Nature子刊：纳米技术干预菌群以治疗癌症（综述）
Nature Nanotechnology[IF:33.407]
① 肠道细菌可通过多种方式诱发癌变：幽门螺旋杆菌的IV型分泌系统、具核梭杆菌粘附上皮细胞促进致癌性炎症应答、大肠杆菌引发的炎症改变菌群组成；② 纳米微粒的表面修饰、药物封装和控制释放、改变纳米微粒的物理性质等纳米技术，可用于癌症治疗中的菌群干预；③ 例如：封装了抗菌药物的纳米微粒可杀伤肿瘤相关细菌，封装了益生元的纳米微粒可促进抗肿瘤共生细菌的增殖；④ 利用纳米微粒可在肠道、血管及肿瘤微环境中干预菌群信号及代谢产物。
【主编推荐语】越来越多的研究报道了菌群在癌症发生中的重要作用，癌症治疗中的菌群干预开始受到广泛关注。Nature Nanotechnology上发表的一篇综述文章，详细介绍了在癌症治疗中，利用纳米技术调控菌群的相关研究进展，以及相关技术的潜在挑战与机会。（@szx）
Nanotechnology intervention of the microbiome for cancer therapy2019-12-04, doi:10.1038/s41565-019-0589-5
清华团队：揭示结直肠癌转移的机制
Cell Research[IF:17.848]
① 对比原发性结直肠癌与肝转移性结直肠癌的临床样本、PDX模型及细胞系中的基因表达谱；② 发现肝转移性结直肠肿瘤表现出肝脏特异性基因表达特征，同时失去了结肠特异性基因表达特征；③ 表观遗传修饰的重编程驱动了结直肠肿瘤的定向转录重编程；④ 在肝转移性结直肠肿瘤细胞中，肝脏特异性转录因子FOXA2及HNF1A与重编程后获得的增强子结合，以诱导肝脏特异基因的表达，从而促进结直肠癌的肝脏转移。
【主编推荐语】肿瘤转移的复杂机制尚未完全明确。来自清华大学的王栋团队与鲁志团队在Cell Research上发表的一项最新研究，通过对比分析原发性及转移性结直肠癌的临床样本、PDX模型及细胞系中的基因表达，发现在肝转移性结直肠肿瘤细胞中，表观遗传组的变化驱动了转录重编程，导致肝脏特异性基因的表达，从而促进结直肠肿瘤的肝脏转移。（@szx）
Tissue-specific transcription reprogramming promotes liver metastasis of colorectal cancer2019-12-04, doi:10.1038/s41422-019-0259-z
如何提高结直肠癌筛查的依从性及质量（综述）
Gastroenterology[IF:19.233]
① 粪便免疫化学测试（FIT）、结肠镜检查、乙状结肠镜检查是常用的结直肠癌筛查方式；② 提高检查依从性的方式包括：提升大众对结直肠癌的意识、引入政府资助的免费项目或将筛查纳入强制保险范围等途径降低筛查费用、主动邀请合格受试者等；③ 提升结直肠癌筛查的质量也非常重要，包括提高病灶检出率、息肉切除率、息肉切除后的监测、FIT的质量控制等；④ 研究者们也在评估一些新的结直肠癌筛查方式，包括：CT结肠造影、多靶点DNA检测等。
【主编推荐语】结直肠癌筛查可有效降低结直肠癌的发生率及死亡率。来自Gastroenterology上发表的一项最新研究，对不同的结直肠癌筛查方式，详细介绍了提升筛查依从性及质量的潜在方法，并讨论了一些潜在的新筛查方式。（@szx）
Optimizing the Quality of Colorectal Cancer Screening Worldwide2019-11-20, doi:10.1053/j.gastro.2019.11.026
国内团队Cell发文：乙肝相关肝细胞癌患者的蛋白基因组学特征
Cell[IF:36.216]
① 收集159例乙肝病毒（HBV）相关肝细胞癌（HCC）患者的配对肿瘤和邻近肝组织，整合分析基因组学、转录组学、蛋白组学、蛋白磷酸化组学数据；② 根据蛋白组学特征将患者分为3个亚群，在代谢及细胞增殖等相关蛋白的表达上有显著差异，表现出不同的遗传特征、预后及潜在治疗靶点等；③ 鉴定出两个预后生物标志物（PYCR2和ADH1A）在不同亚组患者中表达不同，并参与HCC的代谢重组；④ CTNNB1突变相关的ALDOA磷酸化促进HCC细胞的糖酵解代谢和增殖。
【主编推荐语】来自复旦大学中山医院的樊嘉院士团队、中国科学院上海药物研究所的周虎团队及上海生物化学与细胞生物学研究所的高大明团队Cell上发表的一项最新研究，对乙肝相关肝细胞癌患者的基因组学、转录组学、蛋白组学、蛋白磷酸化组学数据进行整合分析，发现基于多组学数据，可将肝癌患者分为3个亚群，不同亚群的患者具有不同的预后情况及潜在治疗靶点。这一研究有望在将来为肝癌的预后判断、分子分型和个性化治疗提供精准指导。（@szx）
Integrated Proteogenomic Characterization of HBV-Related Hepatocellular Carcinoma2019-10-03, doi:10.1016/j.cell.2019.08.052
北京协和医院团队：菌群在胰腺癌中的作用（综述）
Molecular Cancer[IF:10.679]
① 菌群在胰腺癌的发生及发展中发挥关键调节作用：某些细菌可通过激活Wnt、T2R38及TLR等信号通路引发炎症反应，或通过免疫抑制，促进胰腺癌的发生发展；② 菌群对胰腺癌治疗药物的效果可产生影响：某些胰腺癌相关细菌可将化疗药物吉西他滨代谢为非活性化合物，菌群组成影响患者对PD-1单抗治疗的应答；③ 在人体研究中，报道了胰腺癌患者的菌群变化，以及一些与胰腺癌相关的细菌分类群，包括牙龈卟啉单胞菌、幽门螺旋杆菌、念珠菌属等。
【主编推荐语】来自北京协和医院的赵玉沛及张太平团队在Molecular Cancer上发表的一篇综述文章，总结了在胰腺癌患者进行的菌群相关研究，详细介绍了菌群在胰腺癌的发生、发展及治疗中发挥的调节作用，并讨论了将菌群作为胰腺癌诊断标志物、或靶向菌群提高胰腺癌药物疗效的可能。（@szx）
Role of the microbiome in occurrence, development and treatment of pancreatic cancer2019-12-01, doi:10.1186/s12943-019-1103-2
幽门螺杆菌促进胃癌发生发展的机制
Gut[IF:17.943]
① 幽门螺杆菌（Hp）感染可减少转录因子USF1的表达，后者可在基因毒性应激中稳定p53；② USF1和p53表达降低与胃癌患者的预后不良有关，在小鼠中，缺失USF1恶化Hp引起的胃损伤及癌变；③ Hp通过下调USF1和p53，破坏DNA修复功能，加剧喜树碱（CPT）依赖性DNA损伤效应，使胃细胞对CPT引起的基因毒性更加敏感；④ 机制上，在胃细胞中，Hp导致USF1在细胞质和细胞膜附近积累，抑制USF1/p53复合物的形成，并阻止其进入细胞核以抑制其转录功能。
【主编推荐语】幽门螺杆菌是胃癌的主要风险因子之一。来自Gut上发表的一项最新研究，发现在胃癌患者中，转录因子USF1和p53的表达降低与较差的预后相关，而幽门螺杆菌感染可下调USF1及p53，并抑制胃细胞的细胞核中USF1/p53复合物的形成，抑制DNA损伤的修复以促进胃细胞癌变。（@szx）
USF1 defect drives p53 degradation during Helicobacter pylori infection and accelerates gastric carcinogenesis2019-12-10, doi:10.1136/gutjnl-2019-318640
Science子刊：转录因子促进胃肠道癌症中的发育谱系特异性转录
Science advances[IF:12.804]
① 分析胃肠道组织特异性的染色质可及性和基因表达，鉴定出肠道发育过程中对SOX家族的转录因子的动态表观遗传调控；② SOX2维持前胃谱系基因位点的可及性，对胃的特化和区域化是必需的，且在Cdx2缺失条件下可促进前胃/食管转化；③ 在Sox2 high/Sox9 high和Cdx2 high的胃肠道癌症患者中，胃与肠道的发育谱系特异性转录被重新激活；④ Sox2和Sox9在胃发育和癌症中具有潜在的冗余作用，揭示胃肠道转录因子激活的发育谱系转录谱在癌症中的重要性。
【主编推荐语】许多研究表明，癌症中可出现发育谱系特异性转录的重新激活。Science advances上发表的一项最新研究，发现转录因子驱动了胃肠道癌症中的发育谱系特异性转录的重新激活。（@szx）
Gastrointestinal transcription factors drive lineage-specific developmental programs in organ specification and cancer2019-12-11, doi:10.1126/sciadv.aax8898
