朱见深两岁时，万贞儿来到他身边，此时她十九岁，跟他的母亲同岁，从此两人相依相守三十八年。
天顺八年（公元1464年），明英宗朱祁镇病逝，十七岁的皇太子朱见深即位，他心里爱恋着宫女万贞儿，可万贞儿只是一名宫女，她的父亲因为获罪被流放到霸州，而且万贞儿比他大十七岁，与他的生母周太后同岁。迫于礼制，朱见深无法册立万贞儿为皇后，只得册封父亲选出的吴氏为皇后。如果万贞儿生下皇长子，而且被册封为皇太子，或许稍微能弥补朱见深心中的遗憾。
朱见深没想到，吴皇后居然让人把万贞儿捉去杖责，此时万贞儿仍旧只是一名宫女，虽然备受宠爱，可是尚未被册封为妃。万贞儿不是普通的宫女，她是皇帝的心上人，朱见深一怒之下，废掉了吴皇后，另立王氏为皇后。
朱见深盼星星，盼月亮，成化元年，万贞儿终于怀孕了，朱见深高兴地令景德镇制造斗彩鸡缸杯，杯身上面一只公鸡和一只母鸡带着一群小鸡其乐融融地生活在一起，他要把这件礼物送给万贞儿。
朱见深派人到各地祭祀山川，祈求神灵保佑万贞儿母子平安，并且下旨册封万贞儿为贵妃。
成化二年正月，万贞儿为朱见深诞下了皇长子，朱见深大喜过望，可是天不遂人愿，十个月后，这个孩子夭折，从此万贞儿再也没怀孕。
或许，他们的感情从一开始便饱受非议，可是这并未影响朱见深对万贞儿的款款深情。
从天顺八年到成化四年上半年，朱见深的后妃中只有万贞儿一人怀孕，或许在朱见深的内心深处，一直盼望着与万贞儿一生一世一双人，生几个孩子，儿女承欢，一家人幸福地生活在一起。
成化四年下半年，柏贤妃怀孕，朱见深在群臣和太后的劝说下，还是向现实低了头。
成化十二年十月，万贵妃被册封为皇贵妃，在朱见深的后妃之中地位，万贵妃的地位仅次于皇后。
根据《明史》的记载，万贵妃是不折不扣的坏女人，逼迫怀孕妃嫔喝堕胎药、残害皇子，坏事做尽，可是朱见深一共生了十四位皇子，六位公主，三个儿子早夭，长大成年的皇子多达十一个。
与之前的明朝皇帝比较，朱见深成年皇子的数量仅次于朱元璋。朱元璋、朱棣、朱高炽、朱瞻基、朱祁镇分别有二十四位、三位、十位、两位、八位皇子长大成人。
在《明史》的记述中，万贵妃得知孝宗生母纪氏怀孕后，立即派人用药强行堕胎，以至于孝宗的头顶少一块头发，而且说纪氏是万贵妃害死的。
果真如此吗？万贵妃真是这样这个恶毒的女子吗？也许“受害者”明孝宗朱祐樘最有发言权，可是弘治年间编修的《明宪宗实录》却丝毫没有提及这些，这是关于万贵妃的最早史料记载。
根据《明宪宗实录》，万贵妃遭受指责之处有四点。
第一，专宠数十年。比朱见深大十七岁，却独得皇上恩宠，这是万贵妃的错吗？就算万贵妃曾经对朱见深有恩，可是皇帝如果不理她，她又能如何？
第二，日用品和穿着僭越。万贵妃虽然位于妃位之首，可是毕竟比皇后地位低，按当时的礼法规定，有些器物是不能用的。朱见深对她情真意切，千方百计想博得她的欢心，想把世界上最好的东西送给心爱之人，是人之常情。
第三，万贵妃的父兄弟侄被授予都督、指挥、千户、百户等官职，这似乎是明朝的例行做法。
第四，万贵妃罩着汪直等人为非作歹。
也就是说，《明宪宗实录》里面并没有万贵妃强行堕胎、残害皇子和孝宗生母的记录。
根据《明史》的记载，朱祐樘出生后，万贵妃派宦官张敏去加害，张敏觉得皇帝当时还没有儿子，所以不忍心，可是二皇子朱祐极当时尚未去世。
在《明史》的记述中，张敏偷偷抚养朱祐樘六年，因为担心被万贵妃追杀而自尽，实际上，张敏于成化二十一年病逝。
《明史》称万贵妃“饮药伤坠者无数”，谋害皇嗣是原则问题，就算朱见深宠爱万贵妃，周太后和朝廷大臣也不会容许。钱太后去世后，周太后本不想让她与朱祁镇合葬，可是大臣们在文华殿门前一直跪着，直到周太后答应为止。
而且万贵妃已经无法生育，不可能有亲生的儿子继承皇位，万贵妃为什么要阻止别的嫔妃怀孕生子呢？
如果万贵妃曾经谋害朱祐樘母子，那么朱祐樘即位后清算万贵妃的娘家人或许应是大概率事件，然而事实上，朱祐樘并没有这么做。
弘治初年，有的朝廷大臣奏请追废万贵妃的妃号，抄没其家产，毁其坟墓，但是明孝宗朱祐樘没有准许。
朱见深一直深爱着万贞儿，直到她去世。
成化二十三年（公元1487年）正月，万贵妃暴病而逝，时年五十七岁，朱见深痛哭不已，辍朝七日，饱含深情地说：“贞儿已去，朕亦命不久矣”。
这年九月，正值壮年的朱见深郁郁而终，终年四十岁。
