丕等议待后举，世祖乃止，而文通亦寻为琏所杀。
魏后文明太后以显宗六宫未备，敕琏令荐其女。琏奉表，云女已出嫁，求以弟女应旨意，朝廷许焉，乃遣安乐王真、上书李敖等至境送币。琏惑其左右之说，云朝廷昔时与冯氏婚姻，未几而灭其国，殷鉴不远，宜以方便辞之。琏遂上书妄称女死。朝廷疑其诈，又遣使切责，若女审死，听更选宗淑女。琏云:“若天子恕其前罪，谨当奉诏。”会显祖崩乃止。
至高祖时，琏贡献倍前，帝报赐亦稍加。时光州于海中得琏所遣诣萧道成使送阙，高祖诏责琏:“……卿越境外交，远通篡逆，岂是藩臣守节之义！……”
太和十五年，琏死，年百余岁。高祖举哀东郊，遣谒者仆射策赠车骑大将军、太傅、辽东郡开国公、高句丽王，谥曰康。又遣大鸿胪拜琏孙云使持节、都督辽海诸军事、征东将军、领护东夷中郎将、辽东郡开国公、高句丽王，赐衣服车饰，诏云遣世子入朝。云上书乞疾，惟遣其从叔升于随使诣阙。切责之，自此岁常贡献。
正始中，世宗引见其使芮悉弗，悉弗进曰:“高丽系诚天极，累叶纯诚，地产土毛，无衍王贡。但黄金出自夫馀，珂则渉罗所产。今夫馀为勿吉所逐，渉罗为百济所并，国王臣云惟继绝之义，悉迁于境内。二品所以不登王府，实两贼是为。”世宗曰:“高丽世荷上将，专制海外，九夷黠虏，实得征之。瓶爨磬耻，谁之咎也？昔方贡之衍，责在连率。卿宜宣朕旨于卿主，务尽威怀之略，扦披害群，缉宁东裔，使二邑还复旧墟，土毛无失常贡也。”
神龟中，云死，遣使策，拜其世子安为安东将军、领护东夷校尉、辽东郡开国公、高句丽王。正光初，光州又于海中执得梁萧衍所授安宁东将军印绶，送京师。
安死，子延立，孝武帝初，诏加延使持节、散骑常侍、车骑大将军、领护东夷校尉、辽东郡开国公、高句丽王。延死，子成立。讫于武定末，贡使无岁不至。大统十三年，遣使至西魏朝贡。及齐受东魏禅之年，遣使朝齐。齐文宣加成使持节、侍中、骠骑大将军、领东夷校尉、辽东郡公、高丽王如故。天宝三年，文宣至营州使崔柳使高丽，求魏末流人。敕令崔柳曰:“若不从者，以便宜从事。”及至，不见许。崔柳张目叱之，拳击成坠落床下，成左右雀息不敢动，乃谢服，崔柳以五千户返命。
成死，子汤立。乾明元年，齐废帝以汤为使持节、领东夷校尉、辽东郡公、高丽王。周建德六年，汤遣使至周，武帝以汤为上开府仪同大将军、辽东郡公、辽东王。
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