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将Dicom格式转换为Nifti文件-方法1

我们要做影像资料后处理分析,需要最常用到的软件是freesurfer、3D Slicer、spm12,但是他们不能直接处理标准dicom格式的文件,因此我们需要把dicom文件转换成NIFTI格式(analyze格式)。有多种方法可以将Dicom格式转换为Nifti文件,今天为大家介绍一种比较简单的方法。PET,MR,CT等数据都可以用这种方法处理。

一、程序准备:

  • 需要软件:MRICRON

  • 下载地址: https://people.cas.sc.edu/rorden/mricron/index.html

  • 安装方法:解压后即可使用,无需安装

  • 注意事项:请选择与自己电脑操作系统对应的版本 

二、操作方法:

  1. 准备好需要转换的dicom文件夹,

  2. 打开MRICRON文件夹下的dcm2niigui.exe程序,

  3. 将dicom文件夹拖入dcm2niigui界面,或者也可以把dicom文件夹下的一个图像拖入dcm2niigui界面,

  4. 几秒钟后即可获得Nifti格式的文件

  5. 如果文件夹里有多个序列的图像,软件会自动区分,生成多个Nifti文件

操作视频,请全屏观看

三、小提示:

  1. dcm2niigui.exe程序图示

  1. 建议大家选择SPM8这个nifti格式

  1. 如果是处理DTI文件,请选择FSL/SPM8这个nifti格式

  1. 程序可以设置输出nifit格式文件的文件名

  1. 若文件夹下包含多个dicom文件,也可以一起拖入,可以同时处理多个文件

  1. 转换完成后请务必确认图像无误


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