幽门螺杆菌的检测对于消化性溃疡、糜烂性胃炎、胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤、胃的癌前病变等疾病的诊疗具有重要作用。
从标本采集的角度区分，幽门螺杆菌的检查方法可以分为侵入性检查和非侵入性检查两大类。
侵入性检查需通过胃镜获取活组织进行检测，包括胃黏膜组织切片染色镜检、细菌的分离培养和直接涂片、快速尿素酶试验等。其中，组织切片染色镜检、细菌培养、涂片都是对幽门螺杆菌的直接检查，可作为幽门螺杆菌检测的“金标准”，细菌培养也可以同时做药敏试验，指导临床用药。
非侵入性检查指不通过胃镜取活检标本来检测幽门螺杆菌的方法，它包括血清学检测、同位素示踪、粪便抗原检测等。
目前，医院里使用最多的是以下三种方法。
（1）快速尿素酶试验
它属于侵入性检查方法范畴。很多医院在进行胃镜检查的同时，会顺便钳取少量胃窦黏膜组织进行快速尿素酶试验，通过检测尿素酶来判断是否存在幽门螺杆菌感染。快速尿素酶试验特异性高，但敏感性稍差，容易受到外界因素的干扰。
如果病人只是单纯需要检测幽门螺杆菌，而没有胃镜检查指征，不推荐该检测手段。如果患者具有胃镜检查的指征，在完成胃镜检查的同时钳取少量组织进行快速尿素酶试验检测幽门螺杆菌是非常快速和简单的，而且费用便宜。
（2）尿素呼气试验
幽门螺杆菌可以产生大量的尿素酶，尿素酶能分解尿素，产生二氧化碳和氨，二氧化碳被吸收后经肺呼出。口服一定量的被C13或C14标记的尿素后，只需分析呼气中的C13或C14即可判断是否有幽门螺杆菌存在。
C14为放射性同位素，虽然辐射量较小，安全性也较高，但孕妇及儿童仍不宜使用。但因其价格低廉，所以C14尿素呼气试验在基层医院应用比较广泛。C13为稳定性同位素，没有放射性，对孕妇及儿童等特殊人群无禁忌。但C13尿素呼气试验价格昂贵，因此广泛开展受到一定的局限。
尿素呼气试验突出的优点是操作简单快速、无创、无痛苦，能反映“全胃”幽门螺杆菌感染情况。虽然尿素呼气试验有较高的敏感性和特异性，但仍受诸如药物、上消化道出血、胃内其他能产生尿素酶的细菌等因素的影响，可能出现假阴性或假阳性结果。尿素呼气试验是临床上检测幽门螺杆菌感染的重要手段，还适用于体检，也是幽门螺杆菌根除疗效评价的首选方法。
（3）幽门螺杆菌抗体检测
人体在受到幽门螺杆菌感染后会产生相应的抗体，通过抽血的方法检测血清中幽门螺杆菌的抗体水平可以判断是否存在幽门螺杆菌感染。临床上主要是检测幽门螺杆菌的IgG水平。该方法操作简单，只需通过采血检测即可。但是它也存在一些弊端。
首先，从幽门螺杆菌感染人体到人体产生抗体是需要一段较长时间的，如果在幽门螺杆菌感染的初期进行抽血检查，检测结果可能会出现假阴性，从而使患者失去治疗的最佳时机。其次，如果患者曾经感染过幽门螺杆菌，血液里可能存在对应的抗体(就算治愈后抗体也可持续存在很长一段时间)，这种情况下进行抽血检测，会出现假阳性结果。
有的读者可能会问了：既然这种检测容易出现假阴性或假阳性结果，是不是说临床意义不大？不是！临床上如果高度怀疑患者存在幽门螺杆菌感染或者需要排除幽门螺杆菌感染，而常规的快速尿素酶试验和尿素呼气试验都没有阳性提示，此时可以进行幽门螺杆菌抗体检测。因为抗体非常稳定，很少受外界因素的影响，所以如果抗体阳性，就可以证明曾经或现在存在幽门螺杆菌感染。
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