PMseq报告中相对丰度是什么指标，应该怎么看？

什么是相对丰度？

PMseq报告中，相对丰度指检测出列的最低层级的微生物，在同类微生物（细菌/真菌/病毒/寄生虫）中所占百分比。相对丰度是一个相对指标，数值越大表示该微生物含量越高，对临床病原微生物判断具有一定的指导意义。

检出微生物的相对丰度与其检出序列数和基因组大小相关；序列数越高，基因组越小，相对丰度越高。同时也会受标本中背景微生物丰度影响，需综合进行判断。

PMseq报告中同类微生物范围指什么？

细菌大类：含细菌、结核分枝杆菌复合群、支原体/衣原体/立克次体和疑似背景微生物中的细菌；

真菌大类：含真菌和疑似背景微生物中的真菌；

病毒大类：含DNA和RNA病毒（注：DR共检产品中DNA和RNA病毒为分别单独统计）；

寄生虫大类：含寄生虫。

报告相对丰度可能检出情况

1

同类检出病原体列表中，相对丰度加和为100%，表示检出的病原体即为所有同类病原，且均符合解读出列规则（见报告1 病毒大类检出相对丰度）。

报告1

2

同类检出病原体列表中，相对丰度加和小于100%，表示检出很多病原，但是符合解读出列规则的只有列出的部分病原体（见报告2 细菌大类检出相对丰度）。

报告2

3

同类检出病原体列表中，相对丰度高，但检出序列数少，是因为相对丰度除了跟检出序列数相关外，还与病原基因组大小有关。检出序列少，基因组小的物种相对丰度，可能比检出序列数高，基因组大的物种相对丰度高（见报告3 DNA病毒检出相对丰度）。

报告3

4

同类检出病原体列表中，疑似背景微生物相对丰度高于正式检出，可能与标本采集有关，不排除背景微生物引起感染的可能（见报告4 细菌大类检出相对丰度）。

报告4

5

同类检出病原体列表中，PMseq DR共检的DNA和RNA病毒为分别单独统计相对丰度（见报告5  PMseq DR共检病毒检出相对丰度）。

报告5