藏医诊脉的部位，与中医相似，但略有差异。中医诊脉以腕后桡骨头茎突出处为“关”，关之掌侧为“寸”，关之肘侧为“尺”，三个部位顺序以食指、中指、无名指按寸关尺。藏医诊脉也有冲、甘、恰之分，也用食、中、无名三个指头分别按诊冲、甘、恰三部，但藏医的寸，位于腕后第一横纹一寸之处，藏医以大姆指末节的长度为一寸。因此，藏医的诊脉部位较中医略偏向肘窝部，这是二者差异所在。
另外，中医是先诊一侧之后，再诊另一侧之脉，藏医有时同时以左右双手诊患者双侧之脉。对于危重病人的生死预后，藏医在足背部的跌阳脉诊断，因为足脉与心脏距离最远，临死前脉先从边远之处收束。藏医按脉轻重，与汉族医学也有不同之处。汉族中医诊脉时，三指同时用力，分浮、中、沉三种力量切脉，藏医虽也有轻、中、重之分，但却是指候冲脉处应轻按，候甘脉处应中按，而候恰脉处则需重按。藏医认为，脉象可以反映人体脏腑的状态。就性别而言，藏医诊男性之脉以其左手之脉为准，用医生右手三指诊切；女性患者则用右手就诊，医生以左手三指切脉。再诊另一只手的脉作为参考。
