前因
西藏发生内乱：1705年，桑杰嘉措（执掌西藏政务者）与拉藏汗（保护西藏的蒙古贵族头领）产生矛盾。桑杰嘉措被杀，他扶立的六世达赖（仓央嘉措），被拉藏汗斥为假冒，并强行罢黜。拉藏汗此举引起西藏僧众不满，统治岌岌可危。
详细经过：
1717年，准噶尔汗国（今新疆地区）大汗策妄阿拉布坦派军侵入西藏，西藏最高统治者拉藏汗被杀。准军占领西藏两年多，直到1720年康熙派清军将其驱逐。
准噶尔汗国为噶尔丹所建，策妄阿拉布坦是噶尔丹的侄子。策妄阿拉布坦趁噶尔丹出兵漠北喀尔喀蒙古（今蒙古国地区）之机，发兵占领准噶尔大部领土，将噶尔丹遏制在漠北无法西还。然后他联合清政府，击败噶尔丹，掌控准噶尔汗国。
▲准噶尔和清政府示意图
策妄阿拉布坦统治下的准噶尔并不安分。在北方，他长期侵扰喀尔喀蒙古，向南则觊觎西藏。但漠北喀尔喀自从施行盟旗制度后，战斗力增强，又因为复杂的姻亲关系，对清朝忠心耿耿，策妄阿拉布坦占不到太大便宜。
但西藏却不似漠北稳定，爆发内乱，这给了策妄阿拉布坦下手的机会。
当时的西藏，控制在蒙古和硕特部贵族手中，头领固始汗把政教事务，交给格鲁派掌教五世达赖。而五世达赖，又授权桑结嘉措替他处理日常事务。
五世达赖去世后，桑结嘉措怕蒙古贵族（当时的头领是固始汗的曾孙，拉藏汗）收回他的权力，就隐瞒达赖去世的消息。他一方面找到五世达赖的转世灵童（即六世达赖仓央嘉措），偷偷抚养，一方面将达赖遗体藏在灵塔中，对外假称达赖闭关修法，同时仍以五世达赖的名义发号施令。比如，他假借五世达赖的名头，向清政府请求封自己为藏王。清政府不明真相，应允了他的请求。
▲仓央嘉措
有了“御封”藏王的身份，后来五世达赖去世的消息曝光，桑结嘉措就有权拥立六世达赖（仓央嘉措），继续执掌西藏政务。清政府对西藏没有实际掌控，又不愿伤害西藏人的感情，对桑结嘉措的行为，只谴责了几句，就默然接受了。
但桑结嘉措担心拉藏汗容不下自己，就先下手为强，买通拉藏汗手下，企图将他毒死。拉藏汉察觉后，捕杀桑结嘉措，收回西藏执政权。然后他上书清政府，说桑结嘉措拥立的六世达赖酗酒好色，是假冒的。清政府也对桑结嘉措隐瞒五世达赖死讯的事不满，准许拉藏汗废黜仓央嘉措，拥立新达赖。
但西藏的僧众们，早就希望清除蒙古贵族，由西藏人自己掌权，所以大都支持桑结嘉措，反对拉藏汉。拉藏汗处死桑结嘉措就已犯了众怒，他又宣称六世达赖是假冒的，炮轰甘丹寺，抢出仓央嘉措，打算送往北京让清政府处置。仓央嘉措在赴京途中死亡，西藏僧众极度仇恨拉藏汗，但迫于其武力，只能暂时隐忍。
▲策妄阿拉布坦
这种情况，让策妄阿拉布坦看到了机会，他先是派使团入藏，想迎请仓央嘉措到准噶尔，妄图据此号召蒙藏两地民众。但他晚了一步，仓央嘉措已被送往北京。策妄阿拉布坦又派使节到青海，游说那里的蒙古派系，一起进攻西藏。清政府觉察到他的异动，派重兵把守青海的入藏路线。
策妄阿拉布坦无奈，只好避开青海路线，从新疆直接南下，经阿里入藏。这条路多是山地和荒漠，崎岖难行，6000人的准噶尔军队，1616年出发，一年后才到达西藏。
拉藏汉其实有万余人马，迎击孤军深入的准噶尔军，本不是难事。但拉藏汗不得人心，再加上策妄阿拉布坦为瓦解藏军，命前线将军编造谎言，说仓央嘉措已经转世投胎，准军是奉转世灵童的旨意入藏的，而另一支准噶尔军队，将护送灵童随后赶到。
▲拉藏汗
拉藏汉手下将领纷纷倒戈，西藏年轻人也加入准军作战，拉萨的僧人们，私下跟准噶尔军队联络，给他们提供粮食和武器。拉藏汗众叛亲离，最后战死。至此，蒙古贵族对西藏的控制彻底得以终结。
准噶尔军队占领西藏后，组建临时政府进行统治。但他们护送灵童入藏的诺言并没兑现，所以很快失去西藏寺院的信任。双方矛盾渐深，准军破坏寺庙，杀死僧侣，暴行不止。
因为策妄阿拉布坦选择从阿里入藏，阿里偏僻，躲开了清军的侦察。所以直到拉藏汗战死，清政府才收到准噶尔入藏的确切消息。
康熙分别于1618和1620年派两批清军入藏，受准军压迫的西藏人民，以及蛰伏的拉藏汗旧部，不但给清军提供军报和粮草，还协同伏击准军。准噶尔军寡不敌众，潜逃回自己的部落，最后只剩下500人。
准噶尔对西藏的侵犯，以失败而告终。
后果
康熙派清军入藏：1720年，康熙派清军入藏，驱逐入侵的准噶尔军，这是中原王朝直接控制西藏的开始。
结论：准噶尔军虽然趁内乱占领西藏，但仅两年多就被清军驱逐。然后，清政府帮助西藏建立行政体制，开始加强对西藏的管理。
【参考文献】：《蒙古族通史》
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