我从一下几个方面分析:
没有副部级高校，只有中管干部高校
中管干部高校的校领导(正副职)级别(清华大学)
中管干部高校的校领导认命方式(副部级认命方式，厅级干部认命方式，清华大学为例子)
目前的中管干部高校(31所)
中管干部高校被定位为为中管干部的时间次序。
这些995高校的排行情况(985签约时间)
目前国内实力排行。
行政级别利弊。
图片来源网络
没有副部级高校，只有中管干部高校
首先浙江秦学教育老师再说一遍：没有副部级高校的说法。这些高校具体应该叫中管干部高校 ，不是中管高校。你去任何一个高校的官方介绍里面绝对不会出现副部级高校的字眼。
注意字眼：中管高校意思高校是副部级。如果是中管干部高校，那只有干部是副部级。
何谓“中管干部”?简单说来，就是名字在中 组部名单上的干部。这个名单叫做《中 共 中 央管理的干部职务名称表》。
与之相对应的，还有“省管干部”、“市管干部”等说法。 中管干部一般是省部级及以上级别，但是，中管干部的范围要比省部级干部还大一些，个别正厅级干部也被纳入了中管干部的行列。不过高校的中管干部目前都是副部级，政 府里面某些中管干部是厅/级
虽然学校领导是副部级，但是学校是正局/级编制，就是正厅级。中国的公办本院校都是正厅级或者副厅级。
看西北农林科技大学的批示
中管干部高校的校领导(正副职)级别(清华大学为例子)
中管干部高校，就以清华大学为例子。
清华大学校领导包括:校长、书记、常务副校长、副 书 记、常 务副 书/记、副校长，副书 记、纪 委 书 记。
其中校长、书 记是副部级长级;
而常务副书 记，常务副校长是正厅级;
其他副校长，副 书记都是副厅级。
如果单位真是副 部 级的的话。单位副职最低级别是正厅，不可能是副厅的。
中管干部高校的校领导认命方式(副 部 级认命方式，厅级干部认命方式)
副部长级干部由北京直接认命。
一般有中组部领导，教育部领导(高校上级)，地方政 府领导(地方共建)，三方同时出席。
比如清华大学校长认命，就由中 组 部领导，教育 部 部 长，北京市组 织 部长。
正厅副厅校领导认命
厅级干部认命由教育部直接文任命。
当然任命前，教育部会和北京市事先通气，达成一致后才发文，注意：副校长校长没有特殊标注都为副厅级。
这些中管干部高校因为毕竟特殊，只要是这个学校的领导，就给予副部级配置。这一点和中国的北京上海重庆一样，虽然是省级单位，但是领导都按照副国级配置，但是不代表这三个城市是副国级城市。
另外也有些地方高校是厅级高校，但是领导也经常是副部级干部，比如郑州大学校长，一般都是政/协/副主席，也是副部级干部。但是这个和个人关系比较大。
目前的中管干部高校名单
这里面高校分为基本是三个部委高校
工信部所属院校:哈尔滨工业大学 ，北理工 北航，西工大
中科院所属院校:中国科学技术大学
其他都是教育部直属院校
中管干部高校确定时间次序
1992年，中 央指定了14所书 记、校长职务由 中 央 管理的中 管 干部高校:
分别是北京大学、清华大学、中国人民大学、北京师范大学、北京理工大学、北京航空航天大学、中国农业大学、北京医科大学(2000年4月3日，与北京大学正式合并)、中国科学技术大学、复旦大学、上海交通大学、西安交通大学、哈尔滨工业大学、西北工业大学。
2000年确定7所，名单:
浙江大学、南开大学、天津大学、南京大学、武汉大学、四川大学、中山大学
2003年确定11所，名单:
吉林大学、中南大学、厦门大学、大连理工大学、山东大学、同济大学、西北农林科技大学、华中科技大学、东南大学、重庆大学、兰州大学等11所高校。
这些院校实力如何，最重要的就是看985签约时间。。
首批98年五月是清华北大。
第二批签约院校是西北农林科技大学，华东师范大学，国/防/科技大学，中//央/民/族/大学
目前实力排行情况。
西北农林科技大学目前实力比较落后。
在双一流建设中。东北大学，湖南大学西北农林科技大学被列为b类。
高校行政化弊端。
中国就喜欢这一套，说是去除行政化，喜欢当官已经记忆深刻，到骨子里，这是中华民族的一个传传统，不单单是高校，就中高中，小学校长都有行政级别，一般县里的重点高校校长级别都是副处级(副县级)
高校行政化的加强,都喜欢当校长，院长，系主任。没人喜欢安心当教授。
因为领导权利太大。两院院士候选人99%都是高校的副校长/院长/系主任。。。
高校都是公办高校，所以 行 政 级别。依然存在，尤其以中 管 干部这个模式来管理教育。
就应该没有什么别的，可能还有一定的好处，至于什么好处吗?比如中/管/干部，高校和当地政府对接，一般是和省里直接会话，可以最大限度的从得到地方是不少的财力物力支持。
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